New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_021214 | 206152 = | 272 (0.970) | 135 (0.550) | 80/358 | 1.3 | 33.9% | noncoding (77/77 nt) | TMARI_RS00975 | tRNA‑Arg |
? | NC_021214 | = 206320 | 289 (1.170) | intergenic (‑11/+1) | TMARI_RS00980/TMARI_RS00985 | tRNA‑His/tRNA‑Arg |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
CGCTCCAACGTTTCTGGTGCGCCCGTAGCTCAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_021214/206415‑206152 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttcgagtcctgccgggcgcgccaTTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTCACCGTAGAGGAGGTAGAAAC < NC_021214/206320‑206084 ggcGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGGGCGTCGGATTTCGTATCCGTTGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCC < 1:696265/236‑1 GCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCAAAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTTGACTGCGGATCAGGCGGCCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCCGGGACCCGCCCGTAGCCCAACTGGATAGAGCGTAGGACTTCGGACCCGCTGGTTGCGGGTTCCAGGCCTGCGGGGC > 2:417787/1‑240 GCGCCCGTAGCTCAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGC > 1:1169730/1‑240 GCGCCCGTAGCTCAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGC > 1:906019/1‑240 GCCCGTAGCTCAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGC > 1:1041018/1‑240 CAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTT > 1:1178549/1‑240 CAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGCGATAACCATAGCTCAGTTGGTAGCGCGCCTGACTGCGGGTCAGTTGGTCGCGGGTTCGCGTCCCGCTGATGACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGACACCGCCTCGGGCTTCGGAACCGGTGTCTGCGGCTTCGCGTCCTGCCGGGCGCGCCctctgat > 2:462508/1‑233 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TCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTC < 2:743814/124‑1 ggtggcggtGGGTTCGGGTCGTGCCGGGGGCGCGATTTTTTGCGTGGGGACCATAGCTCAGTTGGTAGGGCGCCTGACTGTGGATCGGGTGGTCGCGGGTTCGGGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCAT < 2:1136853/231‑1 gagGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCAT < 1:462508/237‑1 GGTTGCGGGGCCGGTGCCTGCAGGCCGCGCCATTTTTTGCGTGGTGACCATATCGCAGTTGGTAGAGCCCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGGGTCCCGCTGGTCACCCCAGGGGCGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAG < 2:498000/239‑1 gtggGGGTGCGGGTCCGGCCGGGCGCGCTATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTGAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTGGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAA < 2:606447/235‑1 TTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGA < 2:870853/99‑1 GGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTG < 1:1012711/39‑1 TTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGC > 2:578710/1‑84 TTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGC < 1:578710/84‑1 gcggtgctTGCCGGGCCCGCCATTTTGTTCGGGGTGAACATAGCGCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGGTCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 2:548863/231‑1 gCGAGGCCTGCGGGTCGGGCCATTTTTTTCGTGGTGACAATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGATTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:1333873/238‑1 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCGTTTTGTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCAGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:675321/239‑1 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTCA < 1:523828/240‑1 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:1127765/239‑1 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:513444/239‑1 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:962260/239‑1 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC > 1:1318932/1‑239 TCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAAC < 1:476815/130‑1 gcctgCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCGCCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:1161896/233‑1 CGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:475588/238‑1 CGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC > 2:475588/1‑238 CGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGCACTTCGGCTCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGGCGCCGGAACACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCCTCGAAGAACACTCA > 2:248917/1‑239 GAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAACGCCTGACTG > 2:698198/1‑65 TCCTGCGGGGCGCGCCATTTTTTCCGGGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGGGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTCACCGT < 1:231250/239‑1 CTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC > 2:830201/1‑232 CTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTC < 1:830201/232‑1 CTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGAT > 1:386085/1‑65 CTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGAT < 2:386085/65‑1 TGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTCACCGTAGAG < 1:33065/240‑1 GGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGC > 2:801621/1‑103 GCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGGGCCACTCGAAGACCAATAAACCAATGTCGTCGAAGGGCATAGCAGAAAACTAACGGTAGAGGAGGTA > 2:1274706/1‑240 GCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTG < 1:973365/55‑1 GCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTG > 2:973365/1‑55 GCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAG > 2:1271742/1‑121 CGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGCGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACGTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACCCGAACACCATTAAACAACAGTGCTTGCAGGGCCAGAAAGAAACCATACCGTACAGGAGGTAaga > 2:1302356/1‑237 CCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTCACCGTAGAGGAGGTAGAAAC < 1:633108/240‑1 CGCTCCAACGTTTCTGGTGCGCCCGTAGCTCAACAGGATAGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCATTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_021214/206415‑206152 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttcgagtcctgccgggcgcgccaTTTTTTTCGTGGTGACCATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCAGCGACGCGCCCGTAGCTCAACTGGATAGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATGGTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCACTCGAAAACCAATAAACCAATGTCGTTGAAGGGCATAGAAGAACACTCACCGTAGAGGAGGTAGAAAC < NC_021214/206320‑206084 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |