| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913_3_pae_tpiA | 1,756,121 | Δ557 bp | coding (424‑980/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase I |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913_3_pae_tpiA | 1756121 | 1756677 | 557 | 60 [0] | [0] 60 | pykF | pyruvate kinase I |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 1756120 | 0 (0.000) | 60 (0.730) | 46/284 | 0.8 | 100% | coding (423/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase I |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 1756678 = | 0 (0.000) | coding (981/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase I | |||||
CCCAGATGCTGGATTCCATGATCAAAAACCCACGCCCGACTCGCGCAGAAGCCGGTGACGTTGCAAACGCCATCCTCGACGGTACTGACGCAGTGATGCTGTCTGGTGAATCCGCAAAAGGTAAATACCCGCTGGAAGCGGTTTCTATCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGT > NC_000913_3_pae_tpiA/1756530‑1756824 | tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatggaagttaccgccattgaaggtaacaaac > 1:1011203‑M2/149‑149 (MQ=255)tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatggaagttaccgccattgaaggtaacaaac > 1:146703‑M2/149‑149 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatggaagttaccgccattgaaggtaacaaaca < 2:1169742‑M2/2‑1 (MQ=255) 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gaagttaccgccattgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGaaa > 2:103238‑M2/28‑149 (MQ=255) gaagttaccgccattgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGaaa > 2:651647‑M2/28‑149 (MQ=255) ttaccgccattgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACt < 1:892408‑M2/126‑1 (MQ=255) taccgccattgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTg < 2:1425960‑M2/127‑1 (MQ=255) taccgccattgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTg < 2:1369268‑M2/127‑1 (MQ=255) cgccattgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGAt < 2:1159741‑M2/130‑1 (MQ=255) gtcattgaagttaacaaaCATAGCGACCATCTGCGAACGTGCCGTCCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGATg < 1:184811‑M2/131‑1 (MQ=255) attgaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTAaagaaatgaccgacg > 2:129312‑M2/16‑142 (MQ=255) gaaggtaacaaaCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGCATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAACAACTGGATCCTCCGc > 2:198822‑M2/13‑149 (MQ=255) acaaaCATGGCGACCATCTGCGCACGTACCGACCGCATGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACTATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAATTACTAAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGt > 2:1382022‑M2/6‑149 (MQ=255) aaCATGGCGACCATCTGCGAACGTCCCGACCGCGCGATTAGCAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGt < 1:758703‑M2/147‑1 (MQ=255) | CCCAGATGCTGGATTCCATGATCAAAAACCCACGCCCGACTCGCGCAGAAGCCGGTGACGTTGCAAACGCCATCCTCGACGGTACTGACGCAGTGATGCTGTCTGGTGAATCCGCAAAAGGTAAATACCCGCTGGAAGCGGTTTCTATCATGGCGACCATCTGCGAACGTACCGACCGCGTGATGAACAGCCGTCTCGAGTTCAACAATGACAACCGTAAACTGCGCATTACCGAAGCGGTATGCCGTGGTGCCGTTGAAACTGCTGAAAAACTGGATGCTCCGCTGATCGTGGT > NC_000913_3_pae_tpiA/1756530‑1756824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |