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Minimum Cutoff:       Maximum Cutoff:

Ignored Genes

Enter gene(s) separated by ',' ex: tpoB,folD

Ignored Mutations

Mut ID Position Mutation Type Sequence Change Gene Function Product GO Process GO Component Details
1904838 3247065 SNP C→T
bdbD, cadA
 disulfide bond formation protein BdbD/cadmium-translocating P-type ATPase intergenic (‑11/+110)
1904861 607592 SNP A→C
EO946_RS03185
 collagen-like protein E145D (GAA→GAC)
1904905 2979248 SNP T→C
EO946_RS15430
 23S ribosomal RNA noncoding (1553/2928 nt)
1904906 2980160 SNP G→A
EO946_RS15430
 23S ribosomal RNA noncoding (641/2928 nt)
1904913 3285567 SNP C→T
EO946_RS16995
 IS3 family transposase L278L (CTG→CTA)
1904914 3285575 SNP T→G
EO946_RS16995
 IS3 family transposase N276H (AAT→CAT)
1904915 3285580 SNP A→G
EO946_RS16995
 IS3 family transposase I274T (ATA→ACA)
1904916 3285647 SNP C→A
EO946_RS16995
 IS3 family transposase V252L (GTA→TTA)
1904917 3285713 SNP G→A
EO946_RS16995
 IS3 family transposase L230L (CTA→TTA)
1904923 3446970 SNP G→T
degU
 two-component system response regulator DegU Q206K (CAA→AAA)
1904976 607700 SNP A→C
EO946_RS03185
 collagen-like protein E181D (GAA→GAC)
1904977 607702 SNP C→T
EO946_RS03185
 collagen-like protein A182V (GCC→GTC)
1905023 2991245 SNP G→T
gbsR, bslA
 transcriptional regulator GbsR/biofilm-surface layer protein BslA intergenic (+46/‑161)
1905081 2978137 SNP A→T
EO946_RS15430
 23S ribosomal RNA noncoding (2664/2928 nt)
1905162 2981253 SNP C→T
EO946_RS15435
 16S ribosomal RNA noncoding (1267/1550 nt)
1905203 2982236 SNP T→C
EO946_RS15435
 16S ribosomal RNA noncoding (284/1550 nt)
1905510 177053 SNP C→A
EO946_RS01020, EO946_RS01025
 alcohol dehydrogenase/SulP family inorganic anion transporter intergenic (+226/‑46)
1923884 1 AMP 202,300 bp x 2
dnaA,dnaN,rlbA,recF,remB,gyrB,gyrA,EO946_RS00040,EO946_RS00045,EO946_RS00050,EO946_RS00055,rrf,EO946_RS00065,guaB,dacA,pdxS,pdxT,serS,EO946_RS00095,dck,dgk,EO946_RS00110,EO946_RS00115,tadA,ffs,dnaX,EO946_RS00135,recR,EO946_RS00145,bofA,EO946_RS00155,EO946_RS00160,EO946_RS00165,EO946_RS00170,rrf,csfB,EO946_RS00185,EO946_RS00190,EO946_RS00195,tmk,darA,EO946_RS00210,holB,ricT,yabA,EO946_RS00230,EO946_RS00235,rsmI,abrB,metG,EO946_RS00255,EO946_RS00260,rnmV,rsmA,prtG,EO946_RS00280,EO946_RS00285,ispE,purR,EO946_RS00300,spoVG,glmU,EO946_RS00315,EO946_RS00320,pth,fin,mfd,spoVT,EO946_RS00345,mazG,EO946_RS00355,yabP,yabQ,divIC,EO946_RS00375,EO946_RS00380,EO946_RS00385,spoIIE,EO946_RS00395,prkT,tilS,hpt,ftsH,EO946_RS00420,hslO,EO946_RS00430,cysK,EO946_RS00440,pabA,pabC,folP,folB,folK,EO946_RS00470,dusB,lysS,EO946_RS00485,EO946_RS00490,rrf,EO946_RS00500,EO946_RS00505,EO946_RS00510,EO946_RS00515,EO946_RS00520,EO946_RS00525,EO946_RS00530,EO946_RS00535,EO946_RS00540,EO946_RS00545,EO946_RS00550,rrf,ctsR,mcsA,EO946_RS00570,clpC,radA,disA,EO946_RS00590,ispD,ispF,gltX,cysE,cysS,EO946_RS00620,rlmB,rae1,sigH,rpmG,secE,nusG,rplK,rplA,rplJ,rplL,EO946_RS00675,rpoB,rpoC,EO946_RS00690,rpsL,rpsG,fusA,tuf,EO946_RS00715,rpsJ,rplC,rplD,rplW,rplB,rpsS,rplV,rpsC,rplP,rpmC,rpsQ,rplN,rplX,rplE,rpsN,rpsH,rplF,rplR,rpsE,rpmD,rplO,secY,EO946_RS00830,map,infA,rpmJ,rpsM,rpsK,EO946_RS00865,rplQ,EO946_RS00875,EO946_RS00880,EO946_RS00885,truA,rplM,rpsI,EO946_RS00910,EO946_RS00915,cwlD,salA,gerD,kbaA,pdaB,EO946_RS00945,EO946_RS00950,rrf,EO946_RS00960,EO946_RS00965,EO946_RS00970,EO946_RS00975,EO946_RS00980,EO946_RS00985,EO946_RS00990,EO946_RS00995,rrf,EO946_RS01005,EO946_RS01010,rrf,EO946_RS01020,EO946_RS01025,EO946_RS01030,EO946_RS01035,feuC,EO946_RS01045,feuA,EO946_RS01055,EO946_RS01060,EO946_RS01065,pbp4b,EO946_RS01075,EO946_RS01080,murQ,EO946_RS01090,EO946_RS01095,EO946_RS01100,EO946_RS01105,EO946_RS01110,EO946_RS01115,EO946_RS01120,sigW,rsiW,cdaA,cdaR,glmM,glmS
 [dnaA],dnaN,rlbA,recF,remB,gyrB,gyrA,EO946_RS00040,EO946_RS00045,EO946_RS00050,EO946_RS00055,rrf,EO946_RS00065,guaB,dacA,pdxS,pdxT,serS,EO946_RS00095,dck,dgk,EO946_RS00110,EO946_RS00115,tadA,ffs,dnaX,EO946_RS00135,recR,EO946_RS00145,bofA,EO946_RS00155,EO946_RS00160,EO946_RS00165,EO946_RS00170,rrf,csfB,EO946_RS00185,EO946_RS00190,EO946_RS00195,tmk,darA,EO946_RS00210,holB,ricT,yabA,EO946_RS00230,EO946_RS00235,rsmI,abrB,metG,EO946_RS00255,EO946_RS00260,rnmV,rsmA,prtG,EO946_RS00280,EO946_RS00285,ispE,purR,EO946_RS00300,spoVG,glmU,EO946_RS00315,EO946_RS00320,pth,fin,mfd,spoVT,EO946_RS00345,mazG,EO946_RS00355,yabP,yabQ,divIC,EO946_RS00375,EO946_RS00380,EO946_RS00385,spoIIE,EO946_RS00395,prkT,tilS,hpt,ftsH,EO946_RS00420,hslO,EO946_RS00430,cysK,EO946_RS00440,pabA,pabC,folP,folB,folK,EO946_RS00470,dusB,lysS,EO946_RS00485,EO946_RS00490,rrf,EO946_RS00500,EO946_RS00505,EO946_RS00510,EO946_RS00515,EO946_RS00520,EO946_RS00525,EO946_RS00530,EO946_RS00535,EO946_RS00540,EO946_RS00545,EO946_RS00550,rrf,ctsR,mcsA,EO946_RS00570,clpC,radA,disA,EO946_RS00590,ispD,ispF,gltX,cysE,cysS,EO946_RS00620,rlmB,rae1,sigH,rpmG,secE,nusG,rplK,rplA,rplJ,rplL,EO946_RS00675,rpoB,rpoC,EO946_RS00690,rpsL,rpsG,fusA,tuf,EO946_RS00715,rpsJ,rplC,rplD,rplW,rplB,rpsS,rplV,rpsC,rplP,rpmC,rpsQ,rplN,rplX,rplE,rpsN,rpsH,rplF,rplR,rpsE,rpmD,rplO,secY,EO946_RS00830,map,infA,rpmJ,rpsM,rpsK,EO946_RS00865,rplQ,EO946_RS00875,EO946_RS00880,EO946_RS00885,truA,rplM,rpsI,EO946_RS00910,EO946_RS00915,cwlD,salA,gerD,kbaA,pdaB,EO946_RS00945,EO946_RS00950,rrf,EO946_RS00960,EO946_RS00965,EO946_RS00970,EO946_RS00975,EO946_RS00980,EO946_RS00985,EO946_RS00990,EO946_RS00995,rrf,EO946_RS01005,EO946_RS01010,rrf,EO946_RS01020,EO946_RS01025,EO946_RS01030,EO946_RS01035,feuC,EO946_RS01045,feuA,EO946_RS01055,EO946_RS01060,EO946_RS01065,pbp4b,EO946_RS01075,EO946_RS01080,murQ,EO946_RS01090,EO946_RS01095,EO946_RS01100,EO946_RS01105,EO946_RS01110,EO946_RS01115,EO946_RS01120,sigW,rsiW,cdaA,cdaR,glmM,glmS duplication
1923906 607424 SUB 27 bp→108 bp
EO946_RS03185
 collagen-like protein coding (267‑293/1125 nt)
1923938 1 AMP 202,200 bp x 2
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1923942 917601 AMP 4,600 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675
 [EO946_RS04670],EO946_RS04675 duplication
1923944 2971601 AMP 10,900 bp x 2
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 [glgD],EO946_RS15310,glgB,EO946_RS15320,EO946_RS15325,EO946_RS15330,EO946_RS15335,EO946_RS15340,EO946_RS15345,EO946_RS15350,EO946_RS15355,EO946_RS15360,EO946_RS15365,EO946_RS15370,EO946_RS15375,EO946_RS15380,EO946_RS15385,EO946_RS15390,EO946_RS15395,EO946_RS15400,EO946_RS15405,EO946_RS15410,EO946_RS15415,EO946_RS15420,rrf,EO946_RS15430,[EO946_RS15435] duplication
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 [EO946_RS04670],EO946_RS04675,rrf,[EO946_RS04685] duplication
1924017 917501 AMP 4,900 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685
 EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,[EO946_RS04685] duplication
1924020 2970201 AMP 12,300 bp x 2
glgA,glgD,EO946_RS15310,glgB,EO946_RS15320,EO946_RS15325,EO946_RS15330,EO946_RS15335,EO946_RS15340,EO946_RS15345,EO946_RS15350,EO946_RS15355,EO946_RS15360,EO946_RS15365,EO946_RS15370,EO946_RS15375,EO946_RS15380,EO946_RS15385,EO946_RS15390,EO946_RS15395,EO946_RS15400,EO946_RS15405,EO946_RS15410,EO946_RS15415,EO946_RS15420,rrf,EO946_RS15430,EO946_RS15435
 [glgA],glgD,EO946_RS15310,glgB,EO946_RS15320,EO946_RS15325,EO946_RS15330,EO946_RS15335,EO946_RS15340,EO946_RS15345,EO946_RS15350,EO946_RS15355,EO946_RS15360,EO946_RS15365,EO946_RS15370,EO946_RS15375,EO946_RS15380,EO946_RS15385,EO946_RS15390,EO946_RS15395,EO946_RS15400,EO946_RS15405,EO946_RS15410,EO946_RS15415,EO946_RS15420,rrf,EO946_RS15430,[EO946_RS15435] duplication
1924064 917501 AMP 4,700 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675
 EO946_RS04670,EO946_RS04675 duplication
1924067 2971701 AMP 10,800 bp x 2
glgD,EO946_RS15310,glgB,EO946_RS15320,EO946_RS15325,EO946_RS15330,EO946_RS15335,EO946_RS15340,EO946_RS15345,EO946_RS15350,EO946_RS15355,EO946_RS15360,EO946_RS15365,EO946_RS15370,EO946_RS15375,EO946_RS15380,EO946_RS15385,EO946_RS15390,EO946_RS15395,EO946_RS15400,EO946_RS15405,EO946_RS15410,EO946_RS15415,EO946_RS15420,rrf,EO946_RS15430,EO946_RS15435
 [glgD],EO946_RS15310,glgB,EO946_RS15320,EO946_RS15325,EO946_RS15330,EO946_RS15335,EO946_RS15340,EO946_RS15345,EO946_RS15350,EO946_RS15355,EO946_RS15360,EO946_RS15365,EO946_RS15370,EO946_RS15375,EO946_RS15380,EO946_RS15385,EO946_RS15390,EO946_RS15395,EO946_RS15400,EO946_RS15405,EO946_RS15410,EO946_RS15415,EO946_RS15420,rrf,EO946_RS15430,[EO946_RS15435] duplication
1924105 213101 AMP 14,900 bp x 2
thrC,EO946_RS01215,EO946_RS01220,EO946_RS01225,EO946_RS01230,EO946_RS01235,aepX,EO946_RS01245,EO946_RS01250,EO946_RS01255,EO946_RS01260,EO946_RS01265,EO946_RS01270,EO946_RS01275,EO946_RS01280,EO946_RS01285,EO946_RS01290
 [thrC],EO946_RS01215,EO946_RS01220,EO946_RS01225,EO946_RS01230,EO946_RS01235,aepX,EO946_RS01245,EO946_RS01250,EO946_RS01255,EO946_RS01260,EO946_RS01265,EO946_RS01270,EO946_RS01275,EO946_RS01280,EO946_RS01285,[EO946_RS01290] duplication
1924111 2978101 AMP 4,400 bp x 2
EO946_RS15430,EO946_RS15435
 [EO946_RS15430],[EO946_RS15435] duplication
1924145 2977901 AMP 4,600 bp x 2
EO946_RS15430,EO946_RS15435
 [EO946_RS15430],[EO946_RS15435] duplication
2651538 2502242 SNP T→G
hrcA
 heat-inducible transcriptional repressor HrcA T274P (ACG→CCG)
2651541 2991227 SNP T→G
gbsR, bslA
 transcriptional regulator GbsR/biofilm-surface layer protein BslA intergenic (+28/‑179)
2651554 3669801 AMP 5,000 bp x 2
EO946_RS18880,albG,EO946_RS18890,rapF,phrF,speB,speE
 [EO946_RS18880],albG,EO946_RS18890,rapF,phrF,speB,[speE] duplication
2651555 3679201 AMP 3,500 bp x 2
EO946_RS18935,EO946_RS18940,EO946_RS18945,thrS,EO946_RS18955
 [EO946_RS18935],EO946_RS18940,EO946_RS18945,thrS,[EO946_RS18955] duplication
2651556 3818701 AMP 2,500 bp x 2
EO946_RS19660,galE,EO946_RS19670,pepT
 [EO946_RS19660],galE,EO946_RS19670,[pepT] duplication
2651557 3954401 AMP 11,900 bp x 2
ahpC,ahpF,EO946_RS20350,bglA,EO946_RS20360,EO946_RS20365,EO946_RS20370,EO946_RS20375,EO946_RS20380
 ahpC,ahpF,EO946_RS20350,bglA,EO946_RS20360,EO946_RS20365,EO946_RS20370,EO946_RS20375,[EO946_RS20380] duplication
2651558 3977101 AMP 68,500 bp x 2
EO946_RS20885,EO946_RS20420,EO946_RS20425,EO946_RS20430,EO946_RS20435,rapG,EO946_RS20445,rocF,EO946_RS20455,rocD,rocR,htrC,EO946_RS20480,walI,walH,walK,walR,EO946_RS20505,EO946_RS20510,EO946_RS20515,EO946_RS20520,purA,EO946_RS20530,dnaB,EO946_RS20540,EO946_RS20545,EO946_RS20550,EO946_RS20555,EO946_RS20560,rplI,gdpP,EO946_RS20575,EO946_RS20580,cotF,hypR,EO946_RS20595,EO946_RS20600,EO946_RS20605,EO946_RS20610,EO946_RS20615,EO946_RS20620,EO946_RS20625,EO946_RS20630,EO946_RS20635,EO946_RS20640,EO946_RS20645,EO946_RS20650,EO946_RS20655,EO946_RS20660,EO946_RS20665,EO946_RS20670,EO946_RS20675,EO946_RS20680,EO946_RS20685,EO946_RS20690,EO946_RS20695,EO946_RS20700,xth,rpsR,ssbA,rpsF,ychF,EO946_RS20730,EO946_RS20735,EO946_RS20740,yyaC,spo0J,soj,EO946_RS20760,noc,rsmG,mnmG,mnmE,EO946_RS20785,spoIIIJ,rnpA,rpmH
 EO946_RS20885,EO946_RS20420,EO946_RS20425,EO946_RS20430,EO946_RS20435,rapG,EO946_RS20445,rocF,EO946_RS20455,rocD,rocR,htrC,EO946_RS20480,walI,walH,walK,walR,EO946_RS20505,EO946_RS20510,EO946_RS20515,EO946_RS20520,purA,EO946_RS20530,dnaB,EO946_RS20540,EO946_RS20545,EO946_RS20550,EO946_RS20555,EO946_RS20560,rplI,gdpP,EO946_RS20575,EO946_RS20580,cotF,hypR,EO946_RS20595,EO946_RS20600,EO946_RS20605,EO946_RS20610,EO946_RS20615,EO946_RS20620,EO946_RS20625,EO946_RS20630,EO946_RS20635,EO946_RS20640,EO946_RS20645,EO946_RS20650,EO946_RS20655,EO946_RS20660,EO946_RS20665,EO946_RS20670,EO946_RS20675,EO946_RS20680,EO946_RS20685,EO946_RS20690,EO946_RS20695,EO946_RS20700,xth,rpsR,ssbA,rpsF,ychF,EO946_RS20730,EO946_RS20735,EO946_RS20740,yyaC,spo0J,soj,EO946_RS20760,noc,rsmG,mnmG,mnmE,EO946_RS20785,spoIIIJ,rnpA,rpmH duplication
2651581 2991252 SNP C→A
gbsR, bslA
 transcriptional regulator GbsR/biofilm-surface layer protein BslA intergenic (+53/‑154)
2651592 625601 AMP 6,300 bp x 2
EO946_RS03280,EO946_RS03285,rrf,EO946_RS03295,EO946_RS03300,thiL,tsaE,tsaB
 [EO946_RS03280],EO946_RS03285,rrf,EO946_RS03295,EO946_RS03300,thiL,tsaE,[tsaB] duplication
2651593 3487901 AMP 4,700 bp x 2
EO946_RS17965,EO946_RS17970,EO946_RS17975,EO946_RS17980,EO946_RS17985
 [EO946_RS17965],EO946_RS17970,EO946_RS17975,EO946_RS17980,[EO946_RS17985] duplication
2651655 1418381 SNP A→G
EO946_RS07425, pfeT
 TlpA family protein disulfide reductase/metal-transporting ATPase PfeT intergenic (+112/‑123)
2651793 625101 AMP 5,400 bp x 2
EO946_RS03280,EO946_RS03285,rrf,EO946_RS03295,EO946_RS03300,thiL
 [EO946_RS03280],EO946_RS03285,rrf,EO946_RS03295,EO946_RS03300,[thiL] duplication
2651795 917501 AMP 5,100 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690
 EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690 duplication
2651799 917501 AMP 5,300 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690,EO946_RS04695,EO946_RS04700,EO946_RS04705
 EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690,EO946_RS04695,EO946_RS04700,[EO946_RS04705] duplication
2651860 1 AMP 44,600 bp x 2
dnaA,dnaN,rlbA,recF,remB,gyrB,gyrA,EO946_RS00040,EO946_RS00045,EO946_RS00050,EO946_RS00055,rrf,EO946_RS00065,guaB,dacA,pdxS,pdxT,serS,EO946_RS00095,dck,dgk,EO946_RS00110,EO946_RS00115,tadA,ffs,dnaX,EO946_RS00135,recR,EO946_RS00145,bofA,EO946_RS00155,EO946_RS00160,EO946_RS00165,EO946_RS00170,rrf,csfB,EO946_RS00185,EO946_RS00190,EO946_RS00195,tmk,darA,EO946_RS00210,holB,ricT,yabA,EO946_RS00230,EO946_RS00235,rsmI,abrB
 [dnaA],dnaN,rlbA,recF,remB,gyrB,gyrA,EO946_RS00040,EO946_RS00045,EO946_RS00050,EO946_RS00055,rrf,EO946_RS00065,guaB,dacA,pdxS,pdxT,serS,EO946_RS00095,dck,dgk,EO946_RS00110,EO946_RS00115,tadA,ffs,dnaX,EO946_RS00135,recR,EO946_RS00145,bofA,EO946_RS00155,EO946_RS00160,EO946_RS00165,EO946_RS00170,rrf,csfB,EO946_RS00185,EO946_RS00190,EO946_RS00195,tmk,darA,EO946_RS00210,holB,ricT,yabA,EO946_RS00230,EO946_RS00235,rsmI,[abrB] duplication
2651861 625601 AMP 4,900 bp x 2
EO946_RS03280,EO946_RS03285,rrf,EO946_RS03295,EO946_RS03300,thiL
 [EO946_RS03280],EO946_RS03285,rrf,EO946_RS03295,EO946_RS03300,[thiL] duplication
2651862 917901 AMP 4,700 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690
 [EO946_RS04670],EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690 duplication
2651863 917501 AMP 5,400 bp x 2
EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690,EO946_RS04695,EO946_RS04700,EO946_RS04705
 EO946_RS04670,EO946_RS04675,rrf,EO946_RS04685,EO946_RS04690,EO946_RS04695,EO946_RS04700,EO946_RS04705 duplication
2651872 607628 SNP A→C
EO946_RS03185
 collagen-like protein E157D (GAA→GAC)
2651873 607630 SNP C→T
EO946_RS03185
 collagen-like protein A158V (GCC→GTC)
2651895 198101 AMP 4,100 bp x 2
cdaR,glmM,glmS
 [cdaR],glmM,glmS duplication
2651896 625401 AMP 4,100 bp x 2
EO946_RS03280,EO946_RS03285,rrf
 [EO946_RS03280],EO946_RS03285,[rrf] duplication
2651921 1 AMP 155,500 bp x 2
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2652046 2991236 SNP C→T
gbsR, bslA
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Starting Strain Mutations

Mut ID Position Mutation Type Sequence Change Gene Function Product GO Process GO Component Details