| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 437885 = | 1838 (0.590) | 108 (0.040) | 64/202 | 52.1 | 7.0% | intergenic (‑189/+233) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 437880 | 1399 (0.550) | intergenic (‑184/+238) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 821 total aligned reads displayed.
ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑at‑‑a‑‑tat‑‑atatatatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCGACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATTCTGATCGCTTGCA > 2:1319731/1‑128ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCA > 1:72462/1‑128ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCA > 1:5428047/1‑128ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGAACAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCA > 1:3882303/1‑128ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTAACCATTTTATGCTTATCTATTGCA > 2:67710/1‑128 TGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT > 2:4101741/1‑128 TGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT > 2:3393101/1‑128 TTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑T > 2:6128222/1‑128 TTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑T > 1:807843/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTTTCTTTATAAACTATAAAAAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCTCCAATTTATGCTGATCGATTTCAT‑‑A‑‑TAT‑‑A > 1:922182/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACGATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑A > 2:4668226/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑A > 2:323579/1‑128 AAAATATTAATTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑AT < 2:2499145/128‑1 AAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAATACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATA > 2:2769750/1‑128 AAATATTAAGTATTAAAATATTTAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAATCTACAAATTTACGACCGACTCAGATCAAAATTTCACCATATTATCCTCATCGCTAGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATA > 2:4351108/1‑128 AATATTAATTTTTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAACTTTATAAACTATATATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATAT < 2:797380/128‑1 AATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATAT > 1:6545944/1‑128 ATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTTCAT‑‑A‑‑TAA‑‑ATATc > 1:4451226/1‑127 ATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTAACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TCT‑‑ATATATA > 2:2010979/1‑128 TTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATAT > 1:1004893/1‑128 TTAAGTATTAAAATATAAAAAATCTACATTATTAACTTTATACACTATAAATAAAAACTACACATATAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATAT < 1:3478204/128‑1 aattaTTAAAATATTAAAAATATAAAATATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATATAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATAT < 1:2400058/123‑1 AAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGAACAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATAT > 1:3812651/1‑128 agaTTTAAAATAATAAAAATCTAAATTATTAACTATATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACACAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATA < 1:2693382/125‑1 AGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATA > 1:517638/1‑128 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATAT > 2:5966652/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTTACTTTATAAACTATAAATAAAAAATACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT < 2:5385464/128‑1 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT > 2:2373440/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT > 2:707133/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT > 2:5869914/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT > 1:2566480/1‑128 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT < 1:4708737/128‑1 TTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT < 1:998631/128‑1 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATA > 2:181013/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACAATTTTCTGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATAGATATATA > 2:4477805/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCAACATTTTATCCTTATCGCTTCCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATA > 2:3525303/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGAGCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATAAATATATATATA > 1:6405503/1‑128 TTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAAATTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATA < 2:5472885/128‑1 TAAAATTATAAAAATCTAAATAATTAACATTATATACTATAAATAAAAAATACAAATATAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGAGCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATAT < 1:2808446/128‑1 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATAT < 2:4026044/128‑1 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATAT > 1:1516477/1‑128 AAAAAATTAAAAAACTAAATTATTATCTTTATAAACTATAAATAAAAAATACAAATTTAAGAACAACTCAGATATAAATTTCAACATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATA < 1:4987458/128‑1 AAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCAACATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATAT > 1:2485605/1‑128 AAATATTAAAAATATAAATTATTAACTTTATAAAATATAAATAAAAACTATAAATTTAAGAACAACTCAGATATAAATTTCACCATTTTATTCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATAT < 2:2118754/128‑1 ATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGAACGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑AAATATATATATATcataaact > 1:6268440/1‑120 TTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTA < 1:4588164/128‑1 TAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATAT < 1:6086667/110‑1 ATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑ATGTAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTC > 1:3143987/1‑128 TCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATAT < 1:3019835/114‑1 TATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATACA‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTA < 1:5754953/128‑1 AATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCT < 1:129763/128‑1 AACAACAAATAAAACACAAACTCATATATAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGATTGCAT‑‑A‑‑TATAAATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCAT < 2:3826375/128‑1 TACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGAGCGCTTGC‑‑‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAA < 2:374154/128‑1 ACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATATGTAATATGGAGGTTATTGCTTTGCTTCATATCCTA > 1:2174987/1‑128 ACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATAT > 1:3282974/1‑75 AAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTT < 1:6720064/128‑1 ATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTT < 1:4144650/128‑1 ATTTCACAATTTTATGCTGATAGCTTGAAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTATATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTT < 1:3578642/128‑1 TTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATATGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATA < 1:4299565/128‑1 CGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAA > 2:1138942/1‑128 TGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATATTTAATATGGAGGTTTTTTATTTTATAAATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGA > 2:4229353/1‑128 GCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAA < 1:4850768/128‑1 AT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTTGTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAtc > 1:1417517/1‑126 T‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAAGATGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATTATATTTATT‑AATAATGAAACT > 2:6536924/1‑128 T‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACT > 1:3225324/1‑128 T‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACT < 1:550885/128‑1 gcA‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATCAAAC > 2:4809608/3‑128 A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGAGTTTTTTGCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATTAAAaat > 2:3920143/1‑125 TAT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGATTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATATCTAATATTTATT‑AAAAATTAAACTTA > 2:3161214/1‑128 AT‑‑ATATATATATATTTATATCTTTAACTCTATAGGTAATATGGATGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTAC < 2:2699590/128‑1 AT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATATGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGCTTAATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATT‑AAAAATTAAAataac > 2:5639568/1‑123 AT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTAC < 1:167311/128‑1 AT‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTAC < 2:1601830/128‑1 T‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATATGTAATATGGAGGTTTTTGATTTGCTTCATATACTAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTTTTTCTAATATTTATT‑AAAAAAGAAACTAACA > 1:2893031/1‑128 T‑‑ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAAATGAATCTTAt > 1:3996505/1‑127 ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTTATATGGATGTTTATTATTTGATTAATATAATAAAATATTTATTATAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTAaat > 2:2213450/1‑125 ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTTCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAA > 1:5657890/1‑128 ATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAA > 2:668548/1‑128 TATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGAGGTTTTTGATTTGCGTGATTTACTAAAATATTTTTTTTAAAAATAAAATTTTTATATCTAATATTTATT‑AAAAAATAAACTCACAAC > 2:2559081/1‑128 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACT < 1:5306256/128‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAAC < 2:1437825/120‑1 ATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTATATTTATAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAAATAC > 2:5292181/1‑128 ATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTAC < 1:1803865/128‑1 TATCTATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCGTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACA < 2:5742042/128‑1 TATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACA > 1:3336942/1‑128 ATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGATGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAA > 1:3695926/1‑128 ATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAA > 2:5177002/1‑128 ATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAA > 2:2996039/1‑128 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGTATGTTTTTTCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACATACAACTACAAAAA < 1:2023181/128‑1 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA < 2:1690148/128‑1 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA > 1:2305805/1‑128 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA < 1:6831441/128‑1 ATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAAT < 1:11732/128‑1 ATATTTCATTATCTCTATAGGTAATATGTAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTAGTAAAATATTTATTTTAAATATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 2:6371442/128‑1 ATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGT > 2:5082427/1‑128 ATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTat < 1:187534/128‑3 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:4943673/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:2908794/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:3079077/128‑1 TCAATAAATCTATAGGTAATATTGATGTTTTTGCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 1:5897004/128‑1 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCAT‑‑A‑‑TAT‑‑ATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑at‑‑a‑‑tat‑‑atatatatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT‑AAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |