Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F91 I7 R1
|
13 |
139.5 |
2546366 |
90.0% |
2291729 |
287.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,802,236 |
C→A |
D275Y (GAT→TAT) |
waaO ← |
UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,802,236 | 0 | C | A | 98.5%
| 437.4
/ ‑2.9
| 136 | D275Y (GAT→TAT) | waaO | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (66/65); total (67/69) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.05e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
AGCCGAAAATCCCAGGCTTTAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGC > NC_000913/3801944‑3802527
|
aaattcgcggCTTAATCTTTATCTATATGTATTGGAGGGAATTAGTTTATAATGCTAACCTTTTCTCATTACTTTATGTTTTCTCAGTTTTGTGGTTTTATCTGTTAAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAAGCCTTTTATATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCTAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCttgg < 1:1233158/293‑1 (MQ=255)
gacTTTAACTTTATCTTTCTCTTAGTCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATTTCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATTCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGccc < 1:54478/298‑1 (MQ=255)
ttAACTTTATCTATCTCTATTGCAGTAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGat < 2:858220/299‑1 (MQ=255)
tAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGatat > 2:172084/1‑300 (MQ=255)
aCTTTCTCTATATCTATTACAGATAATATGTCCAGACATCTTCCCTTATATTATTACTTTATATTTTCCCAGTTTTAAGTCTTTTTCTTTTAAAAAAAATAAAAAAGATAGTTTCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGAGTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATaa < 1:505604/300‑1 (MQ=255)
aCTTTATCTATTTCTATGGCAGAAAATGAGTCCAAAATTCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAAt < 1:44610/301‑1 (MQ=255)
tttATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTAACCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATg < 2:122374/300‑1 (MQ=255)
ctctATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTTTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGTTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGAATAAAAAt > 1:865156/1‑300 (MQ=255)
tctATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTATTCCATGCCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGTTAATCTCAGGCCCAATAATGCCAGAGTTTGGTTGGCAGGATATATTGGATAAAAAt > 2:1200504/1‑299 (MQ=255)
ctAAGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATa < 1:548102/299‑1 (MQ=255)
tGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACATGATAATCCCAGGTCAAATAATGCCAGGGCTGGGTTGGCCCGTTATAAGGGATAAAATGAGTATc > 1:195701/1‑301 (MQ=255)
cAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATGGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGTCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATTGATAAAAATAGttatatt > 2:613105/1‑295 (MQ=255)
gTCCACAATGCTACACTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATGGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGCTACAGGATAATCCAAGGCCCAATAATGCAAGGGCTTGGTTGGCCCGATATCATGGATAAAAATAGTACCGTTGGTTACTggg > 2:78119/1‑301 (MQ=255)
ccACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCACCGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCTTCCATAAAGGCTTGTGATAGAGGATAATCCCAGGACCACAAATGCCAGGGCTGGGTGTGCACGATGTAAGGGTTAAAAATAGAATAGATTGTAACGGGGtt > 1:732643/1‑301 (MQ=255)
ccACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGTTAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGtt > 2:747409/1‑301 (MQ=255)
ccACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGtt > 2:321656/1‑301 (MQ=255)
cacaATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGttt > 2:974565/1‑301 (MQ=255)
cacaATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGttt > 2:831421/1‑301 (MQ=255)
accattttttCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTATAGCTTTATTGTTTCAATAAAATTAAAAATATTGGTGCTTGATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTACTTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAAGCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGct < 1:105713/291‑1 (MQ=255)
cccTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCCTTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGcttt > 2:60013/1‑301 (MQ=255)
tatatttatgttttaGTTTCCCATTTTTAATTCATTATCTTTTTATAAAAATATAAAATATATTGTCTAATTACTTTTAGATAGCTATGATTTTTAAGCATATGTTTTTCGCTATATCTTAATTGATTTCTATTGTTCTGGTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTg < 1:1177727/287‑1 (MQ=255)
atCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCttgg > 1:584464/1‑237 (MQ=255)
atCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCttgg < 2:584645/237‑1 (MQ=255)
ttATTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAATATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTg < 1:747186/300‑1 (MQ=255)
ttATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTTCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCAAGGCCCATGAATCCCCGGGCTTGGTTGGCCAGGTGTAATAGATAAAATTATGAACGTTGTGTACGGGCTTTATTAAGTTTTCTTTGATTTGATAAtt > 2:8518/1‑301 (MQ=255)
ttATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGTCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAATGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCAGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGTTAttt > 2:913896/1‑301 (MQ=255)
tataGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATCAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGTTTTCTAAAGCTTTCTTTGTGTTGTTAAttt > 2:1146874/1‑301 (MQ=255)
ttCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTg > 2:922095/1‑301 (MQ=255)
cccAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTTAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGTTGa > 1:980466/1‑300 (MQ=255)
ccAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGaa > 2:399763/1‑300 (MQ=255)
agtcttgtatctttCATAAAAATAAAAAAGTGCTTTGCTAACTCCTTTTAGATATTTATGCTTTTTAAGCATTTGTTTTGCGCGATATCTTAATTGATGGCTGTTGTACGGTTTCAGAAACGCCGTATTCGTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATCCAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTta < 2:677226/290‑1 (MQ=255)
cTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCttggtt > 2:1064804/1‑208 (MQ=255)
cTTTATCTTTTAAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCttggtt < 1:1064524/208‑1 (MQ=255)
tttATCTTTTTAAAAAAATAAAAAACATAATTGCTAAATACTTTTAGATATCTTTGTTTTTTAAGTAGTTTTTTTGCGCTATATATTAATTTATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTGTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTatat < 1:152848/300‑1 (MQ=255)
ttATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTCTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTTTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGACTTGGTTGGCCCGGTATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTAATTGGTTTATAAAGCTTTCTTTGATTTTGTAATTTAATTTGTATTGGGTTTTATAttt > 2:1088603/1‑301 (MQ=255)
tATCTTTTCAATAAAATAAAAAATTTAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGTTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATAttt < 1:172025/300‑1 (MQ=255)
tATCTTTTAAATAAAATAAAAAATATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATTTCTATGTTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATAttt < 1:921840/300‑1 (MQ=255)
tatttataataaataaaaAATATAGTTGCTAAATTCTTTTAGATATCTATGCGTTTTAAGCATATTTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCACGAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGTATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAGTAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAat < 1:616748/290‑1 (MQ=255)
cTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTGGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATTTTTAat > 2:790858/1‑300 (MQ=255)
cAATTAATTAAAAAAGATAGTTGTTAATACCGTTTGGATATCTATTCTTTTTAAGCATTTGTGTTGCATTATATCTTAATAGATTTCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAg < 1:60001/300‑1 (MQ=255)
cAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTg > 1:750620/1‑257 (MQ=255)
cAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTg < 2:750843/257‑1 (MQ=255)
aaaaaaGATAGTTTCTAAATCCTTTTAGATTTTTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTTCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAg < 1:161575/301‑1 (MQ=255)
aaaaaaGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTg < 2:346083/266‑1 (MQ=255)
aaaaaaGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTg > 1:345977/1‑266 (MQ=255)
aaaaaaATAATTTCTAAATCATTTTATATTTTTTTGCTTTTTAAGCATATGTTTTTCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTTTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGt < 1:974294/301‑1 (MQ=255)
aaaaGTTAGTTGCTATATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTTAGCATATTTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGtt < 2:980737/301‑1 (MQ=255)
cgttcttttttATATTTTTATGTTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTTATTGCTATTTTTCAGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCa < 1:1003369/293‑1 (MQ=255)
cTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGATTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCa > 2:1003644/1‑294 (MQ=255)
tttatattatttagCTTGTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATGGTTCGGTTTCAGAAACGCCGTATGCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTTATATAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCAAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACatat < 2:160681/285‑1 (MQ=255)
ttAGATATTTTTTCTTTTTAAATATATGTTTTGCTCTATATATTTTGTTATTGATATTTATCGGTTTCATCTACGGCGTATTCTTCCCTGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAATGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTa < 1:282073/300‑1 (MQ=255)
tAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATAAGCGAAAATAAGTTTATCCGGCAGCAACATTTTTaa > 1:1256944/1‑300 (MQ=255)
ccctacggtctaccgatctatgatttGTTTTTGGCTATATCTTAATGTATTTCTATTTTTCTGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGAGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAGGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGTATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAac < 1:681586/276‑1 (MQ=255)
tgATTTCTATGCTTTTTAAGCATTTTTTTTGCGCTATATCTTCATTGATTGCTATTGTTCGGTGTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGAGATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGAGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAac < 1:243872/299‑1 (MQ=255)
atgtattttttcTTTTTAAATATATTTTTTGCGCTATATCTTAATTGTTTGCTCTTGTTCGGTTTCAGCAACGACGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCAAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAac < 1:1113441/289‑1 (MQ=255)
aGATTTCTTTGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAac < 2:1257280/300‑1 (MQ=255)
aTGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTg > 2:493212/1‑300 (MQ=255)
tGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTa > 2:1119622/1‑289 (MQ=255)
cTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATc > 2:805451/1‑300 (MQ=255)
aGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCATCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTaaaagatagtacgagaatacgt > 2:681798/1‑281 (MQ=255)
gCATATATTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAAGCTTGTGATACAGGATAATCCCATGCCCAATAATGCCAGAGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATgtgt < 1:192253/301‑1 (MQ=255)
atatGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGttt > 1:387383/1‑300 (MQ=255)
gtgttttgcTATATATTAATTGATGTCTATTGTTCAGTTTAAGCAACGCCTGATTGTTACATGAGGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATAAAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGGCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTaaat < 2:1070374/293‑4 (MQ=255)
gTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAtttt > 2:523431/1‑301 (MQ=255)
ttgtgtaatttCTTAATTGTTTTCTTATTTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCAGGGCGAGGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAtttttt < 1:523274/290‑1 (MQ=255)
ggcgcTTTATGTTAATTGTGTGCTATTGATCGGTTTCAGCAACGCCTGATTCTTCCATGTCGGAGCATGTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGTCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTg < 1:805214/300‑1 (MQ=255)
atatCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCAAGCAACATAttt > 1:476756/1‑262 (MQ=255)
cTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATTTGTTATTTTTTTGTTTAtttttt > 1:1093713/1‑298 (MQ=255)
tAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCa > 2:388746/1‑271 (MQ=255)
gattgCATTTGTTATATTTCAGCATAGCCGTATTCTTCCATGTCGAAGCATTTTTTGTCCCCAAAAAGGCTTTGGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAt < 1:78097/300‑1 (MQ=255)
gCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTTATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCCGCAAAATATTTAACACATCATGATAAGGATGTGTTCTTTTTTTTTGTATTTCTTGCTATTTTAgt > 2:902913/1‑300 (MQ=255)
aTTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAttttttt > 2:144662/1‑276 (MQ=255)
tGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAAAATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTTATTATTTCTgctttttttatattttt > 1:787641/1‑285 (MQ=255)
gTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGc > 2:811683/1‑300 (MQ=255)
ggTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTAGCCGCCAGCAACATATTTAAAACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTTATTTTTTTTGGTTTATTATGCATTGCAAttt > 1:699645/1‑299 (MQ=255)
tttCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATcc > 1:1076644/1‑244 (MQ=255)
cAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTg > 2:476563/1‑290 (MQ=255)
gCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGAtg < 2:1187370/250‑1 (MQ=255)
gCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGAtg > 1:1187055/1‑250 (MQ=255)
gTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCTATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAat > 2:271820/1‑185 (MQ=255)
gTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCTATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAat < 1:271732/185‑1 (MQ=255)
cttcCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTGATCCGCCTGCAACATATTTAACAAATCATGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTAGTGCAGCAACctgct > 2:36801/1‑299 (MQ=255)
cttcCATGGCGAAGCATTTTTTGACTCCATAAAGGTTTGTGATTAAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGTGCTTTGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACctgct < 1:36792/299‑1 (MQ=255)
gggCGATGCATTTTTTGCGTCCATACAGGCTTGTGATACATGATAATCCCAGGCCCAATGATGCCATGGCTTGGTTGGCACGATAGAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAgccgcc < 1:879719/300‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTAtttttt > 2:506296/1‑241 (MQ=255)
ggCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGccc > 2:780744/1‑301 (MQ=255)
atcATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTGGTGATACAGGATAATCCCCGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTgg < 2:166633/299‑1 (MQ=255)
ttttttTCCTCCCTAAAGGGTTGTGTTACAGGATAATCCCAGGGCCAATAATGCCAGAGCTTGGTTGGCTCTATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCa < 1:913641/300‑1 (MQ=255)
ttttaGCCTACAGAAAGGCTTGGGAGACAGGTTAATCCCAGGCCAAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAAGTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAg < 2:732864/300‑1 (MQ=255)
ttgtGCCTCCAAAAAGGCTTGTGATAAAGGATAATCCCAGGTCCAATAATGCCAGGTCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGt < 2:195760/297‑1 (MQ=255)
cTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAAcaca > 1:1248490/1‑199 (MQ=255)
ccttAAAGGCTTGGGATACAGTAGAATACCATGCCCAATTATGCTAGGTCTTGTTTTGACCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTTGTTACTTGTTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTGTATAATTTAATCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATc < 1:902659/296‑1 (MQ=255)
ccATAAAGGCTTGTGATACAGGATTATCCCAGGCCTAAGAATGCCAGGGCTTGGTTTGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTTAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATc < 1:421299/299‑1 (MQ=255)
aaaGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAGGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCTTGATCAGGATGTGTTATTTTGTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTTGTTCAGAAACCTTCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTTTTATTCACTaa > 1:1169199/1‑300 (MQ=255)
aaGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGAAATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGATTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATGTAAGGTGAACTGGGTGTTATATTTACTATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGACCAGGATGTGTAATTTTTTTGATTATTTCCGGTTGATTTGGATTTGCAATAGTTCGTTCGGAAAATTGTTGAgactacctgtgaggcgttttaatggataat > 2:473895/1‑271 (MQ=255)
cTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGAGATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCGTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATCAGTTTATCAGACAGCAACATATTTAACACATACTGAACAGTATGTGTTATTTTTTAGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATATCGCGATCAGAAAACTTCTGAGCAGCCCATTGGGAAGTATTAATCAATAAAAAAc > 2:408497/1‑300 (MQ=255)
aGGATAATCCCAGGCCCAAAAATGGCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAg < 1:831184/301‑1 (MQ=255)
ggATAATCCCAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTTCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGt > 2:20620/1‑301 (MQ=255)
cAGGCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCAttt > 2:637479/1‑213 (MQ=255)
ggCCCAATAATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTTTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATAAATCAAAAAAAAAACGGAATTTAAGTAACATTTaaa > 1:502460/1‑298 (MQ=255)
|
AGCCGAAAATCCCAGGCTTTAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTGGCCCGATATAATGGATAAAAATAGTATCGTTGGTTACTGGGTTTATAAAGCTTTCTTTGAGTTGATAATTTAAGCTGAACTGGGTGTTATATTTAATATCAGCGAAAATAAGTTTATCCGCCAGCAACATATTTAACACATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGC > NC_000913/3801944‑3802527
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
