Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F6 I1 R1
|
78 |
1766.9 |
106897164 |
98.9% |
105721295 |
100.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
5,312,206 |
A→C |
noncoding (476/1522 nt) |
PP_16SG rRNA (16S ribosomal RNA) ← |
|
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 5,312,206 | 0 | A | C | 84.7%
| 17.0
/ 14.6
| 85 | noncoding (476/1522 nt) | PP_16SG rRNA (16S ribosomal RNA) | |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/9); new base C (72/0); total (76/9) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.74e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTAACAAACCACCTACGCGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACTTACTGCCCTTCCTCCCAACTTAAAGTGCTTTACAATCCGAAGACCTTCTTCACACACGCG > AE015451_phaM1/5312107‑5312302
|
ttcaCAAACCACCTACGCGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTa > 7:46261074/4‑100 (MQ=1)
ccccccTACGCGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTACCGCTTGCACCCTCTGTCTTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTc > 7:29243142/5‑100 (MQ=1)
acttACGCGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGt > 8:42862188/4‑100 (MQ=1)
tctgcgcgcgCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAGCGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTa > 8:48094176/5‑100 (MQ=0)
ctgcgcgcgCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCGGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTaa < 7:36344425/97‑1 (MQ=0)
tgcgtgcgcTTTGCGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:353687/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGNCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:284170/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCCCCCTCCGTCTTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:103786/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCTTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:289024/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:340535/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:258524/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:33722/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:326833/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:308910/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:308474/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:28466/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:282537/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:276453/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:276452/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:101881/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:263824/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:260951/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:276074/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:348450/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:350790/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:35595/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:373053/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:5288/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:52904/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:5704/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:57091/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:7075/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:70865/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:71741/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:77615/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:78205/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:83784/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:88210/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:96572/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:147561/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:168262/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:165434/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:165197/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:163652/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:162477/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:158167/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:157315/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:149471/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:149155/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:253410/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:142717/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:135704/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:130211/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:12148/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:119267/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:110767/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:109002/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:104667/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:176080/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:25645/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:243904/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:241886/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:236900/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:236634/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:235626/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:228283/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:225435/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:206470/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:205620/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:173690/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:18020/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:18504/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:194705/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:199322/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:202244/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:202672/6‑100 (MQ=1)
tgcgtgcgcTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCGGGTAAc > 4:206005/6‑100 (MQ=1)
ctctACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAAc < 8:28388522/97‑1 (MQ=1)
ctctACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATCCTGTCGGTAACGTCAAAAc < 8:30473138/97‑1 (MQ=0)
ttccGCCCAGTACTTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAACAg > 7:42979768/4‑100 (MQ=0)
gtcagATTAACGCTTGCACCCGCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACt < 8:6647216/96‑1 (MQ=0)
gcgcccTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACTTACGGCCCTtcctcc < 7:8518117/97‑1 (MQ=0)
ctttGTATTACCGCGGCTGCTGGTACAGAGTTAGCCGGTGCTTACTCTGTCGGTAACGTCAAAACATCAAGGTATTAACTTACTGCCCTTCCTCCTAACt < 8:48808800/97‑1 (MQ=1)
ttagtACCGCGGCTGCTGGCACAGAGGTAGCCGGTGCTGAGTATGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTAGTAACGTACTGCCCTGCCTCCCAACTGaaa < 7:45189901/96‑1 (MQ=1)
gcgggCACAGAGTTAGCCGGTGCTGATTCTGTCGGGAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACTTACTGCACTTCCTCCCAACTTAAAGGGCGTTACAATcc < 8:2540142/97‑1 (MQ=1)
ttggCCTGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACTTACTGCCCTTCCTCCCAACTTAAAGTGCTTTACAATCCGAAGACcttctt < 8:42215849/97‑1 (MQ=0)
ctcaTTCTGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACTTACTGCCCTTCCTCCCAACTTAAAGTGCTTTACAATCCGAAGACCTTCTTCACACAcgcg > 7:43433416/4‑100 (MQ=1)
|
TTAACAAACCACCTACGCGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGATTAACGCTTGCACCCTCTGTATTACCGCGGCTGCTGGCACAGAGTTAGCCGGTGCTTATTCTGTCGGTAACGTCAAAACAGCAAGGTATTAACTTACTGCCCTTCCTCCCAACTTAAAGTGCTTTACAATCCGAAGACCTTCTTCACACACGCG > AE015451_phaM1/5312107‑5312302
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
