| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_021214 | 206152 = | 272 (0.970) | 135 (0.550) | 80/358 | 1.3 | 33.9% | noncoding (77/77 nt) | TMARI_RS00975 | tRNA‑Arg |
| ? | NC_021214 | = 206320 | 289 (1.170) | intergenic (‑11/+1) | TMARI_RS00980/TMARI_RS00985 | tRNA‑His/tRNA‑Arg | |||||
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
ACTTGGAGCAAGATAACCCCTTGCGATGGCTATGGCCTTCACGGCCTGGTTAACAGCACCCGCTCCAATTGCCTGAAGCTCGGCCTTTCCTTTTTCTCTGATAACTCCTGCGAGAGCTCCTGCGACTTTGTTGGGGTTGGAATTAGAAGCAACCTTGAGTACTTCCATGTGTTTCTACCTCCTCTACGGTGAGTGTTCTTCTATGCCCTTCAACGACATTGGTTTATTGGTTTTCGAGTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGGCGCGTCGCTGGGGTGACCAGCGGGACTCGAACCCGCGACCACCTGATCCACAGTCAGGCGCTCTACCAACTGAGCTATGGTCACCACGAAAAAAATGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCTGCAACCCTCGGATTAGAAATCCGATGCTCTATCCTGTTGAGCTAC > NC_021214/205914‑206391 | agaccgcctctcctgtggctgttcttctatgcccttcaacgacattggtgtattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatctgatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaccccgcggccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGgcgc > 2:1161896‑M1/234‑239 (MQ=255) gCAAGATAACCCCTTGCGATGGCTATGGCCTTCACGGCCTGGTTAACAGCACCCGCTCCAATTGCCTGAAGCTCGGCCTTTCCTTTTTCTCTGATAACTCCTGCGAGAGCTCCTGCGACTTTGTTGGGGTTGGAATTAGAAGCAACCTTGAGTACTTCCATGTGTTTCTACCTCCTCTACGGTGAGTGTTCTTCTATGCCCTTCAACGACATTGGTTTATTGGTTTTCGAGTGgcgcgc < 1:1004327/239‑1 (MQ=255) cctctacggtgagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgccctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGc < 1:563049‑M1/13‑1 (MQ=255) tctacggtgagtgttcttctaggccgtgcagcgacattggtttatgggtcttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaaggccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAg > 1:194986‑M1/226‑240 (MQ=255) ctacggtgagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagtttagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccaccgtcaggcgctctaccaactgagccatggtcaccacgaaaaaaaCGGCGCGCCCGGCAgg < 1:110975‑M1/16‑1 (MQ=255) ctacggtgagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAgg < 1:358367‑M1/16‑1 (MQ=255) tgagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGa < 1:523828‑M1/22‑1 (MQ=255) tgagtgttcttcgaggcccttcaacgacattggtttattggtgttccggcgccgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggagccgaagtgcgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccccctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCg > 2:248917‑M1/219‑239 (MQ=255) tGCGATGGCTATGGCCTTCACGGCCTGGTTAACAGCACCCGCTCCAATTGCCTGAAGCTCGGCCTTTCCTTTTTCTCTGATAACTCCTGCGAGAGCTCCTGCGACTTTGTTGGGGTTGGAATTAGAAGCAACCTTGAGTACTTCCATGTGTTTCTACCTCCTCTACGGTGAGTGTTCCTCTATGCCCTTCAACGACATTGGTTTATTGGTTTTCGAGTGGCGCGCCCGGCCGGACTCGa > 2:132455/1‑239 (MQ=255) gagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCg < 1:475588‑M1/21‑1 (MQ=255) gagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGa < 1:1127765‑M1/22‑1 (MQ=255) gagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggaatcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctattgtcaccacgaaaaaaaTGGCCCGACCCGCAGGCCTcgc < 1:1333873‑M1/22‑2 (MQ=255) gagtgttcttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggcgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCcggcaggcaggc < 1:1161896‑M1/21‑6 (MQ=255) tGGCTATGGCCTTCACGGCCTGGTTAACAGCACCCGCTCCAATTGCCTGAAGCTCGGCCTTTCCTTTTTCTCTGATAACTCCTGCGAGAGCTCCTGCGACTTTGTTGGGGTTGGAATTAGAAGCAACCTTGAGTACTTCCATGTGTTTCTACCTCCTCTACGGTGAGTGTTCTTCTATGCCCTTCAACGACATTGGTTTATTGGTTTTCGAGTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGc > 1:1050448/1‑240 (MQ=255) ttctatgcccttcaacgacattggtttattggttttcgagtggcgcgcccggcaggactcgaacccgcaaccatcggatccgaagtccgacgctctatccagttgagctacgggcgcgtcgctggggtgaccagcgggactcgaacccgcgaccacctgatccacagtcaggcgctctaccaactgagctatggtcaccacgacaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCaa < 1:857709‑M1/30‑1 (MQ=255) cTTCACGGCCTGGTTAACAGCACCCGCTCCAATTGCCTGAAGCTCGGCCTTTCCTTTTTCTCTGATAACTCCTGCGAGAGCTCCTGCGACTTTGTTGGGGTTGGAATTAGAAGCAACCTTGAGTACTTCCATGTGTTTCTACCTCCTCTACGGTGAGTGTTCTTCTATGCCCTTCAACGACATTGGTTTATTGGTTTTCGAGTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCgg < 1:217465/239‑1 (MQ=255) 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1:1199085‑M1/220‑1 (MQ=255) atggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGGCGCGTCGCTGGGGTGACCAGCGGGACTCGAACCCGCGac < 1:807486‑M1/113‑1 (MQ=255) atggtcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGGCGCGTCGCTGGGGTGACCAGCGGGACTCGAACCCGCGac > 2:807486‑M1/20‑132 (MQ=255) tcaccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGGCGCGTCGCTGGGGTGACCAGCGGGACTCGAACCCGCGACCACCTGATCCACAGTCAGGCGCTCTACCAACTGAGCTATGGTCACCACGAAAAAAATGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCTGCAACCCTCGGATTAGAAATCCGATGctc > 1:547198‑M1/16‑239 (MQ=255) caccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGa < 1:492196‑M1/43‑1 (MQ=255) ccacgaaaaaaaTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGgcg < 2:1072001‑M1/76‑1 (MQ=255) tttCGAGTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGGCGCGTCGCTGGGGTGACCAGCGGGACTCGAACCCGCGACCACCTGATCCACAGTCAGgcg > 1:442562/1‑141 (MQ=255) 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ACTTGGAGCAAGATAACCCCTTGCGATGGCTATGGCCTTCACGGCCTGGTTAACAGCACCCGCTCCAATTGCCTGAAGCTCGGCCTTTCCTTTTTCTCTGATAACTCCTGCGAGAGCTCCTGCGACTTTGTTGGGGTTGGAATTAGAAGCAACCTTGAGTACTTCCATGTGTTTCTACCTCCTCTACGGTGAGTGTTCTTCTATGCCCTTCAACGACATTGGTTTATTGGTTTTCGAGTGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCCGCAACCATCGGATCCGAAGTCCGACGCTCTATCCAGTTGAGCTACGGGCGCGTCGCTGGGGTGACCAGCGGGACTCGAACCCGCGACCACCTGATCCACAGTCAGGCGCTCTACCAACTGAGCTATGGTCACCACGAAAAAAATGGCGCGCCCGGCAGGACTCGAACCTGCAACCCTCGGATTAGAAATCCGATGCTCTATCCTGTTGAGCTAC > NC_021214/205914‑206391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |