| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 2708664 = | 72 (0.910) | 3 (0.040) | 3/274 | NT | 4.1% | coding (91/957 nt) | rseB | anti‑sigma E factor, binds RseA |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 2708700 = | 68 (0.850) | coding (55/957 nt) | rseB | anti‑sigma E factor, binds RseA | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGG > NC_000913_3_pae_tpiA/2708516‑2708811 | cgtgggCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGtaa < 2:1347713/146‑1 (MQ=255) ggCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAAc > 1:992910/1‑149 (MQ=255) catccatTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGcc > 2:1264113/1‑149 (MQ=255) atTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCggc > 2:877338/1‑148 (MQ=255) atTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGa > 1:136396/1‑149 (MQ=255) tttGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGAc > 2:241958/1‑149 (MQ=255) caacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCgg < 2:543106/149‑1 (MQ=255) aacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg > 1:1041291/1‑149 (MQ=255) aacaaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCggg > 1:1071327/1‑149 (MQ=255) aaTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGt > 1:126795/1‑149 (MQ=255) aTTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTg > 2:102053/1‑149 (MQ=255) tgtgCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGc < 1:636629/149‑1 (MQ=255) tgCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACGGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGCAGCGGGAGTGGCCg > 2:510705/1‑149 (MQ=255) cAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGATGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAAAGCCCCGGACGCGGGAGGGGCCGAg > 1:699025/1‑149 (MQ=255) aaGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCCAgg > 2:1390843/1‑149 (MQ=255) agagGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGc < 1:1158751/149‑1 (MQ=255) acccagcaagccgctgtacaggtgccaggaattcaaactttaggaacgcaatcgcagtaatgaagcaactttggtttgccatgtcattagtgacaggtagcctgttattctctgCTAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTa > 2:597434‑M1/115‑149 (MQ=255) ggTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGGCCCGGACGCGGGAGTGGCTGAGGCGTTAGCa > 1:77651/1‑149 (MQ=255) ggTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACCCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCa < 1:1234536/149‑1 (MQ=255) gTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCag > 2:709946/1‑149 (MQ=255) ttATCGCGGCGTGAATGTCGATAACGGCGAGACTCAACACCCTGTTTATTGCTGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGGGACCGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCaga < 2:725104/149‑1 (MQ=255) ttATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCaga > 1:529623/1‑149 (MQ=255) aGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACCCCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATaa < 1:301516/149‑1 (MQ=255) gCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACCCCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACa < 2:570821/149‑1 (MQ=255) gCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACa < 1:662338/149‑1 (MQ=255) gTGCATTTCGATAACGCAGAGACTCAACCCCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAATGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAgg < 2:1237072/149‑1 (MQ=255) tGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGGTGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGGCGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGc > 1:404477/1‑149 (MQ=255) ccATGTCGATAACGCAGAGACTCAACCCCCTGTTTATTGATTCTGATGAATGCCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCt < 1:162567/148‑1 (MQ=255) tCGATAACGCAGAGACGCAGCAACCTGTTTATTGATGCTGATGAATGAAAGCTCGTAATTCAGAGAATGACTGGCCAGGTTCATATGCTATATCAACGACCACGCGACGGGAGGGGGCGCGATCTTAGCAGTAAATAACAGACTagagg > 2:20800/1‑145 (MQ=255) aTAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCa < 1:392088/149‑1 (MQ=255) aCGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTa < 1:186853/149‑1 (MQ=255) cGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTaa < 2:733497/149‑1 (MQ=255) gagaCTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCACAGACTCACACGCTACCTGTCACTAATGAc > 2:428960/1‑149 (MQ=255) agaCTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACa > 2:1331880/1‑149 (MQ=255) cTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATgg < 2:816213/149‑1 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGCCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGACTACCTGTCCCTAATCAccttgc > 2:379851/1‑144 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGGGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACCTGGc > 2:158015/1‑149 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGCGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGc > 2:885989/1‑149 (MQ=255) tCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTCACCCCCCCCCCACATTTGCTGTAGTTGTGTCCCGGCCGCGGGACTGGCCGCTTCGTTAGCAGAGAATCACAGGCTACCTGTCACTACTGACATGGc > 1:1402718/1‑149 (MQ=255) cccTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTGACTAATGACATGGCCACCCa > 2:1383420/1‑149 (MQ=255) cccTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCa > 1:1353303/1‑149 (MQ=255) tttATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCTCTAATGACATGGCAAACCAAAGtt < 1:1412171/149‑1 (MQ=255) tttATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTGATGCAATGGCAAACCAAAggt > 1:874139/1‑147 (MQ=255) tttATCGAGGCTGATGAATGACAGGTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGtt < 1:1180625/149‑1 (MQ=255) ttATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTg < 2:380133/149‑1 (MQ=255) ttGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCtt < 1:1331663/149‑1 (MQ=255) tGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCAtt > 1:644561/1‑149 (MQ=255) tgatgaATGACAGCTCGTAATTCAGTTACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACt < 1:1320328/149‑1 (MQ=255) tgatgaATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAAGGAGCTGGCAAACCAAGGTGGCTTctctcct > 2:401278/1‑143 (MQ=255) atgaatgaCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGc < 2:1041291/149‑1 (MQ=255) tgaatgaCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCg < 2:1144999/149‑1 (MQ=255) tgaatgaCAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCg < 1:376020/149‑1 (MQ=255) gaCAGCTCGTAATTCAGTGACGGGCTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGc < 1:1380950/149‑1 (MQ=255) ggaacGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTGCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGtt > 1:988062/5‑149 (MQ=255) aGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAACGACCTCGAAAACCAAAGTTGCTTCCTTACTGCGATTGCttt > 1:263391/1‑149 (MQ=255) gCTCTTAATTCAGTGACTGGCTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTc < 2:1067541/149‑1 (MQ=255) cTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACGTGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTcc > 2:338214/1‑149 (MQ=255) tCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTTGAGGAACGCCACGGACGCGTGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTcat > 2:1371376/1‑147 (MQ=255) tAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTaaa < 1:1264113/149‑1 (MQ=255) tAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTaaa > 2:447456/1‑149 (MQ=255) ttCAGTGACTGACTGGCCAGGTTTATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGtt < 2:530640/149‑1 (MQ=255) ttCAGTGACTGACTGGCCAGGTTTATCTGCTGTAATAACGCAAAGCTTTCAAGTTTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGtt < 1:1390843/149‑1 (MQ=255) tCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGttt < 2:765742/149‑1 (MQ=255) 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tCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCgg > 1:796121/1‑149 (MQ=255) tCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCgg > 1:132309/1‑149 (MQ=255) gctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCtt < 1:1399978/149‑1 (MQ=255) tgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGc > 1:358842/1‑149 (MQ=255) gTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAATGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCCGCTTGCt < 1:1016217/149‑1 (MQ=255) aataaGGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGATGCGTTAGCATAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTgg < 2:206631/149‑1 (MQ=255) aataaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTgg < 1:536477/149‑1 (MQ=255) aataaCGCCCCCGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTgg < 1:1245567/149‑1 (MQ=255) | CGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGG > NC_000913_3_pae_tpiA/2708516‑2708811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |