| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913_3_pae_tpiA | 1,756,121 | Δ557 bp | coding (424‑980/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase I |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913_3_pae_tpiA | 1756121 | 1756677 | 557 | 84 [0] | [0] 86 | pykF | pyruvate kinase I |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 1756120 | 0 (0.000) | 84 (1.010) | 68/284 | 0.2 | 100% | coding (423/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase I |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 1756678 = | 0 (0.000) | coding (981/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase I | |||||
TTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAGTTATCTGTAAAGTGCTGAACAACGGTGACCTGGGCGAAAACAAAGGTGTGAACCTGCCTGGCGTTTCCATTGCTCTGCCAGCACTGGCTGAAAAAGACAAACAGGACCTGATCTTTGGTTGCGAACAAGGCGTAGACTTTGTTGC > NC_000913_3_pae_tpiA/1755973‑1756266 | tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGCCAACACCGTACTGGTTGACGCTGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACAGCCACTCAAGGTAACAAAc > 2:1427440‑M1/1‑148 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAca < 2:1208583‑M1/149‑3 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGTTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcat < 2:933375‑M1/149‑4 (MQ=255) ccacgcataaatcTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGGCTGTGGGCAACACCGTACTTGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggc < 1:56317‑M1/143‑7 (MQ=255) ccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCGGATCGGTCTGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggc > 1:425639‑M1/1‑143 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcga < 2:1402820‑M1/149‑9 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcga < 1:215998‑M1/149‑9 (MQ=255) acTAATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcga < 2:33534‑M1/149‑9 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAACcatggcgacca > 1:147350‑M1/1‑138 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgacca > 2:578016‑M1/1‑138 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccat > 1:1390379‑M1/1‑137 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctg < 1:605587‑M1/149‑16 (MQ=255) aaTCCGTTAACGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctg < 1:1032793‑M1/149‑16 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcg > 1:965389‑M1/1‑132 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcg > 1:493950‑M1/1‑132 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAAGGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaa < 1:659678‑M1/149‑20 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGACATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaac < 2:90495‑M1/149‑21 (MQ=255) tCGGCATCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtac < 1:809069‑M1/149‑25 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgcccatctgcgaacgtac > 1:236784‑M1/1‑125 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtac > 1:1397678‑M1/1‑125 (MQ=255) cGGGAAAAGCGGAATGGTTGGGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTGGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtacc < 2:147350‑M1/149‑26 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccga > 1:1358596‑M1/1‑122 (MQ=255) gCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCAATACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgt < 1:891449‑M1/149‑34 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtga < 1:936049‑M1/149‑36 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtga > 1:502650‑M1/1‑114 (MQ=255) aTGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatga < 1:845581‑M1/149‑39 (MQ=255) gggtGGCGGTTACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgacgatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaa < 2:218632‑M1/148‑40 (MQ=255) tAACGTATGAAGGTTTCACTAGTGACCTGTCTGTTGGCACCACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtct < 2:1289211‑M1/149‑49 (MQ=255) aaCGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctc < 2:502650‑M1/149‑50 (MQ=255) tATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagt > 2:40123‑M1/1‑96 (MQ=255) tGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCCAACTTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttc < 1:927497‑M1/149‑56 (MQ=255) gAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttca > 1:745067‑M1/1‑93 (MQ=255) gAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttca > 1:1164259‑M1/1‑93 (MQ=255) gAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttca > 1:1164319‑M1/1‑93 (MQ=255) gttttcaCTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaaca < 2:499936‑M1/147‑60 (MQ=255) ttCACTACTGACCTGTCTGTTGGGAAAACCGTTCTGGTTGGCGATGGTATGATTGTTATTGAAGTTACCGCCAGTGAGGGGAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatg < 2:491274‑M1/149‑63 (MQ=255) tCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatgtcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttgaacaattc > 2:369705‑M1/1‑86 (MQ=255) acgactgacCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgaca < 2:231921‑M1/146‑66 (MQ=255) tactGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGCTGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATCGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaaggtaccgaccgcgttatgaacagccgtctcgagctcaacaatgacacc > 2:626439‑M1/1‑82 (MQ=255) tactGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaac > 1:108461‑M1/1‑82 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGAGGATGGTCTAATCGGTATGGACGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccagctgcgaacgtaccgactgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgcaaac > 1:1225159‑M1/1‑75 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatg < 1:1207774‑M1/79‑5 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatg > 2:1207774‑M1/1‑75 (MQ=255) tgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgacagcgtgatgaacagccgtctggggttcaacgatgacaaccgtccactgccc > 1:1415650‑M1/1‑70 (MQ=255) ttGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcat > 1:513261‑M1/1‑68 (MQ=255) gCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgtgttttacaatgacaaacgtatagtgcgcgttac > 2:412619‑M1/1‑65 (MQ=255) aaCACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgta > 1:1401405‑M1/1‑63 (MQ=255) aaCACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgta < 2:1401405‑M1/86‑24 (MQ=255) acCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGTAAATTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgacagcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgataatcacgcattaccgaaa > 1:350427‑M1/1‑60 (MQ=255) gTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaacctgcgcattaccgaagcgg < 1:578016‑M1/149‑93 (MQ=255) ggTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgc > 1:1172813‑M1/1‑52 (MQ=255) gTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtctgcc > 2:743167‑M1/1‑51 (MQ=255) aCGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaacctgcgcattaccgtagcggtatcccgtgg > 2:227316‑M1/1‑47 (MQ=255) aCGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgcgg > 1:907169‑M1/1‑47 (MQ=255) gATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaactgcggtctcgaggtcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgacgcggtatgccgtggtg > 1:701027‑M1/1‑45 (MQ=255) gATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtg > 1:1349878‑M1/1‑45 (MQ=255) ttgtcTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatcccaaaggttgagtgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgcc < 1:1431743‑M1/147‑107 (MQ=255) ggTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCTATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagcggtctcgagttcaacgatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccg < 1:1274358‑M1/149‑108 (MQ=255) ggctgATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgt < 1:968659‑M1/147‑109 (MQ=255) tCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaacagcccattacagaagcggtatcccgaggtgccgtt > 2:332503‑M1/1‑40 (MQ=255) cTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttc > 2:982778‑M1/1‑39 (MQ=255) cTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttc < 1:982778‑M1/94‑56 (MQ=255) tGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttga > 1:69292‑M1/1‑38 (MQ=255) cGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgccttaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaact > 1:119061‑M1/1‑34 (MQ=255) gTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcgttaccgaagcggtataccgtggtgccgttgaaactgc > 2:782496‑M1/1‑32 (MQ=255) gTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggagaccctgttcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgc < 1:269344‑M1/149‑118 (MQ=255) tacggaagTTACCGCTATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgct < 2:216797‑M1/146‑119 (MQ=255) tGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctga > 2:559772‑M1/1‑29 (MQ=255) ggAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatga > 2:1305228‑M1/1‑28 (MQ=255) ggAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatga < 1:1305228‑M1/66‑39 (MQ=255) cGCCATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgaggtcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaagactggat > 1:542598‑M1/1‑19 (MQ=255) ccATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgcaaaacttgatgc > 1:168349‑M1/1‑17 (MQ=255) ccATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggt < 1:956119‑M1/120‑104 (MQ=255) ccATTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggt > 2:956119‑M1/1‑17 (MQ=255) aTTGAAGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgacaacctggatgctc > 2:653941‑M1/1‑15 (MQ=255) aaGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgactgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgtcgacactgcttaaaaactggatgctccgct > 1:1345883‑M1/1‑11 (MQ=255) aGGTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctg > 1:967612‑M1/1‑10 (MQ=255) gTAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctgat > 1:369013‑M1/1‑8 (MQ=255) tAACAAAcatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcatttccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctgatc < 1:1361197‑M1/149‑143 (MQ=255) aacaaacatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctgatcg > 2:1160729‑M1/1‑6 (MQ=255) acaaacatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctgatcgt < 1:595135‑M1/149‑145 (MQ=255) acaaacatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactacgcattaacgaagcggtatgccggggttccgttgaacctgctgaagaaatagatgctcctctggtcgt > 2:271543‑M1/1‑5 (MQ=255) aaacatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctgatcgtgg > 1:1183713‑M1/1‑3 (MQ=255) aaacatggcgaccatctgcgaacgtaccgaccgcgtgatgaacagccgtctcgagttcaacaatgacaaccgtaaactgcgcattaccgaagcggtatgccgtggtgccgttgaaactgctgaaaaactggatgctccgctgatcgtgg > 1:702921‑M1/1‑3 (MQ=255) | TTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCATTGAAGGTAACAAAGTTATCTGTAAAGTGCTGAACAACGGTGACCTGGGCGAAAACAAAGGTGTGAACCTGCCTGGCGTTTCCATTGCTCTGCCAGCACTGGCTGAAAAAGACAAACAGGACCTGATCTTTGGTTGCGAACAAGGCGTAGACTTTGTTGC > NC_000913_3_pae_tpiA/1755973‑1756266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |