New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_021214 | = 1478798 | 118 (0.370) | 96 (0.300) +AAAGAATTTT |
70/410 | 4.0 | 44.5% | coding (22/1281 nt) | TMARI_RS07485 | HD domain‑containing protein |
? | NC_021214 | 1478799 = | 127 (0.380) | coding (23/1281 nt) | TMARI_RS07485 | HD domain‑containing protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_021214/1478561‑1478798 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTTGAACCCGTT > NC_021214/1478799‑1479033 |||||||||| gtGCGAAGCACTGAAATAAAGCAACGAAAGGGTGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATTAAAATAGTCCTTGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGAGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTTTCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGTAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGA < 2:474265/237‑1 GAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGA > 1:1417341/1‑239 GAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGGAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGA > 1:1439039/1‑239 GCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAA > 1:500106/1‑239 CGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAG > 2:76371/1‑239 AGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAAT > 2:1186218/1‑239 TGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAA > 2:258960/1‑239 TAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAAT < 1:258960/239‑1 AGCAACGCAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAACCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAATAATTT > 2:1161421/1‑238 AGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTT > 2:780563/1‑239 GGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCC < 2:455479/238‑1 GAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCT < 2:815737/238‑1 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GAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTT < 2:1106716/239‑1 TAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCT < 1:135995/200‑1 TAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCT > 2:135995/1‑200 AGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTT > 1:1182114/1‑236 AGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCG < 2:147925/223‑1 AGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCG > 1:147925/1‑223 TCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTTTGATTT > 1:620601/1‑239 CGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTT > 2:745899/1‑239 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CCTGCTCGGCACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGCGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGACTTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGA > 2:1086914/1‑239 CTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGA < 2:298474/238‑1 CTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGA < 1:1072337/238‑1 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TGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATT > 2:705293/1‑239 CAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCAT < 2:500106/238‑1 TTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTCATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTAAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAAT < 1:688436/238‑1 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ATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCT < 2:1182114/239‑1 TGATATAATCACTATATTGACGGTTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTCGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCA < 1:64628/239‑1 TGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCA < 2:1439039/239‑1 TGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTC > 2:144298/1‑238 TAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGT > 1:52160/1‑239 AATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTG > 2:796085/1‑239 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1:1306707/1‑239 ATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATT > 1:406011/1‑237 TTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCT < 2:1447786/239‑1 TTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCT < 2:252972/239‑1 TGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTTAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTA > 2:1458599/1‑239 TGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTA > 2:878732/1‑239 TGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGAT > 1:75788/1‑178 TATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAA > 1:551314/1‑239 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CTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTT < 2:2678/239‑1 CCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAG > 1:604985/1‑239 GTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTAC < 1:829359/239‑1 TCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTG > 2:361540/1‑239 TCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTGGAGTTTACAGGTG > 1:1420689/1‑239 AGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAA < 2:555856/239‑1 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TGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCT > 2:1091678/1‑238 AGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTT > 2:554825/1‑238 AGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTT > 1:371951/1‑238 AGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTT > 2:702013/1‑238 AGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTT > 2:122193/1‑238 CTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAAC > 2:509618/1‑239 CTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAAC > 2:313773/1‑239 CTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTATCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTATACCAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAAC > 1:876487/1‑239 TGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACAT > 2:518175/1‑239 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GAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGC > 2:49642/1‑238 ATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCT < 1:920399/237‑1 TTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGTCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTAAAGGTGGAAAATTGGAAACTTCTGCTGTTTTAATTGTGAACATCTTACCAGCAGCTCTT > 1:617755/1‑239 CAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTT > 1:1331429/1‑239 AAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTTGAA < 1:403132/239‑1 AAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTTGAAC < 2:604985/239‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |