| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_021214 | 1,815,540 | Δ28 bp | intergenic (‑23/‑201) | TMARI_RS09405 ← / → TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_021214 | 1815540 | 1815567 | 28 | 376 [0] | [0] 372 | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | = 1815539 | 0 (0.000) | 371 (1.340) | 160/404 | 0.1 | 100% | intergenic (‑22/‑229) | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| ? | NC_021214 | 1815568 = | 0 (0.000) | intergenic (‑51/‑200) | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase | |||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
TTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAAGAGTTTACCGTCAGAAAATTCACAAAATGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTACTGCTTGCTTTT > NC_021214/1815335‑1815806 | cctgtggagccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTc > 1:437997‑M2/234‑239 (MQ=255) tgtggagccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACt > 2:311785‑M2/232‑240 (MQ=255) gtggagccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTa > 1:1320805‑M2/231‑240 (MQ=255) ggagccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTaa < 1:299499‑M2/11‑1 (MQ=255) ggagccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAg > 2:665566‑M2/229‑240 (MQ=255) agccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGa > 1:949885‑M2/227‑240 (MQ=255) agccgccgtcaggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGa > 1:8851‑M2/227‑240 (MQ=255) ggaatttggatttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCg < 2:1011939‑M2/25‑1 (MQ=255) tttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGt < 1:1283786‑M2/34‑1 (MQ=255) tttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTg < 1:366134‑M2/35‑1 (MQ=255) tttgatgcttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTg > 1:320718‑M2/206‑240 (MQ=255) cttccaaaatcgacgtactgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGCTTTTAACACAGCATATACGTGATGTCaa > 2:338085‑M2/199‑240 (MQ=255) actgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCgg < 2:615816‑M2/58‑1 (MQ=255) actgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCgg < 1:1201331‑M2/58‑1 (MQ=255) tgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGgtg > 2:136860‑M2/181‑240 (MQ=255) tgaacttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGgtg > 1:660163‑M2/181‑240 (MQ=255) acttcaacagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGtt < 1:290956‑M2/62‑1 (MQ=255) acagggattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAAttt > 2:805498‑M2/172‑201 (MQ=255) gattccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctgggggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTTTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACtc > 2:443155‑M2/167‑240 (MQ=255) ttccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTTGATTAGAATCGGTGTTTTTAAATTActcc > 2:196364‑M2/165‑238 (MQ=255) ttccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTCCtca > 2:1038815‑M2/165‑239 (MQ=255) ttccgtactttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACAGACTTTTCGTGTTGTCAATCTGGATTCGAATCGGGGTTTTTAAATTACtca > 2:1115819‑M2/165‑239 (MQ=255) tttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATc < 2:1228551‑M2/56‑1 (MQ=255) tttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGtt > 2:1317364‑M2/157‑240 (MQ=255) ttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGtt > 1:801246‑M2/156‑239 (MQ=255) ttgccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGtt > 1:643009‑M2/156‑239 (MQ=255) ccttgaattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCTCTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTttcat < 2:152371‑M2/88‑1 (MQ=255) cttgaattcttcccctagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTttcatt < 2:738871‑M2/89‑1 (MQ=255) aattcttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCgg < 1:224146‑M2/58‑1 (MQ=255) cttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTAc < 1:762336‑M2/72‑1 (MQ=255) ttccccgagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccaggtggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAatat < 1:1002799‑M2/98‑1 (MQ=255) gagtttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAAt < 2:635041‑M2/104‑1 (MQ=255) ttctggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTc < 2:167226‑M2/106‑1 (MQ=255) ggaggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTaa < 1:567333‑M2/112‑1 (MQ=255) ggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATc < 1:468029‑M2/56‑1 (MQ=255) ggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATc > 2:468029‑M2/126‑181 (MQ=255) ggatgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAAtt > 2:779385‑M2/126‑230 (MQ=255) gatgtcaacctgcttttcggaacaccagacggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTAAATCTGGCTTAGAATCGGAGTTTTTAAATTACTCATCACCTGTTTCCTTCAGAAATATCAAAATTCCGTTAATCCt > 2:290057‑M2/125‑240 (MQ=255) atgtcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCt < 1:1038815‑M2/116‑1 (MQ=255) tcaacctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATc > 1:379610‑M2/121‑239 (MQ=255) tcctgcttttccgcacaccagatggtgagctttggtcgggatagcacgaaggcagaaacccacacaagcattaaaacgagcagtcacttctccatggacacctcctttagaatacaaTGTTTCACAAAGGTTTTTAACACCGACTTTTCATGATGTCAATCTGAATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCTTTCACAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTAACGACa < 2:687163‑M2/123‑1 (MQ=255) acctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACa < 1:343457‑M2/123‑1 (MQ=255) acctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACa < 1:334547‑M2/123‑1 (MQ=255) acctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACa < 1:262032‑M2/123‑1 (MQ=255) acctgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACa < 1:1335230‑M2/123‑1 (MQ=255) tgcttttcggaacaccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAAtt > 1:856436‑M2/115‑219 (MQ=255) ttttcggaacatcagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTGTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATGCCGTTAACCCTATCGACATGTTAt < 2:1153663‑M2/129‑1 (MQ=255) ccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTATCCCTATCGACATGTTATGAATTGGgtgt < 1:188811‑M2/140‑1 (MQ=255) ccagatggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGgtgt < 2:1210002‑M2/140‑1 (MQ=255) tggtgagctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTa < 2:41849‑M2/142‑1 (MQ=255) agctttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGttt > 1:1012945‑M2/91‑175 (MQ=255) tttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGa < 1:115866‑M2/153‑1 (MQ=255) ttgtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGgtgt > 2:184046‑M2/87‑226 (MQ=255) gtttgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAATTATCGAAATTCCGTTAACCCTATAGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACgg > 2:42614‑M2/85‑240 (MQ=255) tgtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAAccc < 1:989487‑M2/115‑1 (MQ=255) gtgataacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACATACGGAttt < 1:411283‑M2/160‑1 (MQ=255) taacaccagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTgtgt < 2:594087‑M2/164‑1 (MQ=255) cagagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGAc < 1:527846‑M2/122‑1 (MQ=255) gagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACa < 1:823525‑M2/123‑1 (MQ=255) gagcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTgtgt < 2:1082168‑M2/164‑1 (MQ=255) gcagaaaccacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAAt > 2:233777‑M2/67‑170 (MQ=255) cacaacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTNTNANTNAGAANTATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGa < 2:360799‑M2/182‑1 (MQ=255) caacaagcattaaaacgagcagttgcttctccagggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAAt < 2:366892‑M2/184‑1 (MQ=255) caacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGttt > 1:668052‑M2/57‑141 (MQ=255) caacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAAt < 1:1089643‑M2/184‑1 (MQ=255) caacaagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAAt > 1:1071386‑M2/57‑240 (MQ=255) caagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGa > 2:92595‑M2/54‑228 (MQ=255) caagcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGtt > 2:1047513‑M2/54‑240 (MQ=255) agcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAAtata > 2:12587‑M2/52‑198 (MQ=255) agcattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAAtata < 1:12587‑M2/147‑1 (MQ=255) cattaaaacgagcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGAttt < 1:429913‑M2/160‑1 (MQ=255) aaacgatcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATg < 2:82404‑M2/196‑1 (MQ=255) agcagtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATgagga < 2:390286‑M2/200‑1 (MQ=255) agtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACCCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTgtgt > 1:926180‑M2/37‑200 (MQ=255) gtctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGaa > 1:736656‑M2/36‑240 (MQ=255) ctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGTTTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGAc > 2:1177844‑M2/34‑187 (MQ=255) ctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGAc < 1:1177844‑M2/154‑1 (MQ=255) ctcttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGaa < 2:794224‑M2/205‑1 (MQ=255) cttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTgg < 2:711824‑M2/136‑1 (MQ=255) cttcaccatggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTgg > 1:711824‑M2/32‑167 (MQ=255) catggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCTAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTATCCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTgtgt < 2:1288739‑M2/164‑1 (MQ=255) catggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTgg > 2:8568‑M2/26‑161 (MQ=255) catggacacctcctttagattacaaTGTTTCACTAACGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGCTTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGGATTGTGTTCATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGCAAATGAGGAGGGagggttggtaag > 2:117126‑M2/26‑235 (MQ=255) cctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGGTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGCTAACCCTATCGACATGTTATGAATTCGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGGGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCttt > 1:94012‑M2/18‑240 (MQ=255) ctcctttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACa > 1:122676‑M2/17‑139 (MQ=255) ttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAAc > 2:958023‑M2/12‑91 (MQ=255) ttagattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGCATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCAtttttt > 2:755488‑M2/12‑237 (MQ=255) gattacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAAtt < 1:779918‑M2/134‑1 (MQ=255) attacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACtcat < 2:657322‑M2/76‑1 (MQ=255) attacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCg < 1:350013‑M2/120‑1 (MQ=255) attacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGgtgt > 2:249238‑M2/8‑147 (MQ=255) attacaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTgtgt > 2:34650‑M2/8‑171 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGgt > 1:1122434‑M2/5‑63 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGaa < 2:545049‑M2/205‑1 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGACGAAGCCTTTTTTACtgcttgct > 2:1023075‑M2/5‑240 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTAc < 1:183218‑M2/228‑1 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTACtgcttgct > 2:519665‑M2/5‑240 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTACtgcttgct > 2:207143‑M2/5‑240 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTACtgcttgct > 1:595973‑M2/5‑240 (MQ=255) acaaTGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTACtgcttgct > 1:245229‑M2/5‑240 (MQ=255) | TTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAAGAGTTTACCGTCAGAAAATTCACAAAATGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGTTGTGAAGAAGCCTTTTTTACTGCTTGCTTTT > NC_021214/1815335‑1815806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |