Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F6 I2 R1
|
82 |
1220.1 |
55734442 |
98.2% |
54731222 |
136.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
5,659,806 |
G→C |
A284P (GCC→CCC) |
metK CDS (methionine adenosyltransferase) → |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 5,659,806 | 0 | G | C | 99.9%
| 4072.4
/ NA
| 977 | A284P (GCC→CCC) | metK CDS (methionine adenosyltransferase) | |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (528/448); minor base A (1/0); total (529/448) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 984 total aligned reads displayed.
GGGTGACTGCGGCCTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGGCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCC > AE015451_phaM1/5659670‑5659941
|
gggtgACTGCGGCCTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGccc > 2:6185716/1‑139 (MQ=255)
gACTGCGGCCTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGa > 2:15031355/1‑139 (MQ=255)
cTGCGGCCTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAAc > 2:14107821/1‑139 (MQ=255)
ccTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACAtcgtc > 1:11080833/1‑139 (MQ=255)
ccTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACAtcgtc > 1:21613836/1‑139 (MQ=255)
ccTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACAtcgtc > 1:21267804/1‑139 (MQ=255)
ccTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACAtcgtc > 2:23039245/1‑139 (MQ=255)
tGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTcgc > 2:9111486/1‑139 (MQ=255)
tGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTcgc > 1:14048556/1‑139 (MQ=255)
ggCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGccgccg < 2:21341823/139‑1 (MQ=255)
gtcgACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGtt < 1:9518678/139‑1 (MQ=255)
tcgACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTg < 2:18468696/139‑1 (MQ=255)
cTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCgag < 2:17955559/139‑1 (MQ=255)
tCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCgaga < 1:10564434/139‑1 (MQ=255)
tCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCgaga < 1:2525251/139‑1 (MQ=255)
tCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCgaga < 1:7818924/139‑1 (MQ=255)
tCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCgaga < 1:17817529/139‑1 (MQ=255)
cTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATc < 1:18479538/139‑1 (MQ=255)
cTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATc < 1:7451031/139‑1 (MQ=255)
cTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATc < 1:6508054/139‑1 (MQ=255)
tACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATcc < 2:26931458/139‑1 (MQ=255)
tGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGGGTTCTCGGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCAGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGTGCGTTGCGAGATCCAGgtg < 2:20840316/139‑1 (MQ=255)
tGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGgtg > 1:6914312/1‑139 (MQ=255)
tGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGgtg > 1:24784300/1‑139 (MQ=255)
gCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTc < 2:10342917/139‑1 (MQ=255)
tGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTa > 1:14356697/1‑139 (MQ=255)
gCCGGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACg > 2:3452456/1‑139 (MQ=255)
gCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACg > 1:27255378/1‑139 (MQ=255)
gCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACg < 1:10165502/139‑1 (MQ=255)
gCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACg > 1:4985205/1‑139 (MQ=255)
gTCACGGGNGTGGTGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCAt > 1:23214688/1‑139 (MQ=255)
cACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTg < 1:5919541/139‑1 (MQ=255)
cACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTg < 1:4190225/139‑1 (MQ=255)
cggcggTGGCGCGTTCTCAGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCCTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGc > 2:5374219/1‑139 (MQ=255)
cGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGgtg < 2:9317795/124‑1 (MQ=255)
cGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACg > 2:15896888/1‑131 (MQ=255)
cGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACg < 1:15896888/131‑1 (MQ=255)
cGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGc > 2:14422023/1‑139 (MQ=255)
cGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGc > 2:8469103/1‑139 (MQ=255)
ggCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGccc < 1:13017976/139‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCa < 2:4716541/139‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCa < 1:18135914/139‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCa < 1:9957742/139‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCa < 1:2360001/139‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCa < 1:13404771/139‑1 (MQ=255)
gcgcGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCa < 1:27810277/139‑1 (MQ=255)
cgcgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAg > 2:19909344/1‑139 (MQ=255)
cgcgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAg > 2:7254632/1‑139 (MQ=255)
gcgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCGAGc > 2:16875411/1‑139 (MQ=255)
gcgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGc > 2:25359150/1‑139 (MQ=255)
gcgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGc > 2:5698949/1‑139 (MQ=255)
gcgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGc > 2:11799402/1‑139 (MQ=255)
cgTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACAACGTCGCCGCCGGTTTGGCCCAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGcc > 1:22254659/1‑139 (MQ=255)
tctcCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGAc > 2:19064974/1‑139 (MQ=255)
tctcCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGAc > 1:20879274/1‑139 (MQ=255)
tcCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGTTCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCt > 2:23386645/1‑139 (MQ=255)
tcCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCCTTGGCGTGGCCCAGCCCAcca > 2:3003560/1‑138 (MQ=255)
tcCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCt > 2:27681665/1‑139 (MQ=255)
cGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTcc < 2:2593788/139‑1 (MQ=255)
cGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTcc < 2:751255/139‑1 (MQ=255)
cAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCAtc > 1:3184380/1‑139 (MQ=255)
aCCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGAt > 1:26273186/1‑139 (MQ=255)
cccGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATc < 1:8386360/139‑1 (MQ=255)
cccGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATc < 1:14812555/139‑1 (MQ=255)
cccGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATc < 2:2496945/139‑1 (MQ=255)
cGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCaa > 1:16698161/1‑139 (MQ=255)
gTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACACCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAac < 1:5254876/139‑1 (MQ=255)
tCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCgg > 2:682671/1‑139 (MQ=255)
tCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCgg > 2:24293458/1‑139 (MQ=255)
aCCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTAc > 2:20236319/1‑139 (MQ=255)
ccGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTAcc < 1:19909344/139‑1 (MQ=255)
ccGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTAcc < 2:23807727/139‑1 (MQ=255)
cGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCg > 1:11527511/1‑139 (MQ=255)
cGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCg > 2:12741743/1‑139 (MQ=255)
cGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCg < 2:22432437/139‑1 (MQ=255)
cGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCg > 2:1963230/1‑139 (MQ=255)
cGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCg > 2:11414895/1‑139 (MQ=255)
cGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCg < 2:17088466/139‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCgg > 2:12464573/1‑139 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCgg > 2:13505227/1‑139 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCgg > 2:16488793/1‑139 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCgg > 2:26419026/1‑139 (MQ=255)
gTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCgg > 1:15424729/1‑139 (MQ=255)
gCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAgg < 1:19642386/139‑1 (MQ=255)
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GTGCCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAG < VH01111:79:AACJV3JHV:2:1607:18023:42177/153‑1 (MQ=60)
CCCAAGTACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAGTGC > VH01111:79:AACJV3JHV:1:2214:10278:35645/1‑153 (MQ=60)
CCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAGTGC < VH01111:79:AACJV3JHV:1:1602:22757:17452/153‑1 (MQ=60)
CCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAGTGC > VH01111:79:AACJV3JHV:1:1113:45252:36952/1‑153 (MQ=60)
CCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAGTGC > VH01111:79:AACJV3JHV:2:2609:45896:34907/1‑153 (MQ=60)
CCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAGTGC > VH01111:79:AACJV3JHV:1:2405:61897:14328/1‑153 (MQ=60)
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CATCGGTGGCCCGGTGGGTGACTGCGGCCTGACTGGCCGCAAGATCATCGTCGACTCCTACGGTGGCATGGCCCGTCACGGGGGTGGCGCGTTCTCCGGCAAGGACCCGTCCAAGGTCGACCGTTCCGCTGCCTACGCCGGCCGCTACGTGGCCAAGAACATCGTCGCCGCCGGTTTGGCCGAGCGTTGCGAGATCCAGGTGTCGTACGCCATTGGCGTGGCCCAGCCGACCTCCATCTCGATCAACACCTTCGGTACCGGCAAGGTCTCCGACGACAAGATCATCCAGCTGGTGCGCGAGTGC > AE015451_phaM1/5659655‑5659958
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |