New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP016816 105365 =2877 (0.650)224 (0.060) 103/222 17.5 8.1% intergenic (+860/+66) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
?CP016816 = 105361 2518 (0.640)intergenic (+856/+70) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 2958 total aligned reads displayed.

TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488
                                                                                                                                  |                                                                                                                                  
 tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTt‑aat‑a                                                                                                                                  >  2:860942/1‑128 (MQ=255)
  ttAAAATCACATATAATATTATTAAATAATAAATATTAAATTTAAAATAAAATACCTAATTAATTATTAGGATTTAATATTTTA‑TTTAA‑CCATTTAATAAAATGAATTTAATTAAAATATTTt‑aat‑aa                                                                                                                                 <  1:3707097/127‑1 (MQ=255)
    aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGAATTTATTAGAATTGATTAGTTTA‑TTTAA‑AATTTTAATATAATAAATTAAAAAAAAAAATAAT‑AAT‑aa‑aa                                                                                                                              >  2:304786/1‑128 (MQ=255)
      aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATTTTA‑TTTAT‑AATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTAT‑AAT‑aa‑aaaa                                                                                                                            >  2:1238194/1‑128 (MQ=255)
      aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTATA‑TTTAT‑CCTATTAATATAATGAATTTAATTAAAATAATTT‑AAT‑aa‑aaaa                                                                                                                            >  2:5968851/1‑128 (MQ=255)
         cACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATCAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aa‑aaaaaaa                                                                                                                         >  2:620910/1‑128 (MQ=255)
              attatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATAAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aa‑aaaaaaaaaaaa                                                                                                                    >  2:3418398/1‑128 (MQ=255)
               ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aa‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                                   >  2:8159045/1‑128 (MQ=255)
                tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aa‑aaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                  >  1:4824584/1‑128 (MQ=255)
                 ataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTCAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aa‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                 >  2:9054279/1‑128 (MQ=255)
                  tattatttaataatAAATTTTTATTTTAATTTAAATTATCTAATTTTTTTTTTTGTTTTTTTATTTTA‑TTTAT‑TATTTTAATTTAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑TAT‑aa‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                <  2:4096232/120‑1 (MQ=255)
                  taGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAAAATAAAGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aa‑aaaaaaaaaaaaaaac                                                                                                                <  2:7740134/128‑2 (MQ=255)
                   aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATTATTGATTATTATA‑TTTAT‑ACTATTAATATAAAAAAATTAATTAAAATATATT‑Aaa‑aa‑aaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                               >  2:6870205/1‑127 (MQ=255)
                    tttttaaaTAATAATTTTTAATTTTAATATAAATTAGTAAATTATTTATTAGTTTTTTTTTTTTTA‑TTTAT‑CATTTAAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AA‑‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACaa                                                                                                             <  1:8204615/123‑1 (MQ=255)
                    ttttGAAATAATAAATATTATTTTTAAAATAAATTTGCTAATTTTTTATTAGGTTTGATTATTTTA‑ATTAT‑CCTTTTAATATTATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACa                                                                                                              <  2:4999840/125‑1 (MQ=255)
                      attaaaTTATAAATATTATTTTTATTATTAATTATTTTATTATTTATTATGATTTATTAGTTTATTTTAT‑TTATTAAATA‑AATGAAATTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑ta‑aaaaaaaaaaaaacaagacc                                                                                                            <  1:5916331/125‑5 (MQ=255)
                       tGAAATAATAAATTTTAATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGATTTATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGAc                                                                                                          <  1:8866222/128‑1 (MQ=255)
                        gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑Aa‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                          >  1:8726604/1‑125 (MQ=255)
                         aaaTAATAAATATTAATTTTAATTTAAATTATCTTATTATTTATTAGGTTTGATTATTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                                        <  2:5122702/128‑1 (MQ=255)
                         aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTATGATTGATTAGTTTA‑ATTAT‑CCTTATAATATAATGAATTTAATTAAAATATATT‑AAT‑Aa‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                         >  2:7518239/1‑124 (MQ=255)
                          aataaaAATTATTAATTTTAATTAAAATTTTCTAATTTTTTATTATGATTTATTATTTTA‑TTTAA‑CCTTTTAAAATAATTAATTTAATTTAAAAATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                                        <  1:6647834/128‑1 (MQ=255)
                            taataaAGTTTAATTTTAATATAAAATTGATAAGTTTTTATTTGGTTTTTTTTGTTTT‑TTTAT‑CCTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AA‑‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                                     <  2:2671901/128‑1 (MQ=255)
                              ataaATTTTAATGTTTATATAAATTTTCTAATTTTTTTTTAGGTTTTTTTATTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAata                                                                                                    <  2:5628313/128‑1 (MQ=255)
                              ataaATATTAATTTTAAAATAAAATATCTAATTATTTATTAGTATTTAATATTTTA‑ATTAT‑AATTTTAAAAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAAA‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                                     <  1:7052823/128‑1 (MQ=255)
                              ataaAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAATTTTTTATTATGATTTATTAGTTTA‑TTTAT‑ACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAata                                                                                                    <  1:779999/128‑1 (MQ=255)
                                 aataTTAATTTTAATATAAATTATTTAATTATTTATTATGATTTATTATTTTA‑TTTAT‑ACTTTTAAAATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTg                                                                                                 <  1:7701282/125‑1 (MQ=255)
                                     tttactttAATATAAATTTTTTTATTTTTTTTTTGGATTTTTTATTTTA‑TTTAT‑ACTTTTATTAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                                             <  2:4849026/122‑1 (MQ=255)
                                       aaTGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACCTAATATTATTaaaaa                                                                                          >  2:2897242/1‑128 (MQ=255)
                                            tAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTAaaaaaaaaa                                                                                      >  2:383887/1‑127 (MQ=255)
                                            tAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGGATTGATTATTTTA‑TTTAT‑ACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AATAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTTATATTGTTAAAAACaa                                                                                       <  1:1349352/128‑1 (MQ=255)
                                             aaaaaaaaTAAGATAATTAATTTTTAGTATTTTTTATTTTT‑ATTAA‑CATTTTAATATAATTAATTTTATTAAAATATTTT‑AAA‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaatt                                                                                     <  2:3714403/123‑1 (MQ=255)
                                             aaTATAAATTTTCTAATTTTTTTTTATGTTTTATTTTTTTA‑TTTAT‑ACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaa                                                                                   <  2:9553994/128‑1 (MQ=255)
                                               tataAATTTTTTATGTATTTATTTGTTTTTTTTATTTTA‑TTTAT‑CATTTAAAAATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaat                                                                                  <  1:7363408/128‑1 (MQ=255)
                                               tataAATTATATAAGTATTTATTTGGATTGAATATTTTT‑TTTAT‑AATTTTAATTTAATGAATTTAATTAAAATTTTTT‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACtattaatt                                                                                 <  1:3123670/128‑1 (MQ=255)
                                               tataAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AATAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATATTTTTAAAAAAaatta                                                                                    >  2:7955033/1‑128 (MQ=255)
                                                 taAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAATAAAAAAAATTTTAAAAAAaaataaata                                                                                 >  2:7395344/1‑127 (MQ=255)
                                                  aaaTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAAAATTTTTAAAAAaaataaataa                                                                                >  1:9165371/1‑126 (MQ=255)
                                                   aaTTATTTAAGTATTTATTATGATTTATTATTTTA‑TTTAA‑CCTTTTAATATAATGATTTTAATTAAATTATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAg                                                                              <  1:4632733/128‑1 (MQ=255)
                                                     ttatcaaattatttattTGGATTTATTATTTTA‑TTTAT‑CTTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATATT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                                             <  1:7471163/119‑1 (MQ=255)
                                                           aaGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTATAAAAA‑AATAAATAAAGT‑Ctttaat                                                                     >  2:6649651/1‑124 (MQ=255)
                                                              tatttattAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAATACATAAAATTTTTAAAAAAAAttaattaataattaattta                                                                    >  2:887655/1‑117 (MQ=255)
                                                               atttattAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATAAATAATATTTTTAAAAAAAATTAATAAATT‑ATTAATatatta                                                                >  1:3299459/1‑128 (MQ=255)
                                                                ttttttttgatttattATTTTA‑TTTAA‑CATTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATttatta                                                                <  1:3922860/120‑1 (MQ=255)
                                                                 tttatatgattgattATTTTA‑TTTAT‑ACTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑TAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTaa                                                               <  2:3250955/121‑1 (MQ=255)
                                                                   attaTGATTTATTAGTTTA‑ATTAT‑AATTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAA‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTaaa                                                              <  1:2309768/128‑1 (MQ=255)
                                                                   attaGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAatat                                                           <  1:52514/128‑1 (MQ=255)
                                                                      atttttgtttttttta‑tttaT‑CATTTTAATATAATGAATTTTATTTAAATTTTTT‑AAT‑‑T‑AAAAAAACAAAAAAAACAAGAACTAATATTTTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAAtatt                                                          <  1:9282921/116‑1 (MQ=255)
                                                                       ggATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATAAAATTTTTAAAAACAATTAATTAAAT‑ATTTAATTATAAAAtatta                                                         >  1:8625158/1‑128 (MQ=255)
                                                                        ttattattttttta‑tttaTACTTTTTAATA‑AATTTATTTAATTAAAATTATTT‑AAA‑TA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAAtatta                                                         <  1:2836207/118‑1 (MQ=255)
                                                                        gattgattAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAA‑‑AAGACAAAATATTGTTAAAAACAATTAATTAATT‑CTTAAATTATTAAAAaatatt                                                       >  2:5424178/1‑128 (MQ=255)
                                                                         tatgattATTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATattatt                                                       <  1:8339860/126‑1 (MQ=255)
                                                                          tttattattTTA‑ATTAT‑CCTTTTAATATAATTATTTTAATTAAATTATTTT‑TAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAttt                                                      <  1:5023745/125‑1 (MQ=255)
                                                                            gattAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAATATTTTTAAAAAAAATAAATAAATT‑ATTAAATTATAAAAAATAAttttt                                                    >  1:9446462/1‑128 (MQ=255)
                                                                              ttAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATAAAATTTTTAAAAAAAAATAAAAAATT‑CTATATTTATTAAATATTAtttttaa                                                  >  1:8476828/1‑126 (MQ=255)
                                                                               tAGTTTT‑TTTAT‑ACATTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAc                                                <  2:2491876/128‑1 (MQ=255)
                                                                                 gTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAT‑‑TTAAAAAAAAAAAATAAAAA‑ATTTATTTATAAAAAATTTTATTTTAaaaa                                              >  1:7213182/1‑128 (MQ=255)
                                                                                 attta‑tttaT‑AAATTTTAAATAATTAATTTAAATAAAAATTTTT‑AATAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTaa                                                 <  1:2478995/127‑1 (MQ=255)
                                                                                  tttttattat‑ACTTTTTAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AATAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTaa                                                 <  1:44455/122‑1 (MQ=255)
                                                                                    ta‑tttat‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATT‑ATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAAt                                            >  1:7917342/1‑128 (MQ=255)
                                                                                     a‑tttat‑AATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAA‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAAt                                            <  1:4220723/128‑1 (MQ=255)
                                                                                       tttat‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAATTAATTATTT‑CTTATTTTATTAAATATAATTTTTAAAAAAAtt                                           >  2:6340670/1‑128 (MQ=255)
                                                                                          at‑CCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAcc                                       <  1:2105362/128‑1 (MQ=255)
                                                                                           ataattttAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAc                                        <  1:5678880/124‑1 (MQ=255)
                                                                                           ataattttAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAcc                                       <  1:2681470/124‑1 (MQ=255)
                                                                                            tacTTTTAAAATAATTAATTTAAATAAAATATTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                      <  1:2984981/126‑1 (MQ=255)
                                                                                             acTTTTAATATAATTAAATTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                      <  1:7565262/127‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                   ttaaAATATTTT‑AAA‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtcctc                <  1:6799564/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                    taaAATATTTT‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTTTTAAAAACAATTAATTAATT‑CTTTATTTTTTAAATATTTTTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATAAGCGTTtccacccc             >  2:939401/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                                       aaTATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACCTAATATTTTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTTATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAGCTTGAGATAAATTAGGGTTTACTacacat           >  2:8046806/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                                       aaTATTTT‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCtt          <  1:6369835/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                         tatTTT‑AATAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTTAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTATATTAGCGTTTCCTCCACCt           <  2:3172227/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                         tatTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAA‑‑AAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTa        <  1:966546/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                          atTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAAAATTGTTAAAAACATTAATTTAAGT‑GTTTATTAATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTAACTTTACAAAAATAAGCGTTACAACCACCtgt         >  2:8498384/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                                          atTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AATACATAAAATTTTAAAAAAAATTTATTTAAGT‑CTTTATTTTTTAAATATTATTTTTTAAAAATTTTACCTTGTGATATATAAACGTTtcaaacacgttta        >  2:7148221/1‑117 (MQ=255)
                                                                                                                          atTTT‑AAT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGGCATATTATTTTTAAAAACAATTATTTAAGG‑CTTGTTTTTTTAAATATTATTTTTAAACAATTTTACATAGACGAAAATTAGCGTTAGCTCAACATTTa        >  2:9279870/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                           tttt‑AATAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCttt         <  1:1130767/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           aatatttt‑aa‑taaAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCttt         <  2:8717559/121‑1 (MQ=255)
                                                                                                                             tt‑AAA‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGt      <  2:8372881/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                  |                                                                                                                                  
TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTA‑TTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AA‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.