BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

Only 100 of 1122 total aligned reads displayed.

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TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAA‑GATTAATGT‑TAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAT‑ATTT‑‑T‑‑‑A‑AT‑‑AAAAAAAAA‑‑AAAA‑‑AAAAACAAGAC‑C‑TAATA‑TTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGTCT‑TGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 15 ≤` `ATCG/ATCG` `< 16 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.