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Only 100 of 2350 total aligned reads displayed.
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1:14182/127‑1 (MQ=255) a‑TT‑‑G‑‑‑AA‑A‑AAAAAA‑AAAAAAT‑AAT‑ATAA‑‑TTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGATTAAATTTAAAAAACCAAGATTTATAAATATTGTTTTTTTTTTTATATTTTTAttttt > 2:4622417/1‑126 (MQ=255) t‑‑G‑‑‑AA‑A‑AAAAAA‑AAAAAAA‑AAT‑ATAA‑‑TTTGCATACTTTAAAAAATTGTTTTTAAAATAATTATTCAGGATTAAATTAAAAAAACCAAGATTTAAAAAAATTGTTTTTTTTTTTTTATTATTATTTGtgt > 1:4542520/1‑126 (MQ=255) | CTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTG‑TTTGGTTTTTTTATTT‑A‑CTA‑TT‑‑G‑‑‑AA‑A‑AAAAAA‑AAAAAAT‑AAT‑ATAA‑‑TTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT > CP016816/34818‑35072 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |