| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_021214 | 1,478,808 | (AAAGAATTTT)1→2 | coding (32/1281 nt) | TMARI_RS07485 → | HD domain‑containing protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_021214 | 1478799 = | 0 (0.000) | coding (23/1281 nt) | TMARI_RS07485 | HD domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AGCGAAGCTCTGAGATAAAGCAACGAAAGGGGGGAAAGCCATGAGAAAGCTCATGAAAATAGTCCTCGTTCTTGGGAGCCTGCTCGGAACACTGATGGCAGTTGTTGGGGGCAACCAGATTTGGTAATTGATATAATCACTATATTGACGATTGGTAATTATGCCCCTGCCCTCGTAGTTCTTAGCCCCCATGATTCTGAAAGGAGTGACAATTCTTGATAAAGAATAAGAATTCAGAAAGAATTTTCTTAATTTATTCCTTATCCATACTCGCATTCTATTTCTTTCTGATTTTTATGTTCAGCGATTATACGGATGATTGGCATAATCTCGGTTATGTCTTGCTACTTTTTCTCACCAGTGTATTCTTCGATATTGCTAGAACAAAAACTTTTGAGTTTACAGGTGGAAAAGTGGAAACTTCTGCTGTTTTCATTGTGAACATCTTCACAGCAGCTCTTTTGAACCCGT > NC_021214/1478562‑1479032 | tgagataaagcaacgaacggggggaaagccatgagaaagctcatgaaaatagtcctcgttcttgggagcctgctcggaacactgatggcagttgttgggggcaaccagatttggtaattgatataatcactatattgccgattggtaattatgcccctgccctcgtagttcttagcccccatgattctgaaaggagggacaattcttgttaacgaataagaattcagaaagacttttaa > 2:1257677‑M2/238‑239 (MQ=255) ataaagcaacgaaaggggggaaagccatgagaaagctcatgaaaatagtcctcgttcttgggagcctgctcggaacactgatggcagttgttgggggcaaccagatttggtaattgatataatcactatattgacgattggtaattatgcccctgccctcgtagttcttagcccccatgattctgaaaggagtgacaattcttgataaagaataagaattcagaaagaattttaaagaa > 1:1011066‑M2/234‑239 (MQ=255) aagcaacgaaaggggggaaagccatgagaaagctcatgaaaatagtcctcgttcttgggagcctgctcggaacactgatggcagttgttgggggcaaccagatttggtaattgatataatcactatattgacgattggtaattatgcccctgccctcgtagttcttagcccccatgattctgaaaggagtgacaattcttgataaagaataagaattcagaaagaattttaaagaattt > 2:19797‑M2/231‑239 (MQ=255) aacgaaaggggggaaagccatgagaaagctcatgaaaatagtcctcgttcttgggagcctgctcggaacactgatggcagttgttgggggcaaccagatttggtaattgatataatcactatattgacgattggtaattatgcccctgccctcgtagttcttagcccccatgattctgaaaggagtgacaattcttgataaagaataagaattcagaaagaattttAAAGAATTTTCt < 1:843296‑M2/12‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |