| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 143769 | 1816 (1.230) | 67 (0.050) | 37/226 | 22.1 | 3.9% | intergenic (+28/‑134) | JCVSYN2_00565/JCVSYN2_00570 | acetate kinase/phosphoenolpyruvate‑‑protein phosphotransferase |
| ? | CP016816 | = 143772 | 1632 (1.230) | intergenic (+31/‑131) | JCVSYN2_00565/JCVSYN2_00570 | acetate kinase/phosphoenolpyruvate‑‑protein phosphotransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 432 total aligned reads displayed.
ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/143630‑143769‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaacttagcttTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA < CP016816/143772‑143646 ATACTCAGATTATAAGTTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAATCTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAA > 1:336903/1‑128ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGCTACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAA > 2:2277080/1‑128ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAA > 1:2603053/1‑128ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAA > 1:2911404/1‑128ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAA > 1:1271854/1‑128ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAA > 2:1463872/1‑128 TACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAA < 2:3052257/128‑1 ACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAA > 2:1853423/1‑128 CTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAA > 2:2363553/1‑128 tgAGATTATAAATTAATTTCTAGGGAAGAATCAAAAATTCCAGGTTATGCTATTAGTACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAA < 1:2207323/126‑1 TCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAA > 1:755151/1‑128 TCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAA > 1:3177931/1‑128 AGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACT < 2:3132351/128‑1 AGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACT < 1:2051687/128‑1 ATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTA < 1:2968653/128‑1 ATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTA < 2:2087977/128‑1 ATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTA < 1:2866350/128‑1 TTATAAATTAATTTCTAGTGAAGTATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAG < 2:2956637/128‑1 TTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAG < 1:2647910/128‑1 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC > 1:48675/1‑128 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC > 2:1301492/1‑128 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC > 2:1911361/1‑128 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC > 1:2755016/1‑128 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC < 1:2702255/128‑1 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC > 1:100098/1‑128 TATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGC > 1:210537/1‑128 ATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCT < 1:819175/128‑1 ATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCT < 2:1401153/128‑1 ATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCT > 2:2182296/1‑128 ATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCT < 2:1338034/128‑1 ATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCT > 2:23222/1‑128 tatATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT < 1:3094038/125‑1 TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT < 1:2349193/128‑1 TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT > 2:2751819/1‑128 TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT > 2:1506674/1‑128 TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT < 1:1939415/128‑1 TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT < 2:694301/128‑1 TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACATAGCTT > 1:138481/1‑128 AAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTT < 2:2800337/128‑1 AATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTT < 1:3070525/128‑1 AATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTACAGTTTATGATATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTa < 2:2727615/128‑2 ATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTT < 1:38267/128‑1 ATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTT < 1:1606975/128‑1 TTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTTAAGCTA < 1:1177540/128‑1 CTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAG > 1:2687090/1‑128 AGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTATATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGATTTTTAAGCTAAGTTTTTTt > 1:987016/1‑127 ATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACT < 2:70455/128‑1 CAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGATTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTAT < 2:2459021/128‑1 TGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGATAAAAAACTTAG > 1:1788254/1‑86 GCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTATTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAAT < 2:486079/128‑1 GAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGAAATAATAGTTAAAAAACATAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTT < 2:55211/128‑1 GAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT > 2:2911077/1‑73 TGATTTGTTAAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAAATTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATC < 2:2846189/128‑1 TTAAACTTAATTATATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGT < 1:1127288/128‑1 tatAAAATTTTGCTATCTAAGCTAAGTTTTTAATATATTATATCTTTTATTTAATAAAGGTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCT < 1:2551855/125‑1 AAAATCTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTC < 2:952443/128‑1 AAAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTATTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTC < 1:2002524/128‑1 AAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAATCTGGAATTTTTGTTTCTTCA > 2:2977890/1‑128 AAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCA > 2:769204/1‑128 AAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCA < 2:976704/128‑1 AAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCA > 1:634357/1‑128 AAAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCA < 2:1148747/128‑1 AAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCAC > 1:14765/1‑128 AAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCAC > 2:2146416/1‑128 AAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCAC > 2:1774855/1‑128 AAACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGG > 2:175222/1‑111 AACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTAAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCAATTTTTATTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACT < 2:795440/128‑1 ACTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTA < 2:127746/128‑1 CTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAG < 2:1969000/128‑1 CTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAG > 2:744637/1‑128 CTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAG > 1:1864502/1‑128 CTTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAG > 1:3013121/1‑128 TTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGA < 2:1615750/128‑1 TTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGA > 1:967857/1‑128 TTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGA < 1:2496118/128‑1 TTAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTATTCACTAta > 1:867409/1‑126 taagTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAA > 1:1229382/5‑128 TAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAA < 1:2172821/128‑1 TAGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAA > 2:414275/1‑128 aggTTTTTATTCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAA < 2:598751/125‑1 AGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACTAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAA > 2:872537/1‑128 AGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAA > 2:2532472/1‑128 AGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCATCACTAGAAA < 2:2613151/128‑1 AGCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTGTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAA < 1:1725251/128‑1 AGCTTTTTAAGATAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAA < 2:580411/128‑1 GCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAAT > 1:546762/1‑128 GCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAAT < 2:1821198/128‑1 GCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAAT < 2:2514395/128‑1 GCTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCA‑TTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAA < 1:1844434/126‑1 CTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATT < 2:2677614/128‑1 CTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATT < 1:1298783/128‑1 CTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATT > 2:2008901/1‑128 CTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATT < 2:3196491/128‑1 CTTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATT < 1:1977907/128‑1 TTTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTA < 1:1506415/128‑1 TTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCTTTTGTTCTATTAGCATAAAGTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA > 2:905547/1‑128 TTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA < 1:1751263/128‑1 TTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA > 2:1215040/1‑128 TTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA > 1:224996/1‑128 TTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA > 1:2393196/1‑128 ATACTCAGATTATAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/143630‑143769‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaacttagcttTTTAAGCTAAGTTTTTTAACTATTATATCTTTTATTTAATTAAGTTTAAAGTATCTAAACAAATCATTTTTTCTTCATTTGTTCTAATAGCATAAACTGGAATTTTTGATTCTTCACTAGAAATTAA < CP016816/143772‑143646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |