| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 1217417 | 17 (0.110) | 145 (0.970) | 98/254 | 0.4 | 89.5% | coding (90/1524 nt) | ycgG | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 1467910 = | NA (NA) | intergenic (+6/+11) | ydbA/insD1 | pseudogene, autotransporter homolog; interrupted by IS2 and IS30/IS2 transposase TnpB | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CCAGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_tpiA/1217269‑1217417‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > NC_000913_3_pae_tpiA/1467910‑1468057 CCAGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCAT < 1:226813/150‑1 GCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGA > 1:1274750/1‑150 AGCGAATGAATGGCATTTTCAAGTATTAAACCCTTTGGCCGGGAGAAGCAAATGCGCAATAAACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTTAACATCCAGCTCTGATATTCCGCTTGGCTTTtc > 2:771813/1‑148 CGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC < 3:945050/150‑1 TTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:566650/1‑150 TTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 1:52640/150‑1 ATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATGTGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 1:895745/150‑1 TGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG > 2:1507652/1‑150 GTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC < 1:92716/130‑1 GTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC > 2:92716/1‑130 TATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTGGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC < 2:1242827/129‑1 TATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC > 1:1242827/1‑129 ATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACACCTACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGAGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA > 2:528896/1‑150 TAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 2:817316/150‑1 TGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 2:553812/131‑1 GCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAT > 3:16232/1‑150 CCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC > 1:323942/1‑114 CGGGACAAACAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:763672/1‑150 GGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC > 3:715194/1‑150 GACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 1:1507111/150‑1 GACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 3:73635/135‑1 GACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 4:73635/1‑135 GCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG > 4:1078528/1‑150 GCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:1448244/1‑130 GCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 2:1448244/130‑1 GCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT < 4:758136/126‑1 GCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCAT < 1:75479/95‑1 GCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCAT > 2:75479/1‑95 AAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT > 1:359372/1‑150 GCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG < 2:1155213/150‑1 GCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA < 2:566650/150‑1 ACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT > 4:490336/1‑150 ACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT < 1:1591340/150‑1 ACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:1725981/1‑100 ACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCC < 2:1725981/100‑1 ACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGC > 2:1595052/1‑88 TCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCC < 1:246439/150‑1 ATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGT > 1:1738101/1‑150 ATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTC < 1:1618057/146‑1 ATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 2:1290477/1‑113 TACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTG < 3:371269/150‑1 TACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT > 4:16596/1‑132 TACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT < 3:16596/132‑1 ACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 1:1042022/150‑1 ACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATCTCCAGACATCTGTTATCACTTACCCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 3:354804/150‑1 CCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACTTCTGTTACCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCc > 3:1058305/1‑149 CCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG > 2:1476733/1‑150 CCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG > 4:1017270/1‑150 agCCTCGTTGCGATATGCGTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG > 4:2132/3‑150 ATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG > 3:840114/1‑150 ATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT > 2:1793813/1‑103 ATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:1793813/103‑1 ATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 2:25035/91‑1 ATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:25035/1‑91 TCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 2:1110352/1‑150 TCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 2:972908/1‑104 TCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 1:972908/104‑1 CCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG < 2:324804/150‑1 TCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 4:616262/1‑150 TCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 4:184166/1‑150 CGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA < 1:1507652/150‑1 GTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 2:1243791/1‑105 TGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCC > 1:1235338/1‑72 GCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 4:606765/1‑150 GCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 2:1307509/1‑150 CTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 3:171928/1‑150 CTTGTTTATTACCGGGGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATGTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAGTACGGGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGCGGCGAGCGATAGCCCAGCGCACT < 2:72976/150‑1 tTTACCGGTGTCGCTATTTTGCACCTCCACCTCCGGTATGCCGCATGGATTTGCCCCTATTTTTCCAGACCTCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGA < 2:83459/149‑1 ACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGC > 1:1653533/1‑150 ACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:489871/1‑90 ACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA < 2:489871/90‑1 CGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGC < 4:468991/148‑1 GTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCG < 1:60668/150‑1 CGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTT < 3:490336/150‑1 TTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAT > 3:249975/1‑150 TGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCT < 1:125225/150‑1 GAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC > 4:211215/1‑150 GAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 1:1110352/150‑1 GAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC > 2:238512/1‑150 AACATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG < 3:2132/150‑1 ATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 3:1017270/150‑1 ATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA > 2:436892/1‑141 ATCCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA < 1:436892/141‑1 CCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 1:1093565/150‑1 CCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAG > 3:801780/1‑111 CCAGCTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCG < 1:143124/102‑1 CTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA > 3:917719/1‑95 CTCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA < 4:917719/95‑1 TCTGGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 3:513364/1‑58 GGTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA < 2:266592/150‑1 GTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG < 3:1078215/150‑1 GTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG < 4:840114/150‑1 GTATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT > 2:1475339/1‑37 TATTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG > 1:808302/1‑150 TTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTT > 3:952916/1‑150 TTCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCA > 4:1034269/1‑117 TCCGCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTC < 3:1009228/150‑1 GCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > 2:1629172/1‑150 GCATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > 2:1629053/1‑150 CATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 1:83559/1‑150 CCAGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAATACACTCATACCCATCCTCGTTGCGATATGCTTGTTTATTACCGGTGTCGCTATTTTGAACATCCAGCTCTGGTATTCCGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_tpiA/1217269‑1217417‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > NC_000913_3_pae_tpiA/1467910‑1468057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |