New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_021214 | 157995 = | 251 (0.880) | 9 (0.030) | 6/430 | 23.1 | 3.6% | coding (478/648 nt) | TMARI_RS00740 | lactate utilization protein |
? | NC_021214 | 158204 = | 246 (0.900) | coding (1857/1872 nt) | TMARI_RS00745 | DUF4914 domain‑containing protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GGCGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCACGGGATTCAGGTCTTCGGTCAGGAATTTTTTCAGTTCTCTCTTGAAGAAGTCTTTCAACTCTTGGGCACCTTTTTCATAAGCTTCCTCACCTACTTCGGATTGCAAGTGTGGCTGCAGAAGTTCTTTCGGAATGGTGTTTCCTTCGATCTTCATCTCTTTGAGAGAAAAACCGA > NC_021214/157967‑158442 | ggCGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTa < 1:721766/239‑1 (MQ=255) ggCGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTAt > 2:259751/1‑240 (MQ=255) cGAGAGAAAGGCTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATg < 2:939723/239‑1 (MQ=255) cTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGAt < 1:947083/238‑1 (MQ=255) cTGAGATACATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGAt < 2:354282/238‑1 (MQ=255) attACATGTCGCCGATGAATTCGAAACAACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTTTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCATAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCa < 1:977471/237‑1 (MQ=255) cATCTCTCCGATGAATTCGAAACGACTGAATCTGGAAACACCGTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCgag > 2:429510/1‑240 (MQ=255) 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1:375633/1‑240 (MQ=255) gTGCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCCAc > 1:574026/1‑240 (MQ=255) gCACAAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGATAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTTCTCTTCCAACgg > 1:860530/1‑240 (MQ=255) caAAAACAGGATTCTGTGCAGACTGTTCTTCTCCTCAGAGGATCTGTGACTACTTTCTGGTAGTGGAATCTGGGGTGAGACAGCCGGGAAGGTTCAAGGTGATTCTGACGCTGGAAGACTTCGGACTTTAAAAAAGCGGGGAATTCTCCCCGCTTTAAAAATTCATCGGTATGATCTTGAGCTAGTCATCGAGAGATCCGTCGTCGAGACAGCACTGGATGATTtctc > 1:1142729/1‑228 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |