| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 437880 | 303 (0.340) | 255 (0.230) +ATAT |
70/188 | 11.0 | 38.4% | intergenic (‑184/+238) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | 437881 = | 455 (0.400) | intergenic (‑185/+237) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
TGAAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/437753‑437880‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATAATTTAGATTTTTAA > CP016816/437881‑438007 |||| GAAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGA > 1:1716753/1‑128 GAAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGA > 2:2248225/1‑128 GAAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGA > 2:239843/1‑128 AAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGAT > 2:1728004/1‑128 AAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGAT > 2:2182987/1‑128 ACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATAT > 2:1202584/1‑128 TTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATAAAGCAAAGCAAAAACATCCATATAACCTATACAGTTAATGATATAT > 2:572539/1‑128 TATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTATTAAATATTAGAAATAAATATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGTAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATA < 2:1590455/128‑1 TATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATA > 1:1794428/1‑128 ATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATATAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATAT < 2:1938911/128‑1 TTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATA > 2:912233/1‑128 TTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATAGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAACCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATA > 2:1123409/1‑128 TTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATAT > 2:1679353/1‑128 TTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATAT > 2:881660/1‑128 TTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATAT > 2:1145822/1‑128 TTGTAGTTATAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATTAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATAT < 1:685243/128‑1 tacaaaaaTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATA > 1:1673515/9‑128 TGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATTAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATA > 1:1558151/1‑128 GTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATAT < 1:562915/128‑1 GTAGTTGTAAGTTTCATTTATAATAAATATTAGATATAAAAATTGTATTTTTAATATAAATATTTTAGGAAATTAATCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATAT < 2:275829/128‑1 TAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATA > 2:506918/1‑128 TAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATA > 1:2194176/1‑128 atTTGTAACTTTAATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGTAAATGAAGCAAATCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATAT < 1:2098594/126‑1 AGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATAT > 1:1219187/1‑128 GTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATA > 2:1992404/1‑128 aTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATAT < 1:1319020/127‑1 TTGTAAGTTTAATTTTTAATAAATATTAGATATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTATGAAATTAATCAAATCAAAAAACTCTATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATAT < 2:2076843/128‑1 TGTAAGTTTCTTTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAAATGTTTTTTTAAAATATATATTTTAGGAAATGAAGAAAAGCAAAAAACACCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATA < 2:1856535/128‑1 TGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAATCAAAGAAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATA < 2:1794393/128‑1 TGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATA > 1:2263807/1‑128 GTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATAT > 1:378460/1‑128 GTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATAT > 1:2051560/1‑128 GTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATAT > 1:429504/1‑128 GTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATAT > 2:1660779/1‑128 taattttatTTTTTAATAAATATAAGATATAAAAATTGTATTTTTTAAATAAATATTTTAGTATATGAAGCAAAGCATAAACCTCCATATTAGCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATA < 2:2326955/119‑1 TAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATA > 1:1019488/1‑128 AAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTATGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATAT > 1:1973518/1‑128 AAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATAa > 1:2447073/1‑127 AAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATATCCTATAGAGTAAATGATATATATTTATATATATATAa > 2:1919907/1‑127 AGTTTAATTTTTAATAAATATTATAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAATCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATA < 1:1143834/128‑1 tTTTCATTTTTAATATATATTAGATATAAAAAATTTATATTTAAAAAAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCACCATATAACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATAT < 1:1828680/127‑1 GTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATAT > 2:1021660/1‑128 TTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACATCCATATAACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATTTATATATATA > 1:866111/1‑128 ttaATTTTTAATAAATTTTAGTATTATAAATTGTATTTTTATAATAAATATTTTAGTAAATTAATCAAAGAAAAAACATCCATATTAACTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATAT < 2:1459147/125‑1 TTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAATCAAAGCAAAAAACTCAATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATAT < 1:193295/128‑1 TCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTAACTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATA > 1:2007811/1‑128 CATTTTTTATAAATATTAGATATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGTAAATGAAGAAAAGCAAAAACCTCCATATTAACTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATcattaa < 2:967722/128‑7 CATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATAT > 2:396683/1‑128 ATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATAAATATATATATATATATA > 1:544321/1‑128 TTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATAcgcaagc > 2:2090931/1‑121 TTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATAatctagc > 1:1111133/1‑121 TTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATtcaa > 1:2389471/1‑124 TTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATAaaa > 1:1153346/1‑125 TTAATAAATATTAGATATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTATTAAATTAATAAAAGAAAAAACATCAATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATgcaagcg < 1:1073476/128‑8 TTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATtcaagag > 1:991389/1‑121 TTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATATATa > 2:2125625/1‑127 TAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCATAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATtctagc > 1:158871/1‑122 TAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATTTTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATtcaagcga > 1:1005118/1‑120 TAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATgcaatcgatcat > 2:447624/1‑116 TAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATgcaagcga > 1:264770/1‑120 TAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATgaaagcga > 1:1648604/1‑120 AATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATtcaagcgat > 1:329769/1‑119 AATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATA < 1:524510/116‑1 ATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATATATGCTAGCGA > 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CTATAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATATATGAAAGCTATCAGCATAAAATGGTGAAATTTATATATGAGTTTGTCTAAAATTTATAGTTTTTATTTATAATTTTTAAAttga > 2:560361/1‑124 TATAGAGATAATG‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATA < 2:897548/128‑1 ATAGAGTTATAGATTTATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAAT < 2:333917/128‑1 TAGAGTTAATGATATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATA < 1:106014/128‑1 GAGTTAATG‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGAATAAAATTGTGAAATTTATATCTGAGTTGGTATTAAATTTGTATTTTTTATTTATAGTTTATAAATTTAATAATTT > 2:1443227/1‑128 AGTTAATG‑‑ATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCTATCAGAATAAAATTGTGAAATTTATATCTGAGTTGGTATTAAATTTGTAGTTTTTATTTATATTTTATAAATTTAATAATATA > 2:718431/1‑128 ataatgATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATAATTTAGA < 2:1390592/122‑1 gATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGAT > 1:2349987/2‑65 atTATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCGTAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATAATTTAGATTTTT < 1:788247/126‑1 atTATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATAATTTAGATTTTT < 2:72498/126‑1 ATATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATAATTTAGATTTTTA < 2:760669/128‑1 ATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGCGATCAGAATAAAATGGAGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTTTATTTTTTATTTATATTTTATAAAGTTAATAATTTAGATTTTTA > 2:824646/1‑128 |||| TGAAACTTATTTTTGTAGTTGTAAGTTTCATTTTTAATAAATATTAGAAATAAAAATTGTATTTTTAAAATAAATATTTTAGGAAATGAAGCAAAGCAAAAACCTCCATATTACCTATAGAGTTAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/437753‑437880‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATATATATGCAAGCGATCAGCATAAAATGGTGAAATTTAGATCTGAGTTGGTCTTAAATTTGTAGTTTTTATTTATAGTTTATAAAGTTAATAATTTAGATTTTTAA > CP016816/437881‑438007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |