| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_021214 | 1,110 | +CTCCACAATGAAAAGAATAGATGGTAAGGTGTGCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAAC | intergenic (+1035/+2045) | TMARI_RS09660 → / ← TMARI_RS00005 | hypothetical protein/IGHMBP2 family helicase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | 1081 = | 41 (0.150) | 257 (1.110) +AAGCACACCTTACCATCTATTCTTTTCATTGTGGAG |
114/336 | 0.3 | 88.1% | noncoding (670/2694 nt) | CRISPR | repeat region |
| ? | NC_021214 | = 1110 | 43 (0.150) | noncoding (699/2694 nt) | CRISPR | repeat region | |||||
Only 100 of 651 total aligned reads displayed.
CGCGACAAGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGC > NC_021214/844‑1319 | gcgACAAGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGTAAAGCGGGAGATGTTAtttt > 2:180835/1‑240 (MQ=255) aaGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAAt > 1:501285/1‑239 (MQ=255) aaGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAAt > 1:582202/1‑239 (MQ=255) taccttttctcagacaacttcaactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACt > 2:110936‑M1/230‑240 (MQ=255) ccACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACGTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACt < 2:501285/238‑1 (MQ=255) tttcacagacaacttcaactggaaaagtttaaatacttccttagagttatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCtt > 2:1154620‑M1/225‑240 (MQ=255) cGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAATTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGAGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCtt < 2:89062/240‑1 (MQ=255) tcgcagacaacttgaatttgaaaagtttcactactttcttagaggtctggaaattcgattatgtcttttaaaaagacattcagtcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgctgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTag > 2:775477‑M1/223‑240 (MQ=255) gctcttacaacttcaacgtgaaaagtttcaatacttgcttagaggtatagaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTag > 2:340923‑M1/223‑240 (MQ=255) aGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTag < 2:1259487/237‑1 (MQ=255) cACTAGGTGTTTCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAgg < 2:652589/237‑1 (MQ=255) tagtttcaatactttcttggagttatggaaactatattatttcttttacaaagacaggcgatcatacaagtttcaatacatccttagaggtatggaaagtatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATcc > 2:456535‑M1/201‑240 (MQ=255) tCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatg > 2:142436‑M2/1‑226 (MQ=255) agagGTATGGAAACTAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaa > 2:353712‑M2/1‑213 (MQ=255) agagGTATGGAAACAATTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaa > 2:312499‑M2/1‑213 (MQ=255) atgggtgtgtaaactcgattatttcttttacaaagacatgctatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacatgggagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCt > 2:842552‑M1/183‑240 (MQ=255) ggTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggt < 1:1213158‑M2/240‑31 (MQ=255) ggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATCGAATCCGATATAATCATATTTCCttat < 2:696324‑M1/61‑1 (MQ=255) tATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTGCAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAAt < 2:1018102/186‑1 (MQ=255) tATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTag < 1:958939/196‑1 (MQ=255) tATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgt < 1:178940‑M2/240‑33 (MQ=255) atatggaaactcgattatttctgttacaaatacatgcgatcatacaatttgcaatacttccttagaggtattgaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggttgtgatgttagtttcaatccttccttagaggtatggaatcctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACt > 1:390873‑M1/179‑189 (MQ=255) tatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTagag < 1:995717‑M1/20‑1 (MQ=255) aTGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgt < 1:1114394‑M2/239‑33 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggttgtgatgttagtttcaatacttccttaaaggtatggaaacctcgacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAAAGGTATGGAAACTCTCGATTCCGATATAATTATATTTTCTtattat < 2:405301‑M1/64‑1 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCtt > 1:1187682‑M1/177‑192 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTaga > 1:140682‑M1/177‑195 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGCTATACTCATATTTCATtattat < 1:450386‑M1/64‑1 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTtattat < 1:519048‑M1/64‑1 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTGTCAATACTTCCtt < 2:1187682‑M1/16‑1 (MQ=255) ctcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggaatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTag < 2:864959‑M1/18‑1 (MQ=255) cTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatactt < 1:125281‑M2/238‑49 (MQ=255) tttCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttcctt < 1:24047‑M2/240‑53 (MQ=255) tttCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatag < 2:671508‑M2/208‑21 (MQ=255) tttCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatag > 1:671508‑M2/1‑188 (MQ=255) cttttccaaagtcctgcaatcattaaattgttaatacttcattagagttatagaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgattttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatgttaaggtgttcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCtt > 2:542147‑M1/159‑240 (MQ=255) tcAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagag > 1:1079752‑M2/1‑184 (MQ=255) aGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACt > 2:856347/1‑163 (MQ=255) tGTAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAAACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcg > 2:267537‑M2/1‑169 (MQ=255) catacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACt < 1:850929‑M1/11‑1 (MQ=255) gAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaa < 1:860555‑M2/240‑74 (MQ=255) atacaagtttcaatacttccttagaggtatgtaaactatacgttgtataaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatccttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatacatgttaagttgttcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCAtc > 1:827624‑M1/138‑240 (MQ=255) tacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCtt > 1:1197512‑M1/137‑218 (MQ=255) tttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCtt < 1:370077‑M1/82‑1 (MQ=255) caatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGAAATATTCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGCATTTCTTAGTTAt < 2:419679‑M1/113‑1 (MQ=255) cttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTAttgctt < 2:397032‑M1/118‑1 (MQ=255) ggTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGAATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgaattaattctatttccttat < 2:801100‑M2/240‑98 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctcca < 2:124081‑M2/145‑6 (MQ=255) aTGGAAACTAGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagag < 1:339399‑M2/196‑57 (MQ=255) atggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACt < 1:46957‑M1/11‑1 (MQ=255) atggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGAATGGAAACCCGCa < 2:992934‑M1/101‑1 (MQ=255) aaCTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtacggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaacttacgaatccgatataatcaattttccttattatatgtt < 2:940714‑M2/240‑106 (MQ=255) aactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGtt > 1:1293155‑M1/105‑240 (MQ=255) cTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgttta < 2:1284900‑M2/240‑108 (MQ=255) cTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttag > 1:864959‑M2/1‑133 (MQ=255) tatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCa < 1:750822‑M1/139‑1 (MQ=255) ttattTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatac > 1:940714‑M2/1‑128 (MQ=255) gttgtagaaagcgcaaaggtggtgagtttagtttcaatacttccttagaggtatggaaaccttcacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt > 2:29010‑M1/97‑240 (MQ=255) ttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACt < 1:1131972‑M1/77‑1 (MQ=255) ttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt < 1:787070‑M1/144‑1 (MQ=255) ttttACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgctt < 2:949018‑M2/157‑37 (MQ=255) caaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCatat > 2:906939‑M1/84‑136 (MQ=255) gACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaataga < 1:268797‑M2/133‑22 (MQ=255) ggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACt > 1:89130‑M1/77‑87 (MQ=255) cATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaacgaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgca < 2:190717‑M2/239‑138 (MQ=255) tACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttcctt < 2:1197512‑M2/218‑119 (MQ=255) ttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCtt > 1:220618‑M1/70‑202 (MQ=255) cAAGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGGAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcg > 1:405301‑M2/1‑98 (MQ=255) aGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaata > 2:571617‑M2/1‑96 (MQ=255) tttCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttcctt > 2:370077‑M2/1‑94 (MQ=255) tCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatag < 1:1011499‑M2/112‑21 (MQ=255) cAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaaatatcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtat < 2:624114‑M2/240‑150 (MQ=255) tCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgc > 1:689089‑M2/1‑84 (MQ=255) agaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACtt > 1:764949‑M1/51‑240 (MQ=255) ggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTAAATACTTCCTTAGAGTTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGa < 2:241166‑M1/193‑1 (MQ=255) tATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaacagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttcgaggtatggaaactctcgactccgatataatcatatttcattattatatgtttcactacttccttagaggtagggaaacccgcatctcgtaggtattgcatgccttctgttc < 1:1052952‑M2/239‑166 (MQ=255) tATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatcccgtaactattgcttgccttccgtt < 2:604447‑M2/238‑165 (MQ=255) atggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttTTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa > 2:751505‑M1/45‑229 (MQ=255) tggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATAATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTGGCCTTATGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGaaca < 1:302348‑M1/196‑1 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatact > 2:46957‑M2/1‑73 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGCGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgagaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatat < 1:911902‑M2/175‑103 (MQ=255) ggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGaacaac > 1:1170144‑M1/43‑240 (MQ=255) cctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTc < 1:419590‑M1/203‑1 (MQ=255) cTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatc > 1:64610‑M2/1‑66 (MQ=255) tataCGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttc > 1:184317‑M2/1‑65 (MQ=255) ataCGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaa < 1:706533‑M2/240‑177 (MQ=255) caatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACt < 1:984705‑M1/209‑1 (MQ=255) gaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTag > 1:607779‑M1/28‑178 (MQ=255) gTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatactt < 1:1094767‑M2/238‑182 (MQ=255) aaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTTTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCtt > 2:1077514‑M1/26‑239 (MQ=255) aacaatagagggtaatgtgttcttGTTTAAATACTTCCTTCGAGGTAGGGAAACTCTCGAATCCTATATAATCATATTGCCTTATTATATGTTTCAATACATCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCTTAGGTATTGATTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTag > 2:519048‑M1/25‑240 (MQ=255) aaTCGCAATGGTGCTTATGTTAGTTGCAATACTCCCTTAGAGGTATGGAAATctacacgatgacgagaaaagatggtgagatgtttttgtttaaatacttccttagaggtagggaaactctcgaatcctatataataatatgttcttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttag > 2:317185‑M2/1‑52 (MQ=255) agccaaaaggtggTGATTTTATTTTCAATACTTCCTGAGAGGTATGGAAAActccacaatgaaaaaaatagatggtaaggtttgcttttttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagag > 2:1325081‑M2/6‑51 (MQ=255) tagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTatat > 2:1129128‑M1/20‑85 (MQ=255) gatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCtt > 1:397707‑M1/18‑150 (MQ=255) tggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACt < 2:717321‑M1/77‑1 (MQ=255) tggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAACCCTGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACtt > 1:543000‑M1/16‑160 (MQ=255) ttAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttccctt < 2:220618‑M2/202‑170 (MQ=255) tAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgt < 1:1320372‑M2/240‑209 (MQ=255) tGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTAGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCATTTTGATGTCTTAAAACAACGTTTAAATACTTCCTTAGCggcatggaaacgaaactcacac < 2:155242‑M1/239‑7 (MQ=255) | CGCGACAAGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGC > NC_021214/844‑1319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |