New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP016816 105365 =2877 (0.650)224 (0.060) 103/222 17.5 8.1% intergenic (+860/+66) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
?CP016816 = 105361 2518 (0.640)intergenic (+856/+70) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 3101 total aligned reads displayed.

AAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATAAC  >  CP016816/105238‑105492
                                                                                                                                    |                                                                                                                                 
aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaa                                                                                                                                   >  1:7494595/1‑128 (MQ=255)
aaaaTCACTTATCATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaa                                                                                                                                   >  2:8122991/1‑128 (MQ=255)
   aTCACTTATTTTAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATATAATTATTTATTAAGATTGATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATAAATTTAATA‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaa                                                                                                                                >  2:2112744/1‑128 (MQ=255)
    acaattattaTTGTATTTAATAAATAACTTTAATGTTAAAATAAATTATCTAAGTTTTTATTAGGATTTTTTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaa                                                                                                                               <  2:1734668/124‑1 (MQ=255)
         tattatATTTTTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATGATTTTTTATTTTATTTAAACTTTTAAAAAAATGAATTTAATT‑AAAAAATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                                          <  1:6214298/128‑1 (MQ=255)
         tattatAGTTTTAAATAATAAATTTTAATGTTAATATAAATTTGCTTATTATTTATTATGATTGATTTTTTTATTTTTCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑aaa‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                                          <  2:2869846/128‑1 (MQ=255)
          attatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                         >  2:8365640/1‑128 (MQ=255)
            tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTAAACATTTAATAAAAATAAATTAATT‑AAAAAAATTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                      >  2:710412/1‑128 (MQ=255)
            tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTAATTTATCCTTTTAATATAATGAATTAAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                       >  2:388901/1‑128 (MQ=255)
             ataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                      >  2:9275569/1‑128 (MQ=255)
              aattATGAAATAATTAATATTAATTTTAATTTAAATTATCTAATTTTTTATTTGGTTTTTTTATTTTATTTATCCTTTTAATTTAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑aaa‑aaaaaaaaaaaaaaaaac                                                                                                                     <  2:7610633/125‑2 (MQ=255)
               atttttaaaaaaaaaaTATAAATTTTAATTTAAATTTGCTAATTATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTATTTATCCCTTTAAATTAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                    <  2:3430256/122‑2 (MQ=255)
               attatttaataatAAATTTTAATGTTAATATAAATTATATAATTATTTATTAGTATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                                    <  2:9381338/121‑4 (MQ=255)
               aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                    >  1:7826227/1‑127 (MQ=255)
                tttttaaaTAATAATTTTTAATTTTAATATAAATTAGTAAATTATTTATTAGTTTTTTTTTTTTTATTTATCATTTAAATAAAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACaa                                                                                                                  <  1:8204615/123‑1 (MQ=255)
                ttATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAAAATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                                   <  1:4092340/127‑4 (MQ=255)
                gTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTA‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACa                                                                                                                   >  2:6529473/1‑128 (MQ=255)
                 tatttaataaaAAATATTTATTTAAATTAAAATTAGTTTATTTTTTTTTATGATTTTTTTTTTTATTTATACATTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATTTTTT‑‑‑Aaa‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaac                                                                                                                  <  2:4461746/123‑4 (MQ=255)
                 tATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTTTTTAATTATTTTTTTTTTTTGATTTTTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaacaag                                                                                                                  <  2:3758191/128‑5 (MQ=255)
                   ttaaaTAATAAATTTTATTTTTAATATAAAATATCTAATTATTTTTTATTATTTTTTATTTTATTAAAAATTTTAATAAAATTAATTTAATT‑AAAAAATTTT‑‑‑Aaa‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaacaag                                                                                                                <  2:9173057/126‑6 (MQ=255)
                    gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                               >  1:8726604/1‑125 (MQ=255)
                        taataaAGATTAATTTAAATATTAATTAGCAAAGTATTTTTTAGGATTGATTATTTTATTTATACTTTTAATTTAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                                          <  2:1917097/128‑1 (MQ=255)
                         aataaataTTAATTTTAATATAAATTTTTTAATTATTTATTTGGTTTTATTTGTTTATTTATACTTTTTATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                                          <  2:7492372/128‑1 (MQ=255)
                         aataaataTTAATTTTAATATAAATTATCTAATTTTTTATTATGATTGATTATTTTATTTTTCCTTTTTATATAATTATTTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAata                                                                                                         <  2:7231207/128‑1 (MQ=255)
                          ataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACTaaaa                                                                                                         >  1:8348954/1‑126 (MQ=255)
                          ataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATAAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaata                                                                                                         >  2:6771096/1‑119 (MQ=255)
                              ataTTTATGTTAATATAAAATTCCTAATTAATTTTTAGGTATGATTATTTTATTTTTACTTTTAAAATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTg                                                                                                      <  2:9548274/126‑1 (MQ=255)
                                aTTAATGTTAATATAAATTACCAAATTTTTTATTATGATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAAAATTTT‑‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                                                  <  1:8998985/128‑1 (MQ=255)
                                   aaTGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAATATTTTTaaaa                                                                                                >  2:1213747/1‑128 (MQ=255)
                                        tAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAAAATTTTTAAAAAAaatt                                                                                          >  1:3109034/1‑128 (MQ=255)
                                             taAATTATCTAATTTTTTATTATGATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaat‑ta                                                                                    <  1:8851624/128‑1 (MQ=255)
                                                 ttAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAAATTTTaaaaaaaaaaaataaata                                                                                  >  1:4917593/1‑118 (MQ=255)
                                                 actatttattatttattATGATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGt                                                                                 <  1:8087319/119‑1 (MQ=255)
                                                  tttcTAATTATTTATTATTTTTTATTATTTTATTTTTAATTTTAAAATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑Ct                                                                              <  1:6464126/125‑1 (MQ=255)
                                                    tatatttatttattTTTATTCTTTAGTTTATTTATAATTTTAATAAAATTAATTTAATT‑AAAATATTTTAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGt                                                                                 <  1:9275095/122‑1 (MQ=255)
                                                       tattatttattATGTTTTTTTATTTTATTTAAAATTTTAAATAAATTAAAATAATT‑AAAAATTTTA‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGAt                                                                          <  2:470378/125‑1 (MQ=255)
                                                       aatttttttttAGTTTTTATTTGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAATTTTTA‑‑‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGa                                                                           <  2:8836871/123‑1 (MQ=255)
                                                        attatttattATGATTTATTATTTTATTTAAACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAAAAATTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGAtt                                                                         <  1:4535331/126‑1 (MQ=255)
                                                        aGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAATAATATTTTTAAAAAAAATAAAT‑TAAAT‑ATTAAtt                                                                         >  2:8698339/1‑128 (MQ=255)
                                                         ttttttattATGTTTGATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATtta                                                                       <  2:9025649/125‑1 (MQ=255)
                                                         gTATTTATTAGGATTGATTAGTTTAATTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTATAAAAAAAAAataat‑taattatttaatt                                                                         >  1:597786/1‑118 (MQ=255)
                                                          ttttttatttttttgattTTTTTTTTTATACTTTTTATTATATTAATTTTATT‑AAAATTTTTT‑‑‑TAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATtta                                                                       <  2:1044823/116‑1 (MQ=255)
                                                          tatttattATGAATTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATttat                                                                      <  1:2113219/128‑1 (MQ=255)
                                                           atttattATGATTTATTATTTTATTTAAACTTTTAAAATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATttat                                                                      <  1:7931424/128‑1 (MQ=255)
                                                           atttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAATATTTTAAAAAACAATTAAT‑TAATT‑ATAGATttat                                                                      >  1:7603507/1‑128 (MQ=255)
                                                             ttattaTGATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAAAATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTaa                                                                   <  1:1348414/128‑1 (MQ=255)
                                                             ttattaGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAATAAAA‑AAAAT‑ATTTattaatta                                                                    >  2:2478377/1‑128 (MQ=255)
                                                                   ggATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAAATAAA‑TAATA‑ATTAATTAATTaaaaaaaa                                                             >  1:3420769/1‑123 (MQ=255)
                                                                    gattgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AA‑ACATAATATTTTTAAAAAAAATAAAT‑TAATT‑ATTAATATAATAAatataaatt                                                          >  1:4691007/1‑123 (MQ=255)
                                                                     tttttttttttttttttTACTTTTAAAATAATTTATTTAATT‑TAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAAtattat                                                            <  2:3053549/119‑1 (MQ=255)
                                                                      tttattattTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAtttttt                                                       <  2:8260197/125‑1 (MQ=255)
                                                                      tttaatAGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAttt                                                          <  2:7364918/123‑1 (MQ=255)
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                                                                          ttATTTTAATTAACATATTAAAATAATTAATTAAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTa                                                      <  1:2959982/128‑1 (MQ=255)
                                                                          ttAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAATAATATTTTTAAAAAAAATAAAA‑TAATT‑ATTAATTAATTAAATATTAtttttaa                                                      >  1:5537999/1‑126 (MQ=255)
                                                                          ttAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAAAATTTTTAAAAAAAATAAAT‑AAATA‑ATTAATTAATAAAAAATTAtatttaa                                                      >  2:6114863/1‑126 (MQ=255)
                                                                           tAGTTTATTTATTATTTTTATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAc                                                    <  1:7727309/128‑1 (MQ=255)
                                                                             gTTTATTTATCCTTTTAATTTAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAATTAAT‑TAAAA‑ATTAATTTATTAAATATTATTTTATaaa                                                    >  2:3264118/1‑127 (MQ=255)
                                                                             gTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTTAAAAAAAATTAAT‑TAATA‑AATAATTAATAAAAAAATATTTTTTaaa                                                    >  1:711658/1‑127 (MQ=255)
                                                                                tatttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTAAAAAAAAATAAAT‑AAAAA‑ATTTATTTATAAAAAAATATTTTTAaaaaaaa                                                >  2:627822/1‑127 (MQ=255)
                                                                                taattaaCCTATTAATATAATGAATTTAATT‑AAAAAATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAACCCTAATATT‑TTAAAAAAAATAAATATAAAT‑ATAAATTAATAAAATAAATTTATTTAACAAAt                                                >  2:8462027/4‑128 (MQ=255)
                                                                                    tataCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAcc                                           <  2:2346136/128‑1 (MQ=255)
                                                                                    tatCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAc                                            <  1:2825979/128‑1 (MQ=255)
                                                                                     attattttAATAAAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAcc                                           <  2:5040076/124‑1 (MQ=255)
                                                                                     atCCTTTTAAAATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑A‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                          <  2:7815780/128‑1 (MQ=255)
                                                                                       cattttAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                          <  1:4352393/126‑1 (MQ=255)
                                                                                        cTTTTAATATAATGAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTTAAAAAAAATTAAT‑AAATA‑AATTATTAATTAAAAATTATTTTTAAAAAAAATTaaatt                                         >  1:385165/1‑124 (MQ=255)
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                                                                                                            att‑aaAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAATATTTTTAAAAAAAAAAAAT‑AAAGT‑TTTTATTTATAAAAAATTTTTTTTTAAAAAATTAACATTTACATAAATTAgattttaaac                    >  2:8589553/1‑119 (MQ=255)
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                                                                                                             tt‑aaAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACATAATATTTTTAAAAACAATTAAT‑TAATT‑ATTTATTTTTTAAATATTTTTTTTTAAAAAATTTACATTGAGATAAATTAGCGTTtactc                    >  2:3174963/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                             ctatatttatTTT‑‑‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtcct                     <  1:1932693/121‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                  aaTATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACCAAATATTTTTAAAAAAAATTAAT‑TAATT‑ATTGATTTATTAAATATTTTTTTTTAACAAATTTACCTTTAGCTAAATTAGAGTTACCTCCAcc                >  2:7723130/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                  aaTATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATCCAAAAAATTTTTAAAAAAAATATAT‑AAATT‑CATTAATAATTAATAAATATTTTTAAAAAAATTTAAATTGATCTAATATAGAGATTACACCACCt               >  2:4914197/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                  aaTATTTT‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAATAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCt               <  1:6872668/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                  aaTATTTT‑‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACATAATATTGTTAAAAACAATAAAT‑TAAGT‑CTTTTTTTATTAAATTTTATTTTTAAAAAATTTAACATTCAGCTAATTTTCCGTTTCATCAACAtt              >  1:8634466/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                   atatTTT‑‑‑A‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCttt             <  1:6696752/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                      tttt‑‑‑AATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCttt             <  1:1130767/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                       ttt‑‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATTTTGTTTAAAACAATTAAT‑TAATT‑CTTGATTTATAAAATATTATTTTTTAAAAAATTTACATTGAGCTAAATTTGAGTTTACTACACAtttttt          >  1:9574443/1‑125 (MQ=255)
                                                                                                                          aatttttataaaaaaaaaaaaaaaaaaAGAACTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTa            <  2:2617540/119‑1 (MQ=255)
                                                                                                                              taataaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGACCTAATTTTTTTAAAAAAAATTAAT‑TAAGT‑ATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTTAAATTGAGATAATTTACGTTTTCATCAACATTTattat        >  1:248385/5‑124 (MQ=255)
                                                                                                                                ataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaCACAAATTATTTTAAAAAACAATTAAT‑TAATT‑ATTTATTTATTAAATTTATTTTTTTAAAAAATTAAAATTCAGATAAATTAGCTTTTCATCCACATTTataataa      >  2:4182020/3‑122 (MQ=255)
                                                                                                                                aaaaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCa      <  1:9399773/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                aaaaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCa      <  1:7227829/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                aaaaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGAACTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCa      <  1:8491399/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                    |                                                                                                                                 
AAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATT‑AAAATATTTT‑‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAAT‑TAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCATAAC  >  CP016816/105238‑105492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.