New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_021214 | 157995 = | 182 (0.810) | 10 (0.050) | 7/434 | 13.5 | 5.5% | coding (478/648 nt) | TMARI_RS00740 | lactate utilization protein |
? | NC_021214 | 158204 = | 171 (0.800) | coding (1857/1872 nt) | TMARI_RS00745 | DUF4914 domain‑containing protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GGCGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCTTTTTCATAAGCTTCCTCACCTACTTCGGATTGCAAGTGTGGCTGCAGAAGTTCTTTCGGAATGGTGTTTCCTTCGATCTTCATCTCTTTGAGAGAAAAACCG > NC_021214/157967‑158441 | ggCGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGt < 2:886507/238‑1 (MQ=255) 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agaAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAATCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCt > 2:202930/1‑239 (MQ=255) gaAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATc < 2:145704/237‑1 (MQ=255) gaAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCt < 1:110296/238‑1 (MQ=255) cTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTgaga < 2:46582/237‑1 (MQ=255) cTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCGCCTCAGAGGATGTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGAGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCTGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTgaga < 1:388185/237‑1 (MQ=255) cTGAGATACATCCCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAAGTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTgaga < 1:875142/237‑1 (MQ=255) 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aCTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGAt < 2:405072/220‑1 (MQ=255) aCTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGAt > 1:405072/1‑220 (MQ=255) tattttgggaccacCGTGCACTAAAACAGGACTCTGTGCAGACTGTTCTTCCCCTCAGAGGATCTGTTACGACCTTCTGGTAGTGGAATCTGTGGTGAGCCAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGTGAACTCTCCCCTCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCTTCTAGACAGCACTGga < 1:697855/228‑1 (MQ=255) tCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGgatga > 1:134494/1‑239 (MQ=255) cacgggaccacCGTGGACAAGAACAGGATTGTGTGGAGACTGGTCGTATCCGCAGAGGAGCAGTGACTACTATCTGATAGTGGAAGCTGGGGTGAGCCGGCCGGTAAGGTTGAAGGTGAGTCTGACGCTGGAAAACTTCGAACTTTAAAAAAGCGGGGAATCCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGgat < 2:42728/229‑1 (MQ=255) aaCTCCGTGCACAAAAACATGATTCTGTGCCGATTGTTCTTCTCCTCAGAGGAACTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATGTGTGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCGGACGCTGGAAGACTGCGGACTTTAAAAAAGGGGGGAAAGATCCACGCTTTAAAATTTCATCGGTATGAGCTTGAGATAGTAATCGAGGGAGGAGTCGCCGAGACAGGACTGGATGATTtcg < 2:875443/238‑2 (MQ=255) cacCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCcgtcgt > 1:32270/1‑213 (MQ=255) 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aaaCAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATc < 2:155286/173‑1 (MQ=255) aCTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAAt > 1:723155/1‑239 (MQ=255) ttcttcTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAAttttt > 2:210091/1‑239 (MQ=255) tcttctCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAAttttt > 2:73536/1‑238 (MQ=255) 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tGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCtttt > 2:260494/1‑238 (MQ=255) tGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCtttt > 1:945590/1‑238 (MQ=255) ccGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCTTTTTCATAAGCTTCCTc > 1:2738/1‑239 (MQ=255) 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ttCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCTTTTTCATAAGCTTCCTCACCTACTTCGGATTGCAAg > 2:936802/1‑239 (MQ=255) tGACGCTGGAAGTCTTCGTCCTTTAAAAAAGCGTGGCATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGTTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGTATTCAGTTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGTCACCTTTTTCATAAGCTTCCTCACCTACTTCGGATTGCAAgtgt < 2:2140/239‑1 (MQ=255) tGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCTTTTTCATAAGCTTCCTCACCTACTTCGGATTGCAAgtgt > 1:481614/1‑239 (MQ=255) 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GGCGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCTTTTTCATAAGCTTCCTCACCTACTTCGGATTGCAAGTGTGGCTGCAGAAGTTCTTTCGGAATGGTGTTTCCTTCGATCTTCATCTCTTTGAGAGAAAAACCG > NC_021214/157967‑158441 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |