| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 143769 | 4160 (1.140) | 231 (0.070) | 82/226 | 56.6 | 5.8% | intergenic (+28/‑134) | JCVSYN2_00565/JCVSYN2_00570 | acetate kinase/phosphoenolpyruvate‑‑protein phosphotransferase |
| ? | CP016816 | = 143772 | 3772 (1.150) | intergenic (+31/‑131) | JCVSYN2_00565/JCVSYN2_00570 | acetate kinase/phosphoenolpyruvate‑‑protein phosphotransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 4349 total aligned reads displayed.
TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTATTTATTTTATAGTAAGGAT > CP016816/143642‑143896 | taAATTAATTTCTATTGAAGAATCAAAAATTACAGTTTATGCTATTATAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTATATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCtt < 1:3687789/128‑1 (MQ=255)taAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCtt < 1:6675154/128‑1 (MQ=255)taAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCtt > 1:2763796/1‑128 (MQ=255) aaaTTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAAGAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTa > 2:7044726/1‑128 (MQ=255) aattaattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTaa < 2:4235428/128‑1 (MQ=255) aattaattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTaa < 2:6539306/128‑1 (MQ=255) ttaattTCTAGTGAAGAATCATAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAATATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTaaaa < 2:6722906/128‑1 (MQ=255) ttaattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCttttta < 1:4498417/128‑5 (MQ=255) ttaattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTaaaa > 2:2737689/1‑128 (MQ=255) ttaattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTaaaa < 2:3194177/128‑1 (MQ=255) taattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTaaaaa < 1:6008669/128‑1 (MQ=255) aattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAg > 2:1355169/1‑128 (MQ=255) aattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAg > 2:5970644/1‑128 (MQ=255) aattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAg > 1:1367728/1‑128 (MQ=255) aattTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAg > 2:3899915/1‑128 (MQ=255) tCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTaa < 2:6405888/128‑1 (MQ=255) aGTGCATAATCAAAACTTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGACAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATATTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGtt < 2:5126175/128‑1 (MQ=255) tGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGtttt < 1:5573841/128‑1 (MQ=255) agaaTCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTttaa > 1:68715/1‑128 (MQ=255) agaaTCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGATAAGTTTttaa > 2:7739253/1‑128 (MQ=255) aaaTTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTATAAAGATTAGTATttaatattaata > 1:956402/1‑128 (MQ=255) aaaTTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTttaatattaata > 2:625125/1‑128 (MQ=255) ccAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTATTATTAATAaaaga > 1:7018666/1‑128 (MQ=255) ccAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATaaaa > 2:1075454/1‑126 (MQ=255) tttATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGt < 2:2590661/128‑1 (MQ=255) ttATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAaaagaaagat > 2:4381027/1‑126 (MQ=255) ttATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGta > 2:3016909/1‑128 (MQ=255) aTGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGtaat > 1:1002174/1‑128 (MQ=255) tGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGtaata > 2:3667532/1‑128 (MQ=255) tGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGtaata > 2:869057/1‑128 (MQ=255) tGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGtaata > 1:571924/1‑128 (MQ=255) tGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGtaata > 2:7370683/1‑128 (MQ=255) cTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATaaa < 1:3174894/128‑1 (MQ=255) agtaCAAATGAAGAAAATATGATTTGTTTAGATACTTTAAAATTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAattatt < 1:4372112/125‑1 (MQ=255) aGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAattatt < 1:4660269/128‑1 (MQ=255) aGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAattatt < 1:6503434/128‑1 (MQ=255) aGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAATTTTTAATATTAATAAAATAAAGTAATAAattatt > 1:5874853/1‑128 (MQ=255) aaaTGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAAt > 2:5682856/1‑128 (MQ=255) aTGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTc < 1:4933327/128‑1 (MQ=255) tGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCa > 2:7494787/1‑128 (MQ=255) aagaaAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCaaa > 1:4227225/1‑128 (MQ=255) gaaAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAAtt > 2:5262632/1‑128 (MQ=255) gaaAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAAtt > 1:1115880/1‑128 (MQ=255) gaaAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAAtt < 1:393423/128‑1 (MQ=255) aaaaaTGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGa > 2:5390987/1‑128 (MQ=255) aaaaTGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATTTTAATAATAGAAAGTAATAACTTATTATAATTCAAAATGAt > 1:7271276/1‑128 (MQ=255) aaaTGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTTTTATAATTCAAATTGAtt > 1:7405696/1‑128 (MQ=255) caTGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGAAATAATAGTTAAAAAACTTAGCATAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATta < 1:2209007/127‑1 (MQ=255) aTGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATtat < 2:6136242/128‑1 (MQ=255) aTGATTTGATTAGATACTTTAAACTTAAATAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATtat < 1:7684788/128‑1 (MQ=255) aTTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATaaa > 2:1205181/1‑128 (MQ=255) aTTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATaaa < 2:788131/128‑1 (MQ=255) tttGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAg < 1:2330695/128‑1 (MQ=255) tttGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAAATGATTATAAAg > 1:4080661/1‑128 (MQ=255) tGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAgtt > 1:815198/1‑128 (MQ=255) tGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAgtt < 1:7828800/128‑1 (MQ=255) gattAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTAATATTAAAAAGCTAAGATTTTAATAATAAAAAAATAAAGTAATAAAATATTATAAATCAAAATGAATATAAAgaaa > 1:5419858/3‑125 (MQ=255) tttAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAgttgt < 1:6329151/128‑1 (MQ=255) ttAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAgttgtt > 1:4811511/1‑128 (MQ=255) tAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGttt > 2:2270369/1‑128 (MQ=255) aGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGtttt < 1:2471855/128‑1 (MQ=255) aGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGtttt < 2:2880719/128‑1 (MQ=255) gATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAATTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGattat > 2:3517083/1‑126 (MQ=255) taatttAAAATTAATTAAATAAAAGATATTATATTTAAAAAACTTAGCTTTAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGTAAGTAATAAAATATTTTAATTCAAATTGATTATAAAGTTGttttttt < 2:4982286/125‑1 (MQ=255) tACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATaaa > 2:3793227/1‑117 (MQ=255) aaCTTAATTAAATAAAAGATATTATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTtag < 1:3422172/128‑1 (MQ=255) aaCTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTtag < 1:6768449/128‑1 (MQ=255) aattaaATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTta > 1:753634/1‑122 (MQ=255) aattaaATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGAt < 2:7196635/128‑1 (MQ=255) attaaATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGAtt < 2:2417725/128‑1 (MQ=255) attaaATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGAtt < 2:581647/128‑1 (MQ=255) taaataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTaa < 1:5101617/128‑1 (MQ=255) aataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATtat > 2:5535816/1‑97 (MQ=255) aataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTaaaa > 1:1627528/1‑128 (MQ=255) aataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATAATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGATTTATAATCTTAGTAGATAaaaa > 1:3317286/1‑128 (MQ=255) ataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATaaa > 2:6856537/1‑99 (MQ=255) ataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAAt > 1:3548415/1‑128 (MQ=255) ataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAAt > 2:1966765/1‑128 (MQ=255) ataaaAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAAt > 2:7604742/1‑128 (MQ=255) aatgATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATtaa < 2:1861948/125‑1 (MQ=255) aaaGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATtaa > 2:171537/1‑128 (MQ=255) aaGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATtaat < 1:1236160/128‑1 (MQ=255) aGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTTATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATtaata > 2:1545307/1‑128 (MQ=255) aGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATACAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATtaata > 1:2618870/1‑128 (MQ=255) gATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATtaataa > 2:3358713/1‑128 (MQ=255) ataataGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAg < 2:455231/128‑1 (MQ=255) ataataGATAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAg < 1:5256014/128‑1 (MQ=255) taataGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGt > 1:1783635/1‑128 (MQ=255) aataGTTAAAAATCTTAGCTTATAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGATAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGtt < 2:4085109/128‑1 (MQ=255) taGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGttat > 1:1910681/1‑128 (MQ=255) taGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGttat < 1:3806837/128‑1 (MQ=255) aGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGttatt < 2:4817763/128‑1 (MQ=255) ttAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTTTTTTTTTATCTTTGTAGATTAAAATTATTAATAGttatttt > 1:1509904/1‑127 (MQ=255) tAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGttatttat > 1:7131840/1‑128 (MQ=255) aaaaaCTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAACTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTatttattt > 1:616457/1‑128 (MQ=255) aaaCTTAGCTTAAAAATCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAATTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTAtttatttta < 2:2121814/128‑1 (MQ=255) ttAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTATTTATTTTATAGt < 1:2927488/128‑1 (MQ=255) ttAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTATTTATTTTATAGt < 1:3035584/128‑1 (MQ=255) gCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTATTTATTTTATAGTAAg > 1:2015380/1‑128 (MQ=255) gCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTATTTATTTTATAGTAAg < 2:4701945/128‑1 (MQ=255) | TAAATTAATTTCTAGTGAAGAATCAAAAATTCCAGTTTATGCTATTAGAACAAATGAAGAAAAAATGATTTGTTTAGATACTTTAAACTTAATTAAATAAAAGATATAATAGTTAAAAAACTTAGCTTAAAAAGCTAAGTTTTTAATATTAATAAAAGAAAGTAATAAATTATTATAATTCAAATTGATTATAAAGTTGTTTTTTTATCTTAGTAGATTAAAATTAATAATAGTTATTTATTTTATAGTAAGGAT > CP016816/143642‑143896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |