| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 311155 = | 347 (0.380) | 167 (0.220) | 106/210 | 13.8 | 38.7% | intergenic (‑78/‑236) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| ? | CP016816 | = 311148 | 238 (0.310) | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
TAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/311299‑311155‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatatatatatatatatataATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < CP016816/311148‑311022 TAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATAT < 2:443305/128‑1 TAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACTGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATA > 2:1206392/1‑128 TAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATA > 2:1972051/1‑128 ATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATA > 1:1946776/1‑128 TTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATA > 2:1592519/1‑128 TTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATAT < 2:1344956/128‑1 TTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACTGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTTCAT‑‑TATATATATATA < 2:643617/128‑1 TCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTCACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATAT > 2:1438851/1‑128 taaatatCTTTTTTTAATAAAAATAGATTTTTTTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATATACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTAGATATTGCTT‑‑TATATATATATATA < 2:1628842/121‑1 CAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATA < 2:1130270/128‑1 TTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATA > 2:1540787/1‑128 taaTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTATTAAATAATTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTTCTTTATAAACGGTTTCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATAT < 1:963032/125‑1 TACTTTTTTAAATAAAAATATATTATATTAGTAAATAAGTAGTATATTAACTA‑TTTTTTTAATATATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATAT < 2:140521/128‑1 TACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATAT > 1:838093/1‑128 ACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATA > 2:239267/1‑128 CTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAA > 1:582816/1‑128 TTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAAT > 1:412962/1‑128 TTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAA > 2:799704/1‑128 AAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTAT < 2:1797016/128‑1 AATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTA < 1:1607955/128‑1 ATAAAAATATATTTTATTAGTAAATAATTATTATATTTAATA‑TTTTTTTACTTTATAAACGTTTGCTATTATAACATATTTTAATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTAT < 1:1206392/128‑1 AAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTAATTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCATTATATATATATATATATATATAATGAATGTAT < 1:688757/128‑1 AAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACTGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTA < 2:691108/128‑1 AATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTAT < 2:862058/128‑1 ATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATA > 2:1845279/1‑128 ATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATA < 1:799704/128‑1 atATTTTATTAGTATATTAGTTGTATATTTAATA‑TTTTTTTAATTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTAAATATTTAAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATA < 1:389295/126‑1 TTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGTTTGATATTATACCATATTTTCATTTACATATTTCATTATATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATG < 2:1173314/128‑1 TTAGTAAATAAGTTGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACTGTTGATATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGA < 1:573459/128‑1 TTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTCCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAAAGAATATATGTTATATATGTTTTGA > 2:1296801/1‑128 GTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCATTATATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAA < 2:1597768/128‑1 TAAATAATTATTATATTTAATA‑TTTTTTTAATTTATAAACTGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTTCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCG < 1:467929/128‑1 TAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATATATGATATATATGTTTTGAATag > 2:339009/1‑126 AAATAAGTAGTATATTTATTA‑TTTTTTTAGTTTTTATACGGTTGCTATTATATCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TTTATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGT < 2:1278907/128‑1 ATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTAT < 1:1597368/128‑1 TAAGTTGTATATTTATTA‑TTTTTTTATTTTATAAACTTTTGCTATTATAAAATATTTTAATTTACATATTGCAT‑‑TTTATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATG < 1:1323636/128‑1 TAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATTAATCTATTATATATATTTTTTTAATCTTATa > 1:167118/1‑127 AGTAGTATATTTATTA‑TTTTTTTTCTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTA < 2:495586/128‑1 AGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATAACATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAAC < 1:1111541/128‑1 tTATATTTAATT‑TTTTTTTACTTTATAAACTGTTGCTATTATACCATTTTTTCATTTACATATTTAAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATAGTATGTAACAA < 1:116708/127‑1 GTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAA‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAA < 1:1615840/128‑1 ATATTTACTA‑TTTTTTTAATTTATAAACGGTTGCTATTATACAATATTTTCATTTACATATTGCATTATATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAA < 1:904472/128‑1 TATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATAATATGTAACAAGTA > 1:597482/1‑128 TTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGATATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTT < 1:845728/128‑1 tCTA‑TTTTTTTACTTTATAAACTTTTTATATTATACCATATTTTAATTTAAATATTGAAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTA < 2:1740688/127‑1 aaTA‑TTTTTTTTCTTTATAAACTGTTGCTATTATACAATATTTTCATTTAAATATTGAAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTA < 1:1505246/126‑1 ACTA‑TTTTTTTACTTTATAAAAGGTAGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTA < 1:525354/128‑1 CTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTAT < 1:1731871/128‑1 TTTTTTTTATTTATATACGGTTGCTATTATACTATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACTAGTATTTTATTTT < 2:1009399/128‑1 TTTTTTTACTATATAAACTGTTGCTATTATAACATATTTTCATTTACATATTGAATTATATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATT < 1:260038/128‑1 TTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTT < 2:1882447/128‑1 TTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATATTATGTAACAATTATTTTATTTTTTAAT > 2:70992/1‑128 TACTTTATAAACGGGTGCTATTATAACATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATA < 2:94635/128‑1 TACTTTATAAAAGGTTTATATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAA‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAGCAAGTATTTTATTTTTTAATA < 1:1065949/128‑1 TTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATTTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGt > 2:1948570/1‑127 TTATAAACTGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGG < 1:234166/128‑1 ATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGT > 1:18595/1‑128 TAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGTTG > 2:1492507/1‑128 TAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATAAATATATATA‑AAT‑AATGTATGTTATATATTTTTTGAATCTTATGTAACAAGTATTTTATTTATTAATAAGttttgtt > 2:1320052/1‑121 aaaattTTGCTATTATAACATATTTTTATTTAAATATTGAAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGT < 2:167118/122‑1 GCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATG > 2:874883/1‑128 GCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAA > 2:741988/1‑128 CTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGA > 2:38840/1‑128 TATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTAGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGTTTTGTGTAAAATAAA > 1:155955/1‑128 TTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCTTATGTAACAATAATTTTATTTTTTAATAAGTGTTGTGTAAAATGAAAA > 2:1527088/1‑128 TTATACCATATTTTCATATAGATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAG < 2:1046319/128‑1 TATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGT < 1:1496491/128‑1 TACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGTGTGTGTAAAATGAAAAAGT > 1:1186901/1‑128 TACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATATTATGTAAAAAGTATTATATTTTTTAATAATTTTTTTGTAAAATGATAAAtt > 2:840556/1‑126 TTTTCATTTACATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAA > 2:540039/1‑128 TTTGATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGGGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACA < 2:1717535/128‑1 TTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACA < 2:426239/128‑1 ATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTT < 1:1364372/128‑1 TTTACATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATTTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGTGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAA > 1:1693519/1‑128 TTACATATTGCAT‑‑T‑T‑TATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAG < 1:983329/128‑1 ACATATTGTAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAG < 1:1806735/128‑1 ACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAATTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAG > 2:296110/1‑128 CATATTGCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAATTATTTTATTTTTTAATAATGGGTGTGTAAAATTAAAAATTTAATTAAAATTTTAATTTC > 1:730384/1‑128 AT‑‑TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGG > 1:1431348/1‑128 TATATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATTTGTTTTGAATCTTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTTATATGGGGTGTTTAATATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTAATTTGttt > 2:1227914/1‑125 tTATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATT < 1:428005/127‑1 TATATATATATATATATAATGTATGTATGTTATATATGTTTTGTATCGTATGTAACAAGTACTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTA < 1:171153/128‑1 ATATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAG < 2:1503324/128‑1 ATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGTATATTATTTAAAAAGTATTTTATTTTTTAATTAGGGGTGTGTAAAATTAAAAATTTAATTACAATTATATGTTAATTTGTATTAGTT > 2:569992/1‑128 ATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTT < 1:339009/128‑1 ATATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATAGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGTGGTGTGTAAATTTAAAAAGTTAAATAATATTTTAATTTAATTTGTATTAGTT > 1:1018383/1‑128 TATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTTAATCGTATGTAACAAATATTTTATTTTTTAATAATGTGTGTGTAAAATTAAAATGTTTATTACAATTTTAAGTTCTTTTTGATTAGTTt > 1:1090809/1‑127 TATATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAAT < 2:1614801/105‑1 TATATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAATTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGTATTAGTTATT > 1:1849339/1‑128 ATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACA < 2:1936580/128‑1 ATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACA > 1:322605/1‑128 ATATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACA < 2:1367839/128‑1 TATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACTAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACATTTTTAAGTTCATTTGGTTTAGTTATTACAA < 2:1059132/128‑1 ATATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAAC > 2:779332/1‑128 ttTATATTGAATTTATTTTATATATGTTTTGAATAGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTTCAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACT < 2:588871/126‑1 ATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGT < 1:1380266/128‑1 ATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGT < 1:1972051/128‑1 ATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGT < 1:652973/128‑1 AATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTATCAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < 2:1561801/128‑1 AATGAATGTATCTTATATATGGTTTGAATCGTATGTAAAAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGTGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < 1:125830/128‑1 TAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTA‑TTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/311299‑311155‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatatatatatatatatataATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < CP016816/311148‑311022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |