| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 165049 | 3507 (1.060) | 134 (0.050) | 67/220 | 43.3 | 4.2% | intergenic (+13/‑529) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| ? | CP016816 | = 165050 | 2994 (1.030) | intergenic (+14/‑528) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1395 total aligned reads displayed.
CAAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/164908‑165049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaagactttctAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTAT < CP016816/165050‑164923 AAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAA > 2:6554408/1‑128 AAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAA < 2:6071583/128‑1 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TTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTT < 1:2687584/128‑1 TTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTT < 2:5464263/128‑1 TTAATAAATGATTATAAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTT < 1:6181304/128‑1 ttATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTC < 1:1350723/126‑1 TAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTTTATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTC < 1:3053415/128‑1 TAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTC < 1:5541653/128‑1 TAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTC < 2:3243946/128‑1 TAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTC > 2:5699653/1‑128 atTAAATGATTATAAATTTGATTATTTATAAGATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCT < 1:78334/126‑1 AATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAATAAAACATTTTATTAAAATTGATGTTGATATTAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTTATAAAAGACTTTCT > 2:6330456/1‑128 AATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCT < 2:5561114/128‑1 AATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCT < 2:2953214/128‑1 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TAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA > 2:1731557/1‑128 TAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA > 2:5953589/1‑128 TAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA > 2:2172741/1‑128 TAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA > 1:4279644/1‑128 TAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA > 2:3494026/1‑128 CAAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/164908‑165049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaagactttctAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTAT < CP016816/165050‑164923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |