New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP016816 105365 =972 (0.660)138 (0.110) 84/222 12.7 14.1% intergenic (+860/+66) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
?CP016816 = 105361 831 (0.640)intergenic (+856/+70) JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430 translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 1064 total aligned reads displayed.

TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488
                                                                                                                                 |                                                                                                                                 
 tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTt‑‑aat‑a                                                                                                                                 >  1:2928135/1‑128 (MQ=255)
    aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTAATCATTTTAATATAATAAATTAAATAAAAAAATTTA‑‑AAT‑aaaa                                                                                                                              >  1:1160594/1‑128 (MQ=255)
    aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaa                                                                                                                              >  2:264119/1‑128 (MQ=255)
         cACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaa                                                                                                                         >  1:1580508/1‑128 (MQ=255)
               ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                   >  2:722263/1‑128 (MQ=255)
               ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATTATTGATTATTATATTTATCCTTATAATATAATAAATTTAATTAAAAAAATTA‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                   >  1:2234840/1‑128 (MQ=255)
               ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                   >  1:1058571/1‑128 (MQ=255)
                tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                  >  1:1000026/1‑128 (MQ=255)
                  tattATTAAATAATAAATATTAATTTTAATTTAAATTATCTAATTATTTATTATTTTTTTTTATTTTTTTTATACTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                <  1:696300/125‑1 (MQ=255)
                  taGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                >  1:175145/1‑128 (MQ=255)
                   ttttttaaaTAATTAATATTTATTTTTATATTATATATTTAATTTTTTTTTATTATTTATTATTTTTTTTATACTTTTAAATAAATTAATTTAATTTAAATATTTT‑‑TAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaca                                                                                                               <  2:1577198/122‑3 (MQ=255)
                    ttATTAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTTTGATTGTTTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                              <  1:2723512/127‑4 (MQ=255)
                     taagAAAAAATATATATTAATGTTAATAAAAATTAGATAAGTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaacaaga                                                                                                             <  2:2342957/125‑6 (MQ=255)
                        ttaataatAAATATTAATGTTAAAATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAcc                                                                                                         <  2:1943849/126‑1 (MQ=255)
                         aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCATAATAATATAATAAATTTAATTAAAATATATA‑‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                         >  1:2138334/1‑124 (MQ=255)
                          aataatAAATTTTAATTTTAATTTAAATTAGATAATTATTTTTTATTATTTATTATTTTATTTTTACTTTTAATAAAATTAATTAAATTAAAAAATTTTA‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAcc                                                                                                         <  2:3132968/128‑1 (MQ=255)
                           ataataAATATTATTGTTAATATTAAATAGATAATTATTTATTTTGATTTTATATTTTATTTATCCTTTTAATTTAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTaa                                                                                                      <  2:178311/128‑1 (MQ=255)
                           ataataAATATTAAATTTAATAATAATTATGTAATTATTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATTTTAATATAATTAATTTTATTAAAATTTTTT‑‑TAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTaa                                                                                                      <  1:1379530/128‑1 (MQ=255)
                            taataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaat                                                                                                      >  1:3096618/1‑121 (MQ=255)
                              ataaATATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaccaaaaaaat                                                                                                    >  1:2816322/1‑116 (MQ=255)
                              ataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatattt                                                                                                    >  1:400902/1‑119 (MQ=255)
                               taaattttAATTTTAATATAAAATATCAAAGTATTTTTTATTTTTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATAtt                                                                                                  <  1:901869/122‑1 (MQ=255)
                               taaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaaatatt                                                                                                   >  2:768922/1‑118 (MQ=255)
                                 aaGATTATTGTTAATTTAAATTATCATAGTTTTTATTATTTTTTATTTATTTTATTATACTTTTAATATAATTTATTTAATTAAAAATTTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTg                                                                                                 <  1:553277/128‑1 (MQ=255)
                                  aGATTAATTTTAATATAAATTAGCAAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                                             <  2:1649833/128‑1 (MQ=255)
                                  aGAATAATGTTAATATAAATTTTCTAAGTTTTTTTTAGGATTGTATATTTTATTTTTCCTTTTAATAAAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGtt                                                                                               <  1:2577779/128‑1 (MQ=255)
                                     ttAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAATATTTTTaaa                                                                                            >  2:2603384/1‑128 (MQ=255)
                                         ttttAAAATAAATAAGCTTATTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaa                                                                                       <  2:1336354/126‑1 (MQ=255)
                                          tttAAAATAAATTATTTAATTTTTTATTTTTTTTTTTTATTTTATTTAAACTTTTAATATAATTAAATTTATTAAAAAATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaa                                                                                       <  2:348682/127‑1 (MQ=255)
                                              atatAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACATAAAATTTTTAAAAAAaattaa                                                                                   >  1:2680517/1‑128 (MQ=255)
                                                 taAATTATCTAATTTTTTTTTTGTTTTTATTATTTTTTTTATACTTTTAATATATTTAATTTAAATAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                                                <  1:2984842/128‑1 (MQ=255)
                                                 taAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAAAATTTTTAAAAAAAataaatta                                                                                >  1:2950828/1‑128 (MQ=255)
                                                  taattatttaattatttTTTTTTATTTATTTATTTATTTTTCCATTTAATTTAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                                                <  2:2240697/127‑1 (MQ=255)
                                                  taaTTAGATAAGTATATATTTGGATTGTTTAGGTTATATATACTTTTAATATAATTTATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                                                <  2:2146875/127‑1 (MQ=255)
                                                   aaTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑ATT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTATTAAAAAAAAtaaataaaa                                                                              >  1:3160396/1‑127 (MQ=255)
                                                       aGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATAAATAATATTTTTAAAAAAAAttaattaatta                                                                            >  1:2648405/1‑125 (MQ=255)
                                                        gCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAAAATTATTAAAAAAAAtaaataaataatat                                                                         >  2:55600/1‑122 (MQ=255)
                                                           atttattttttAGGATTTATTATTTTTTTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGAttt                                                                    <  1:756788/125‑1 (MQ=255)
                                                           aaGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTGTTAAAAAAAaaaaattattaattgat                                                                       >  1:729199/1‑119 (MQ=255)
                                                            tttatttattAGGATTGTATTTTTTTTTTATAATTTTAATATAATGAATTTTATTTTAATTTTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATtta                                                                   <  2:2726220/126‑1 (MQ=255)
                                                             tttttttttAGTATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTTAAAAAATTTATTTAATTAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATtta                                                                   <  1:955547/125‑1 (MQ=255)
                                                              tatttttttttattgattATTTTATTTATACTTTTAATAAAATTAATTAAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATttat                                                                  <  1:2852003/117‑1 (MQ=255)
                                                              tatttattAGGTTTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATttat                                                                  <  1:334512/128‑1 (MQ=255)
                                                              tatttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAAAATAATTAAAAAAAAaaaattaataattaaattaa                                                                   >  1:1466423/1‑116 (MQ=255)
                                                              tatttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAATAAAATTTTTAAAAAAAAttaattaaaaaataataaaa                                                                   >  2:1439433/1‑116 (MQ=255)
                                                                tttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑ACATAATATTTTTAAAAAAAATAAATAAATT‑ATTTATTTATTaa                                                               >  1:6430/1‑128 (MQ=255)
                                                                tttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTaa                                                               <  2:2996826/128‑1 (MQ=255)
                                                                     tattttttattattTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAAtatt                                                          <  1:1109979/120‑1 (MQ=255)
                                                                       ggATTGATTAGTTTATTTATCCCTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAATTAAATAAAA‑AATAATTAATTAAAtatta                                                         >  1:2321354/1‑128 (MQ=255)
                                                                         ttttattattTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATattatt                                                       <  2:2482972/124‑1 (MQ=255)
                                                                          ttgattATTTTTTTTATATTTTTAATATAATTTATTTAATTAAATTATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAtttt                                                     <  1:3058453/128‑1 (MQ=255)
                                                                          ttgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAACAAAAAATTTTTAAAAACAATAAATTAATA‑ATTTATTAATTAAAAattatta                                                      >  1:1614184/1‑127 (MQ=255)
                                                                          ttgattAGTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAttt                                                      <  2:1074310/128‑1 (MQ=255)
                                                                           ttattattTTATTTATACTTTTAATAAAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAAtattat                                                        <  2:3085505/126‑1 (MQ=255)
                                                                           tgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAATAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATT‑ATTAATTAAATAAATAATAtatt                                                     >  2:818934/1‑128 (MQ=255)
                                                                           tgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATAATATTTTTAAAAAAAATTAATAAATT‑ATTTATTTATTAAATATTAatta                                                     >  1:806754/1‑127 (MQ=255)
                                                                            tattattTTTTTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAttttt                                                    <  2:2450233/127‑1 (MQ=255)
                                                                             attattTTATTTATTCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTAtttttt                                                   <  1:2625952/128‑1 (MQ=255)
                                                                             attAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTAAAAAAAAATTAAAAAAAA‑ATAAATTTATAAAAAATTAattttt                                                   >  1:1933984/1‑128 (MQ=255)
                                                                                   ttatttatACTTTAAATATAATTAATTTAATTAAAATTTTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAAt                                            <  1:2492344/128‑1 (MQ=255)
                                                                                     atttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATT‑ATTTATTTATTAAATATTATTTTTTaaaaaa                                             >  1:2396544/1‑128 (MQ=255)
                                                                                     atttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAATTTTTAAAAA‑AAATAATTAAATAAATTTTTTTATAAATATTATTTTTTAAAAAAt                                            >  1:1656722/1‑128 (MQ=255)
                                                                                      tttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCCCAAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑GTTGATTTATTAATTATTTTTTTTTAACAAAt                                            >  1:3017232/1‑128 (MQ=255)
                                                                                      tttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTATTTTAAAAAAAAATAAATTAATT‑ATTTATTTATTAAATTTTTTATTTAAAAAAAtt                                           >  1:2013796/1‑128 (MQ=255)
                                                                                       ttatCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAATACATAATATTGTTAAAAAAAATTAATTAATT‑ATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAAATTaa                                        >  2:633792/1‑127 (MQ=255)
                                                                                          attttttAATATAATTTATTTAATTAAAATTTTTT‑‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                      <  2:1116791/125‑1 (MQ=255)
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                                                                                                            tttaaatAAAATAATTT‑‑A‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtc                   <  1:1706660/128‑1 (MQ=255)
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                                                                                                               aattaaAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACATAATATTGTTAAAAAAAATTATTTAATT‑ATTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTTAAATTTAAATAAATTatattttcat                 >  2:2835007/1‑119 (MQ=255)
                                                                                                                  taaAAAATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCa              <  2:1007907/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                   aaaaTATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCCCTAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAAGT‑ATTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAAAAATTAACCTTTAGATAAATTAGCGTTtcatactc             >  2:942187/1‑122 (MQ=255)
                                                                                                                     aaTATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAATTTTATTAAAAACAATAAATTATGT‑ATTGATATTTTAAAATTTATATTTTAACAAATGTACCTTGAGCTATAATAGCATTtactcaccat           >  1:1798566/1‑123 (MQ=255)
                                                                                                                      atatTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑ATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACATTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACGttt         >  2:2032999/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                        atTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTa        <  2:403968/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 t‑aataaAAAAATATAAAAACAAGTCATAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCa  <  2:1826438/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 |                                                                                                                                 
TTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGT‑CTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCA  >  CP016816/105234‑105488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.