| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | = 1478798 | 118 (0.370) | 96 (0.300) +AAAGAATTTT |
70/410 | 4.0 | 44.5% | coding (22/1281 nt) | TMARI_RS07485 | HD domain‑containing protein |
| ? | NC_021214 | 1478799 = | 127 (0.380) | coding (23/1281 nt) | TMARI_RS07485 | HD domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTTGAACCCGTTA > NC_021214/1478561‑1479034 | gAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑a > 2:102347/1‑239 (MQ=255)gAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑a > 1:1417341/1‑239 (MQ=255)gAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGGAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑a > 1:1439039/1‑239 (MQ=255) tGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAAttttaa > 2:258960/1‑237 (MQ=255) aaGAAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAACATAGTCCTAGTTCTTGGGAGACTGCTCGGAACACTGATGGCATTTGTTGGGGGCACCCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGACCTCGTAGTTTTAAGCCCCCATGACTTTGAAAGGCGTGACAATTCTTGATACAGAATACGAATTACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACGAAATTTGTAAATTTa > 1:86433/1‑239 (MQ=255) aGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAAttttaaagaatttt > 2:780563/1‑229 (MQ=255) aaCGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAAACAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTcc < 2:1380192/239‑1 (MQ=255) ggggAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCAt > 2:1059185/1‑238 (MQ=255) aaGGCATTAGAAAGCTGATGATAATTGTCCTGCTGCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTTATGGCAGTTTTTGGGGGCCACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCg < 1:802631/238‑1 (MQ=255) aaGCCATGAGAACGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCg < 1:977265/238‑1 (MQ=255) tCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTAtttctttc < 2:383393/238‑1 (MQ=255) aGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTAtttctt > 1:1182114/1‑236 (MQ=255) cacaggttttGGGCGACTGGTAGAAAGACAGATTGCAGTTGTGGGGGAGTACAAGATTTAAGAATAGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATTCTCGGGACCTCGTATTGCTTAGCGCACATGATTCTGAAAGTAGTGACTATTCTTGAGAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAAATTTTCTTAATTTATTCCGTGTCCATTCTCGAATTCTATTTCTTTCTGTTTTGTATGTTc < 1:1025359/231‑1 (MQ=255) cGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGAtttt > 2:745899/1‑239 (MQ=255) tCTTTGGAGCCTGCTCCGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGTTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGa < 1:399628/238‑1 (MQ=255) tCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGa < 1:316512/238‑1 (MQ=255) tGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGt > 2:1255407/1‑238 (MQ=255) tGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTAATCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGtt < 1:1281041/239‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGc < 1:830235/238‑1 (MQ=255) cTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGa < 1:1072337/238‑1 (MQ=255) cTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGa < 2:298474/238‑1 (MQ=255) gCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGgatgat < 2:1152587/239‑1 (MQ=255) aaCACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACgg < 2:38008/238‑1 (MQ=255) tGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGc < 2:54981/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATAc > 2:321221/1‑173 (MQ=255) gCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGtt > 2:498146/1‑239 (MQ=255) aGTTGTGGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATGGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTa < 1:825568/238‑1 (MQ=255) ttgttgGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTCATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTAAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAAt < 1:688436/238‑1 (MQ=255) gggggCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCtt > 2:1104984/1‑237 (MQ=255) tttGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGc < 2:1417341/236‑1 (MQ=255) tttGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCa < 2:880538/238‑1 (MQ=255) tGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCa < 2:1188814/239‑1 (MQ=255) 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tCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTa < 1:780563/239‑1 (MQ=255) tataTTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAg > 2:161426/1‑164 (MQ=255) tataTTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAg < 1:161426/164‑1 (MQ=255) tataTTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGat > 1:628015/1‑234 (MQ=255) tataTTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGat < 2:628015/234‑1 (MQ=255) tataTTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATAtt > 1:763175/1‑237 (MQ=255) gACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAAc > 2:653274/1‑239 (MQ=255) 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aCGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACa > 2:833573/1‑239 (MQ=255) aCGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACa > 2:238064/1‑239 (MQ=255) aCGATTGGTAATTATGCCACTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGatat > 1:1306707/1‑239 (MQ=255) aTTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATAtt > 1:406011/1‑237 (MQ=255) aTTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGTATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGACCaaaa > 1:1138197/1‑239 (MQ=255) aTTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACaaaa > 1:524522/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |