| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 1263650 = | 116 (1.110) | 59 (0.580) | 44/276 | 2.9 | 34.0% | intergenic (‑150/‑64) | lolB/hemA | lipoprotein localization factor/glutamyl tRNA reductase |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 1263818 | 116 (1.140) | coding (105/1257 nt) | hemA | glutamyl tRNA reductase | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTC > NC_000913_3_pae_tpiA/1263502‑1263797 | aagcagactaaccctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCt > 2:1010267‑M1/149‑150 (MQ=255)aagcagactaaccctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCt < 1:899093‑M1/2‑1 (MQ=255)aagcagactaaccctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCt < 4:134879‑M1/2‑1 (MQ=255) taatgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAGAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCtt > 4:536802/3‑150 (MQ=255) agcagactaaccctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCtt > 4:503070‑M1/148‑150 (MQ=255) gcagactaaccctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTa < 1:409268‑M1/4‑1 (MQ=255) gatgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTa < 2:279540/150‑1 (MQ=255) atgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTTTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTAc < 3:429441/150‑1 (MQ=255) atgaCAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTAc > 2:1009781/1‑150 (MQ=255) aatgTCCTTGAGATCGGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTTGCTTTACCGTCTGTTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGGATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCAt < 4:658155/147‑1 (MQ=255) taaccctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATc > 2:991734‑M1/141‑150 (MQ=255) aaGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATc > 3:352237/1‑150 (MQ=255) aGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATcc < 1:173027/150‑1 (MQ=255) cctatcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGt > 1:517422‑M1/137‑150 (MQ=255) atcaacgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTatg > 1:995363‑M1/134‑150 (MQ=255) aTACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGc > 3:598923/1‑150 (MQ=255) cgttggtattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCa > 3:258507‑M1/129‑150 (MQ=255) aCGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCaa < 1:97331/150‑1 (MQ=255) cGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAg < 2:348642/150‑1 (MQ=255) tattatttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGa > 1:343775‑M1/123‑150 (MQ=255) gCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGa < 1:59418/150‑1 (MQ=255) ttcccgcagacatgacccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAcc > 4:614469‑M1/117‑150 (MQ=255) ataACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACTCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAcc > 2:1092760/1‑150 (MQ=255) ataACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAcc < 2:364186/150‑1 (MQ=255) tGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGtt < 3:222450/150‑1 (MQ=255) gCTAGCGTTACCGTTCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCCAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTATTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTCTCAACGTTg < 4:322739/150‑1 (MQ=255) acccttttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtaacgccgcgagaacgtgtatcgttttcgccagataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGt < 2:74305‑M1/48‑1 (MQ=255) gCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtat > 4:257304/1‑150 (MQ=255) gCGTTACCGTCCGCTATCGTATATGTTACAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGAAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtct < 4:2391/150‑3 (MQ=255) cctattagcactcggtaccaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatccggcgcttgtcaaccagCCTATACATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtat > 3:688578‑M1/101‑150 (MQ=255) tttagcactcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtattat > 3:101888‑M1/98‑150 (MQ=255) ttACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtattat > 4:220327/1‑150 (MQ=255) ttACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtattat > 1:322644/1‑150 (MQ=255) tACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCANANTCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTnttatt > 1:103251/1‑150 (MQ=255) ccGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatta > 2:426629/1‑146 (MQ=255) ccGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatta < 1:426629/146‑1 (MQ=255) ccGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTc > 4:309645/1‑150 (MQ=255) actcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTatgatg > 3:474291‑M1/92‑111 (MQ=255) actcggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTatgatg < 4:474291‑M1/20‑1 (MQ=255) cggtatcaaccataaaacggcacctgtatcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCACCGGTGGTATTATTTCCCGCAg < 1:412515‑M1/62‑1 (MQ=255) tATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGAc > 1:676147/1‑150 (MQ=255) aTGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCt > 2:985216/1‑150 (MQ=255) tCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTa > 1:738177/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGa < 4:395842/136‑1 (MQ=255) ttAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTa > 3:95101/1‑150 (MQ=255) tAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTAt > 2:638245/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCaa < 3:420464/150‑1 (MQ=255) tcgctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACAt < 3:601532‑M1/66‑1 (MQ=255) cgctgcgagatcgtgtattgtttccgtcggatcagctgggggaggcgttttacagcgagCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAAc > 4:601452‑M1/60‑150 (MQ=255) ctgcgagaacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCa > 1:126274‑M1/58‑150 (MQ=255) ccAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGc > 1:552590/1‑82 (MQ=255) tCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATTAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCATCCATAAAAc < 3:536802/150‑1 (MQ=255) cTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACg > 4:355782/1‑150 (MQ=255) aacgtgtatcgttttcgccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACg > 1:74305‑M1/51‑150 (MQ=255) tAACGTTTTTCTGCAATTACGCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTAATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGGCCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCAAAAAACgg < 2:257251/150‑1 (MQ=255) tAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACgg < 4:274041/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCg < 2:72096/131‑1 (MQ=255) aaCGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGc < 1:507059/150‑1 (MQ=255) aCGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCa < 3:257304/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCt < 1:1100958/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCt < 2:322644/150‑1 (MQ=255) tttCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACAt < 3:658955/108‑1 (MQ=255) tCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCAt > 2:117374/1‑134 (MQ=255) cGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAcc < 2:798382/73‑1 (MQ=255) cGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAcc > 1:798382/1‑73 (MQ=255) gCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatta > 2:127518/1‑89 (MQ=255) cAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCt < 1:82339/150‑1 (MQ=255) gccggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGc < 3:642569‑M1/116‑1 (MQ=255) aTTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGc > 3:181108/1‑150 (MQ=255) ggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCGCTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCgag < 1:535184‑M1/119‑1 (MQ=255) ggataagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCgag < 2:729149‑M1/119‑1 (MQ=255) tCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAAc > 4:576712/1‑71 (MQ=255) taagctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAAc < 2:358606‑M1/122‑1 (MQ=255) ccAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAAc < 1:638245/150‑1 (MQ=255) cAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACg > 2:517422/1‑150 (MQ=255) gctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCgg < 2:416312‑M1/84‑1 (MQ=255) gctcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACgtg < 1:1118067‑M1/125‑1 (MQ=255) tcgatcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTa < 1:218696‑M1/127‑1 (MQ=255) gggCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCg > 3:689854/1‑150 (MQ=255) tcaggcgcttgacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCCGACATGACCCTGTTAGCATTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGt < 3:488695‑M1/131‑1 (MQ=255) tctctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGCACGTGTATCGTTTTCg > 1:284756/1‑150 (MQ=255) tctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCttt < 4:432738/86‑1 (MQ=255) ctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAc < 1:584119/44‑1 (MQ=255) ctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAAc > 2:584119/1‑44 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCg < 4:188825/93‑1 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCg > 3:188825/1‑93 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATaaaa > 1:946851/1‑108 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATaaaa < 2:946851/108‑1 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCgg < 2:498323/150‑1 (MQ=255) tttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGa < 4:689854/150‑1 (MQ=255) tttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGa < 2:815658/150‑1 (MQ=255) tttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGa > 2:213065/1‑150 (MQ=255) gacagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGa < 4:141103‑M1/141‑1 (MQ=255) cagcctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATa < 1:1010267‑M1/143‑1 (MQ=255) aTTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATaa > 1:341091/1‑150 (MQ=255) tGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGc > 2:343689/1‑150 (MQ=255) cctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGc < 3:503070‑M1/146‑1 (MQ=255) cctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGc < 1:1007239‑M1/146‑1 (MQ=255) ctgCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACa > 3:468789‑M1/4‑68 (MQ=255) gCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACAt > 3:298728‑M1/2‑67 (MQ=255) | GTGATGACAAGTCCTTGAGATACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTC > NC_000913_3_pae_tpiA/1263502‑1263797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |