| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_021214 | 1,110 | +CTCCACAATGAAAAGAATAGATGGTAAGGTGTGCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAAC | intergenic (+1035/+2045) | TMARI_RS09660 → / ← TMARI_RS00005 | hypothetical protein/IGHMBP2 family helicase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | 1081 = | 41 (0.150) | 257 (1.110) +AAGCACACCTTACCATCTATTCTTTTCATTGTGGAG |
114/336 | 0.3 | 88.1% | noncoding (670/2694 nt) | CRISPR | repeat region |
| ? | NC_021214 | = 1110 | 43 (0.150) | noncoding (699/2694 nt) | CRISPR | repeat region | |||||
Only 100 of 655 total aligned reads displayed.
GTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATCACAAGCCCGTTTCCGTTTC > NC_021214/873‑1349 | cTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccaca < 2:1199937‑M2/240‑8 (MQ=255) aaaagtttaaatacttccttagagatatggaacgtagattatttcttatacaaagacatgctgtcatacaagtttcaatacttccttagaggtagagaaaatatacgttgtagaaatcgcaaagatggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAAt > 2:947637‑M1/203‑240 (MQ=255) aGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATATTTCCTTAGAGGTATGGAAATTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGTTGGAGATGTAAGTTTCAATACTTCCTTAGAAGTATGGAAACttacacaatg < 2:180124‑M2/240‑11 (MQ=255) aGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATAATTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatg < 2:1116003‑M2/240‑11 (MQ=255) tttCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaa < 1:110936‑M2/240‑13 (MQ=255) aCTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaata > 1:522841‑M2/1‑221 (MQ=255) ttCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaataga > 1:913258‑M2/1‑219 (MQ=255) tAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggta > 1:1179818‑M2/1‑214 (MQ=255) tagaggtatcgaaactcgattaatacgtttacaaagacatgcgatcatacaagtttaaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaattcttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTcc > 1:1191894‑M1/184‑240 (MQ=255) ggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCttat < 1:365644‑M1/61‑1 (MQ=255) tATGGAATAAAGCTTTGCCTGTTCTCAGACAACTTTAACTGGGAAAGTTTCAATACTTGCTTAAAAGTATGGAAACTAGATGATTTCTTGTACAAAGACAGGCGATCAGACAAGTGTCAATACTTCCGTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAAACGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACGTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtg > 2:934360‑M2/1‑208 (MQ=255) tatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCttatta < 1:476791‑M1/63‑1 (MQ=255) tatggaaactcgattatttctgttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATc > 2:264175‑M1/178‑216 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTtattat < 1:1325081‑M1/64‑1 (MQ=255) aactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGtt < 1:962057‑M1/69‑1 (MQ=255) aCAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtt > 1:386820‑M2/1‑201 (MQ=255) ctcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTc < 1:996729‑M1/71‑1 (MQ=255) tttACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaat > 1:685197‑M2/1‑195 (MQ=255) ttatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATAc > 1:940714‑M1/165‑240 (MQ=255) tattttttttccaaaaaaatgcgagcatacaagtttcaatacttccttagtggaatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgaagttagtttaaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACt > 2:351924‑M1/164‑240 (MQ=255) tatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACt > 2:476791‑M1/164‑240 (MQ=255) ttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTatat > 1:15380‑M1/161‑226 (MQ=255) tctcAGACAACTTCAACAGGAAAAGTTTCAATACTTGCTTAAAGGTATTGAAACTCGCATATTTATTTTACAAAAACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttag > 2:327206‑M2/1‑186 (MQ=255) atacaagtttcaatacttccttagaggtatgtaaactatacgttgtataaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatccttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatacatgttaagttgttcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCAtc > 1:827624‑M1/138‑240 (MQ=255) agtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATa < 1:571617‑M1/75‑1 (MQ=255) tttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATTGAAACCCGCATCTCGTAgg < 1:863569‑M1/110‑1 (MQ=255) ttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACt > 1:111827‑M1/122‑198 (MQ=255) ttAGATGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttc > 2:153948‑M2/1‑148 (MQ=255) aggtgtgaggaaactacaTTATTACTTTTACAAAGACGTTCCATCATATAAGTTTCAATACTTCCTTAAAGGTAGGGACACTATACCTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttcct > 2:1024339‑M2/9‑146 (MQ=255) ggTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttag < 2:1332421‑M2/197‑55 (MQ=255) ggTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGAATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgaattaattctatttccttat < 2:801100‑M2/240‑98 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgctatactcatatttcattattat < 1:450386‑M2/240‑101 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactcccgaatcagatgtaatcatatttctttattat < 2:1293155‑M2/240‑101 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgctt < 2:463078‑M2/176‑37 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctcca < 2:124081‑M2/145‑6 (MQ=255) atggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTTCTTATAGGCACGGAAACACGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTc < 2:846736‑M1/129‑1 (MQ=255) aactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGTTTGCCTTCTGTTCCCTTGtt < 1:1094488‑M1/136‑1 (MQ=255) cTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaa < 2:633353‑M2/141‑9 (MQ=255) tattTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 1:653238‑M2/1‑127 (MQ=255) tattTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 1:696324‑M2/1‑127 (MQ=255) tagtTCTTTTACAAAGTCATGCGATCATGCAAGTTTCAATTCCTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 2:859967‑M2/1‑127 (MQ=255) cgttgtattaagcgcaaaggtggtgatgttagtttcaaaccttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatcgatgttaaggtatgtttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 2:1092859‑M1/98‑240 (MQ=255) gttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt > 1:397032‑M1/97‑240 (MQ=255) tagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGt > 1:277111‑M1/93‑203 (MQ=255) caaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCatat > 2:906939‑M1/84‑136 (MQ=255) cATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgca < 1:405162‑M2/239‑138 (MQ=255) cATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgca < 1:795260‑M2/239‑138 (MQ=255) ttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCtt < 2:220618‑M1/133‑1 (MQ=255) tCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatag < 1:1011499‑M2/112‑21 (MQ=255) tccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa < 1:597181‑M1/185‑1 (MQ=255) tCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaa > 2:992628‑M2/1‑84 (MQ=255) ccTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgcc > 1:12483‑M2/1‑83 (MQ=255) gagGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgcct < 2:315284‑M2/236‑159 (MQ=255) ggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTGCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 2:883735‑M1/48‑190 (MQ=255) tATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaacagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttcgaggtatggaaactctcgactccgatataatcatatttcattattatatgtttcactacttccttagaggtagggaaacccgcatctcgtaggtattgcatgccttctgttc < 1:1052952‑M2/239‑166 (MQ=255) atggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATcc < 2:517895‑M1/40‑1 (MQ=255) atggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATcc > 1:517895‑M1/45‑84 (MQ=255) atggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa < 1:751505‑M1/185‑1 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatttttcaatacttacttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttc < 2:764949‑M2/238‑166 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgctt < 2:1132133‑M2/109‑37 (MQ=255) aacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTcc < 2:695342‑M1/57‑1 (MQ=255) aaCTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtt > 1:1293155‑M2/1‑68 (MQ=255) cctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATa < 1:31521‑M1/142‑1 (MQ=255) tataCGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaatgtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatat > 2:390003‑M2/1‑65 (MQ=255) tataCGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact < 1:1197681‑M2/178‑114 (MQ=255) tactgaaatgaaaatgtgcttaggtgtctttGTTTAAATACTTCCTTATAGGTATCGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTGTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACt > 2:405162‑M1/32‑240 (MQ=255) caatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACt < 1:984705‑M1/209‑1 (MQ=255) ttGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaata < 2:20036‑M2/78‑20 (MQ=255) atgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACt < 1:414017‑M1/209‑1 (MQ=255) atgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACt > 2:414017‑M1/30‑238 (MQ=255) gaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTag > 1:607779‑M1/28‑178 (MQ=255) tAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatgttaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggt < 2:277111‑M2/203‑148 (MQ=255) tAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatcc < 2:66317‑M2/132‑77 (MQ=255) aGAAATCGCAAAGGTTGTGATTTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttcctt > 1:49308‑M2/1‑55 (MQ=255) cGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatact < 2:535807‑M2/229‑181 (MQ=255) tggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCAAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTCAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGga < 1:1137897‑M1/225‑1 (MQ=255) ggtgATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatact > 1:89130‑M2/1‑40 (MQ=255) gtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt > 1:730590‑M1/7‑150 (MQ=255) gtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCtt < 1:226788‑M1/149‑1 (MQ=255) tGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatcc < 2:717075‑M2/111‑77 (MQ=255) ttAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCTCAGATAATCATCTTTCCTTATTATATGTTTTAATACTTTCTTAGAGGTATGGAAAACCGCATCTCGTACGTATTTCTTGCCTTCTGCTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACTTGTCAATCTTTTTAAAGACATATAACATCGCTTAAAATCTTCCCTATAGGTATAgaaaaaagactgct > 2:747093/1‑230 (MQ=255) gTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaa < 2:126697‑M2/240‑211 (MQ=255) ttCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGt < 1:84810/105‑1 (MQ=255) ttCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATTGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGaacaac < 2:1191762/188‑1 (MQ=255) ttCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt > 2:366679/1‑134 (MQ=255) tCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaaatccttttgaa > 1:180835‑M2/1‑19 (MQ=255) cTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgta > 1:438919‑M2/1‑17 (MQ=255) ttAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgcatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggaatggaaacccgcatctcgtagtaattgcttgccttctgttcccttggttcaatactgccttagaagaatggaaactcaacttgtacatccttttgtag < 2:1170144‑M2/238‑223 (MQ=255) ttAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACt < 2:567125/195‑1 (MQ=255) agagGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaaatccttttgaagactt > 1:764949‑M2/1‑14 (MQ=255) agagGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttg < 2:651890‑M2/169‑156 (MQ=255) ggTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttaaatacttccttagagttatggaaactaaacttgtaaatccttttgaagacttaga < 2:241166‑M2/240‑230 (MQ=255) tATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagagg > 1:870414‑M2/1‑9 (MQ=255) aTGGAAACctccacaatgcaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgacataatcatatttccttattatatgtttcaatatttccttagaggtagggaacccagcatctcgtaggtattgct < 2:438919‑M2/161‑154 (MQ=255) aTGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCtt < 2:615469/127‑1 (MQ=255) aTGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATCACAAGc < 1:197021/234‑1 (MQ=255) aTGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGCATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTa > 2:583927/1‑193 (MQ=255) ggAAGCctctacactgaaaagaatatatggtatggtgtgcttgtttcaattctttcttagaggtatggaaactgtcgaatcggatataatcatattttctgattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaaatccttttgaagacttagaacaac > 2:29434‑M2/1‑6 (MQ=255) ctctCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa > 1:636939/1‑156 (MQ=255) cctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatt > 1:255857‑M2/1‑1 (MQ=255) | GTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATCACAAGCCCGTTTCCGTTTC > NC_021214/873‑1349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |