| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_021214 | 1,478,808 | (AAAGAATTTT)1→2 | coding (32/1281 nt) | TMARI_RS07485 → | HD domain‑containing protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_021214 | 1478799 = | 0 (0.000) | coding (23/1281 nt) | TMARI_RS07485 | HD domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GAGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTTGAACCCGTTA > NC_021214/1478561‑1479034 | aGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGaa > 2:1013920‑M1/1‑237 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |