| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | = 1805887 | NA (NA) | 6 (0.020) +TTCTCGCTCCCTGTGCTAATTGTAACACAGTCGAGCTACAACAACCACTTA |
5/348 | 19.5 | 1.7% | coding (374/390 nt) | TMARI_RS09375 | IS200/IS605 family transposase |
| ? | NC_021214 | 1806312 = | 459 (1.370) | coding (635/663 nt) | TMARI_RS09380 | methyl‑accepting chemotaxis protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 461 total aligned reads displayed.
ATGAACATGATCAGGCTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAACTCCCTGTAGGGAATCCCACCGGTGGGTTTAGGTCGGGATTCGAGGGCGGCTCT > NC_021214/1806075‑1806550 | aTGAACATGATCAGGCTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCt > 1:1007042/1‑239 (MQ=32) aCATGATCAGGCTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATc > 2:47983/1‑238 (MQ=32) ggCTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCCGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCAACTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg < 1:805388/239‑1 (MQ=17) cTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagga < 1:903265/238‑1 (MQ=33) cTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagga < 2:316236/238‑1 (MQ=33) cTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg < 1:34395/237‑1 (MQ=32) gAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAggagga < 1:1412877/239‑1 (MQ=33) gAATAGAGAGGCGCATGAGTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCTGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTAGCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAAGGACTCCACCGTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATGCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAaggagg < 1:423034/238‑1 (MQ=11) aTAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATa < 1:301261/239‑1 (MQ=34) agagGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑Taa > 2:148162/1‑239 (MQ=37) gagGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAg > 2:265167/1‑239 (MQ=37) agGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg > 2:797054/1‑227 (MQ=32) agGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTCGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATACGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGt > 2:1151614/1‑239 (MQ=37) gCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGATCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGCTCGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg > 1:866029/1‑224 (MQ=17) gCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑Taa < 1:92344/234‑1 (MQ=37) gCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑Taa < 1:1045267/234‑1 (MQ=37) gCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGt > 1:1302735/1‑239 (MQ=39) gCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGt > 2:942301/1‑239 (MQ=39) gCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTAAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGATGGAGGATAG‑‑TACGTGGt > 2:1420981/1‑239 (MQ=255) tCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACACAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCACATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGt > 2:589113/1‑236 (MQ=25) cTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGt > 1:1361708/1‑235 (MQ=255) ttCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTc > 2:1222334/1‑238 (MQ=255) tCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTcca < 1:380567/239‑3 (MQ=255) tgttgtTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCTGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGtt > 2:18515/1‑239 (MQ=255) tgttgtTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTAt < 1:555783/195‑1 (MQ=33) tgttgtTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAggagga < 2:718363/210‑1 (MQ=34) tgttgtTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAggagga > 1:718363/1‑210 (MQ=34) cTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTa > 2:930469/1‑238 (MQ=255) cttGCGGAGTAGTCGTTCAAGTTCTTCAGCTAGGGGTCCGTCCAGTATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATAGCATAATATAATTAACACCAGAACAAGCCTATCGCCCTGAAGGAGAATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCaa < 1:276787/237‑1 (MQ=17) ttGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg < 1:1001086/191‑1 (MQ=33) ttCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg < 2:67100/181‑1 (MQ=33) ttCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAagg > 1:67100/1‑181 (MQ=33) ttCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTca > 2:235277/1‑209 (MQ=255) ttCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTca < 1:235277/209‑1 (MQ=255) aGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTc > 2:1091054/1‑239 (MQ=255) ttcttcAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCaa > 2:688828/1‑239 (MQ=255) tcAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGt < 1:1586/239‑1 (MQ=255) tcAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGt < 2:1054828/239‑1 (MQ=255) tcAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGt < 2:839733/239‑1 (MQ=255) tcAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGATATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGt < 1:1019034/239‑1 (MQ=255) tGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCa > 1:839155/1‑239 (MQ=255) aCCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGtt > 1:778803/1‑239 (MQ=255) ccAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGttt < 2:1312061/239‑1 (MQ=255) ggATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCa > 2:166351/1‑238 (MQ=255) gATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATTACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAAc < 1:639087/239‑1 (MQ=255) aTTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAAc < 2:632947/238‑1 (MQ=255) aTTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACACAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCACATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAAc < 1:589113/238‑1 (MQ=255) tttttCTGCGGTATTTAGGTATCCACACAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCACATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGGGGATGGCTTGCGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAAc < 2:761819/239‑1 (MQ=14) tCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGt < 1:126564/196‑1 (MQ=255) ccACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTcc < 1:942301/239‑1 (MQ=255) gATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCt > 2:1202742/1‑239 (MQ=255) aCTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATAACCTTGCTCACGGa > 1:139323/1‑239 (MQ=255) cTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAATCCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGaa < 1:1021434/239‑1 (MQ=255) cTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCa > 1:461376/1‑137 (MQ=255) cTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCCCGGaa > 2:1276307/1‑239 (MQ=255) cTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACaaa < 1:198019/239‑1 (MQ=255) gTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGACAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAg > 1:1071227/1‑238 (MQ=255) cttcttGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGCAAAACAAAAGc > 1:1254497/1‑237 (MQ=255) atGCATACCGATCACCCCATTGAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCACCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATGAATCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTAAACAGATATCACACAGGTAAAGTTTCCCTCGTCGTCAGTGATAACATTGCTCACGGCAACCAAAAGTTCttttgtttt > 1:1277286/1‑239 (MQ=37) gCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGa > 2:294092/1‑239 (MQ=255) gCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGa > 1:519804/1‑239 (MQ=255) aTACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAAc < 2:371566/239‑1 (MQ=255) tACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAAc > 2:391389/1‑238 (MQ=255) 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2:868877/1‑239 (MQ=255) aTTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTa < 1:627161/117‑1 (MQ=255) aTTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAACTCCCTGTAGGGaa > 2:1244539/1‑238 (MQ=255) aTTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAACTCCCTGTAGGGaa > 2:112857/1‑238 (MQ=255) aTTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAACTCCCTGTAGGGaa > 1:1189316/1‑238 (MQ=255) 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cTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAACTCCCTGTAGGGAATCCCACCGGAGGGTTTATGTCGGGATTCGAGGGCGGctcg > 1:388033/1‑238 (MQ=255) | ATGAACATGATCAGGCTGAATAGAGAGGGCCAGTATTTCTATTCCGTGTTGTTTTGCTGTGTTGCGGAGTATTCGTTCAAGTTCTTCAGCTATGGAGCCGACCAGGATTTTTCTGCGGTATTTAGGTATCCACGCAAAATGATAGTTCAGATTATAATGACTCCACCTTGTCTTCTTGATATGCATACCTATCACCCCATTCAATTATATCATAAGATAATTAACACCACAACAAACCTATCCCCCTGAAGGAGGATAG‑‑TAAGTGGTTGGGGTTCTGTCACAGTTTCATGGTTATCAAAAGAATGAGGAAAATTACTCAAAAGTCTCTCCAGGAGTGTTTCAACAGATATCACACCGGTCACGTTTCCCTCGTCGTCCGTGATCACCTTGCTCACGGAAAACAAAAGCTCTTTTGTTTTGAACTCCCTGTAGGGAATCCCACCGGTGGGTTTAGGTCGGGATTCGAGGGCGGCTCT > NC_021214/1806075‑1806550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |