| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_021214 | 1,815,540 | Δ28 bp | intergenic (‑23/‑201) | TMARI_RS09405 ← / → TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_021214 | 1815540 | 1815567 | 28 | 376 [0] | [0] 372 | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | = 1815539 | 0 (0.000) | 371 (1.340) | 160/404 | 0.1 | 100% | intergenic (‑22/‑229) | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| ? | NC_021214 | 1815568 = | 0 (0.000) | intergenic (‑51/‑200) | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase | |||||
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
CTGTCCCTGTGGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAAGAGTTTACCGTCAGAAAATTCACAAAATGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGT > NC_021214/1815302‑1815775 | ctgtccctgtGGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTCTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtg > 1:1278437‑M1/1‑238 (MQ=255) cctgtGGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttc > 1:437997‑M1/1‑233 (MQ=255) gtgGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcacta > 2:1283786‑M1/1‑230 (MQ=255) acctgcctgcaggaatttgGATTTGATGCGTCCAAAATCGACTTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaagg < 2:246595‑M1/230‑14 (MQ=255) aGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaagga > 1:949885‑M1/1‑226 (MQ=255) aGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaagga > 2:366134‑M1/1‑226 (MQ=255) aGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaagga > 1:8851‑M1/1‑226 (MQ=255) aGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaagg < 2:1212799‑M1/239‑14 (MQ=255) ggAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccg < 2:1011939‑M1/240‑26 (MQ=255) ttCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGAGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcttgatgtcaat > 2:203577‑M1/1‑197 (MQ=255) aCGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaa > 1:162550‑M1/1‑186 (MQ=255) aCTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcgg < 1:338085‑M1/240‑59 (MQ=255) atcgtcaacCGAGATTCCTGAATTTGCCTTGGATTCTTCCCCGGGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGAGGGTGTGCTTTGTTTGTGACAACACCAGAGCAGAAGCCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCCCCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttctggatgtcaatctggactcgaatcgctgtt < 2:752345‑M1/236‑63 (MQ=255) aCAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattt > 2:805498‑M1/1‑171 (MQ=255) gATTCCGTCCTTTGCCTTGAATTCGTCCCCGATTTTCTGGAGGATGTCAACCTTCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaatt < 2:437997‑M1/236‑71 (MQ=255) ttCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattcctca > 2:1038815‑M1/1‑164 (MQ=255) tttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatcttgattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 2:66051‑M1/1‑156 (MQ=255) tttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 1:817796‑M1/1‑156 (MQ=255) tttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatc < 2:1228551‑M1/212‑57 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgttt < 1:1105847‑M1/240‑86 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 2:140773‑M1/1‑155 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 1:801246‑M1/1‑155 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaa > 1:221022‑M1/1‑155 (MQ=255) cTTGAATTCTTCCCCTAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcatt < 2:738871‑M1/240‑90 (MQ=255) ttGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCACCCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattc > 2:307860‑M1/1‑150 (MQ=255) ttcCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGGTGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatat < 1:1002799‑M1/240‑99 (MQ=255) ccGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccg > 2:329342‑M1/1‑138 (MQ=255) ccGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccg < 1:329342‑M1/163‑26 (MQ=255) gAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaat < 2:635041‑M1/240‑105 (MQ=255) tGGAGGATGTCGACCTGCATTTCGGACCACCAGATGGTGAGCTTGATTTGTGATAACACCAGAGCAGAATCCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACGCCTCCTTTATATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaatttttgtgatgtcaatctggattcgattcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcatgcagaaagatcgaaattccgtta < 2:226064‑M1/240‑112 (MQ=255) ggaTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttatc > 2:188811‑M1/1‑125 (MQ=255) ggaTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaatt > 2:779385‑M1/1‑125 (MQ=255) ggaTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggcgttttttaattactcatcaactgtttcattctgaaatatcgaaatttcgttaac > 2:387727‑M1/1‑125 (MQ=255) gaTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAA < 1:1241909‑M1/124‑1 (MQ=255) aTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccct < 1:1038815‑M1/239‑117 (MQ=255) aCCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca < 2:183220‑M1/240‑124 (MQ=255) tGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaatt > 1:856436‑M1/1‑114 (MQ=255) tGCTTTTCGGAACACCAGATGCTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCACAGCAGAAACCACAACAAGCCTTAAAAAGAGCCGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgcattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcttcacctgtttcattcagaactatcgaaattccgttaaccctatcgacttgt > 2:675327‑M1/1‑114 (MQ=255) ttttCGGAACATCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtgtcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaatgccgttaaccctatcgacatgttat < 2:1153663‑M1/240‑130 (MQ=255) ttttCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaatt > 1:298395‑M1/1‑111 (MQ=255) ggAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaatt < 1:734710‑M1/240‑135 (MQ=255) ggAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccc < 1:378391‑M1/221‑116 (MQ=255) acacCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggatttaaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaa < 1:421359‑M1/215‑113 (MQ=255) tGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaata < 1:1326920‑M1/240‑146 (MQ=255) gTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgt > 2:466045‑M1/1‑93 (MQ=255) gTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgt < 1:466045‑M1/233‑141 (MQ=255) gAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataa > 2:411283‑M1/1‑91 (MQ=255) aGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgttt > 1:1012945‑M1/1‑90 (MQ=255) tttgtttgTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacaga < 1:115866‑M1/240‑154 (MQ=255) gtttgtGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaattatcgaaattccgttaaccctatagacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacgg > 2:42614‑M1/1‑84 (MQ=255) tgtgATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccc < 1:989487‑M1/196‑116 (MQ=255) tAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 1:185033‑M1/240‑165 (MQ=255) acacCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgtta < 2:162550‑M1/240‑167 (MQ=255) cAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattaggtgttaatataaacagacggatttgtgttaattt > 1:120501‑M1/1‑70 (MQ=255) gagCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 2:1082168‑M1/232‑165 (MQ=255) gagCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca > 2:823525‑M1/1‑68 (MQ=255) gCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaat < 1:233777‑M1/170‑105 (MQ=255) cgaAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattg < 2:1325612‑M1/237‑175 (MQ=255) gAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca > 1:658230‑M1/1‑63 (MQ=255) gAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaatt < 2:584655‑M1/168‑106 (MQ=255) cacaACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca < 2:345488‑M1/181‑124 (MQ=255) caacaaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaat < 1:362370‑M1/240‑185 (MQ=255) caacaaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaat > 1:1071386‑M1/1‑56 (MQ=255) caacaaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgttt > 1:668052‑M1/1‑56 (MQ=255) caaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtt > 2:1047513‑M1/1‑53 (MQ=255) caaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattga > 2:92595‑M1/1‑53 (MQ=255) tAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgt > 1:74846‑M1/1‑46 (MQ=255) gAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga > 1:252987‑M1/1‑40 (MQ=255) aGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattacccatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt > 1:926180‑M1/1‑36 (MQ=255) gTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgttatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatctttgaatgtttcgaaaatgaggagtgaa < 1:631760‑M1/240‑206 (MQ=255) ctctTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggtttcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagac > 2:1177844‑M1/1‑33 (MQ=255) ctctTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaa < 2:794224‑M1/238‑206 (MQ=255) ctctTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagac < 1:1177844‑M1/187‑155 (MQ=255) ctTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgg > 1:711824‑M1/1‑31 (MQ=255) ctTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgg < 2:711824‑M1/167‑137 (MQ=255) ctTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaac > 1:935979‑M1/1‑31 (MQ=255) cATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgg > 2:8568‑M1/1‑25 (MQ=255) cATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaacgattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggcttcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacgggattgtgttcatttattgatcgtggaatgtttcgcaaatgaggagggagggttggtaag > 2:117126‑M1/1‑25 (MQ=255) tGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaa > 2:494138‑M1/1‑23 (MQ=255) gggtcacctccTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattaagacatatcgaatttccgttaacccattcaacatgttatgaattggttgttattataaacagagggatttgtgttagtttattgctaacggaaagtttcgaaagttaggggtgagtgtagtgagaa > 2:610033‑M1/5‑23 (MQ=255) ggACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaag < 1:51466‑M1/240‑219 (MQ=255) gACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga < 2:264787‑M1/221‑201 (MQ=255) cacCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagcct < 1:307860‑M1/240‑222 (MQ=255) ctcctTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagcctttt > 2:1246798‑M1/1‑16 (MQ=255) ctcctTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca > 1:122676‑M1/1‑16 (MQ=255) tttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttac < 2:353590‑M1/240‑229 (MQ=255) ttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaac > 2:958023‑M1/1‑11 (MQ=255) gATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaatt < 1:779918‑M1/142‑135 (MQ=255) aTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 1:34650‑M1/171‑165 (MQ=255) aTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcat < 2:657322‑M1/83‑77 (MQ=255) ttACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgct < 1:290057‑M1/238‑233 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgacgaagccttttttactgcttgct > 2:1023075‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgcttgct > 1:595973‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaa < 2:545049‑M1/209‑206 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaa > 1:545049‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttatt < 1:401151‑M1/177‑174 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca > 2:1316463‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca < 1:1316463‑M1/127‑124 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggt < 2:1122434‑M1/63‑60 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggt > 1:1122434‑M1/1‑4 (MQ=255) | CTGTCCCTGTGGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAAGAGTTTACCGTCAGAAAATTCACAAAATGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGT > NC_021214/1815302‑1815775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |