Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F92 I2 R1
|
14 |
170.8 |
3126081 |
90.1% |
2816598 |
287.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,183,621 |
G→C |
E793Q (GAA→CAA) |
rpoB → |
RNA polymerase, beta subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,183,621 | 0 | G | C | 97.9%
| 623.4
/ NA
| 190 | E793Q (GAA→CAA) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (97/89); minor base A (1/3); total (98/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.56e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGCGACATTCTGGTTGGTAAGGTAACGCCGAAAGGT > NC_000913/4183327‑4183917
|
gcTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGTCGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTgg > 1:1378267/1‑301 (MQ=255)
gATAATCCGCGGGGTGGTACTGGTATGGGACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGgcg < 1:453194/300‑1 (MQ=255)
aTAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGTTCCGTCAACCGACCTCGGTCAACTGgcgcc > 2:840715/1‑300 (MQ=255)
aGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGACGTGTGTGTCTCTTGGTGATCCTGTTGATAGTGGCGACGAGCGGTCAAGCGGGCCGTCCACCGACCTCCGTACACTGCCGTTTgg > 1:1270983/1‑301 (MQ=255)
ccGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCCACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGGGACAAGGTTGCAAGTGGCGAAGTGCTGGCAGACGGTACGACCACCGCCATCGATCAACTGGCGCTggggg > 2:186997/1‑299 (MQ=255)
tggtACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGGGCTGGAAGCGGGTCGGTCCACCGACCCCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACagg > 2:655847/1‑299 (MQ=255)
gtACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGAACCCGTGTGAGTCTCTGTGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTACCGGCCGACGGTCCCTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCCGAACATggg > 2:1119697/1‑299 (MQ=255)
aCTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGcgcg > 1:501055/1‑301 (MQ=255)
aCTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGcgcg > 1:1537245/1‑301 (MQ=255)
cTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACAAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTTTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGTCGACGTGCTGGCAGACGGTGCTTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCCCGTGGTCAGACCATGcgcgg > 2:718929/1‑300 (MQ=255)
ggTATGGAACGGTCTTTTGCCGTTAACACCGGTGTTACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGGCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCGGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGt < 2:1377900/299‑1 (MQ=255)
gTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGc < 1:1137639/301‑1 (MQ=255)
aTGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTGGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATTCGCGTAGGGt > 1:1425758/1‑301 (MQ=255)
ccGTGCGGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGGCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATg < 2:271638/300‑1 (MQ=255)
tGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTTCTGGCAGCCGGTCCGTCCACCCACCCCGGTCAACTGGACCTTGGTCAGAACAGgcg > 2:1512273/1‑282 (MQ=255)
tGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgcg < 1:1512678/282‑1 (MQ=255)
tGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTgg > 1:1119281/1‑301 (MQ=255)
gACTCCGGTGTACCTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACa < 1:130263/301‑1 (MQ=255)
tgtccggttgaactgtttttgttAAAGGTGTAGGTGTCGTCCCGTATGTGGATGATTCCCGTAACGGTAGCAAAGTTAACGAAGGCGAAATGTATCCGGGTGGAGCAGGTCTCGACATCTACAACCTGTCCAAATGCCCCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGGGTGTGTCTCTGGGTTAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGACCACCGACCTCGGTCAACTGGTGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACa < 2:226994/278‑1 (MQ=255)
aCTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGCCCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTACGAACCTGCGCGTAGCGTTGATGGCGTGGAAGGGtgcca > 2:388921/1‑296 (MQ=255)
cTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCCCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGGAGCGGTCATGCCGGGGAATGGTTACCAc > 2:62237/1‑301 (MQ=255)
ggTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTGATCAAAGTTAACGAAGACGAGGTGTATCCGGGTGATGCAGGTATCGACATCTACAACTTGACCAAGTACACCCGTTCTAAACAGAACACCTGTATAAACCAGATGCCGTGTAGGTCTATGGTTGAACCGGTTGAATGCGGCGACGTGCTGGCAGACGGGACGTCTACCGACCACGGTCAAATGGCGGTTGGTCAGAACTTGAGCGTAGCGTTCATGCGGCGGAATTGTGACaaaatt > 1:956648/1‑296 (MQ=255)
gCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGGAGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc < 1:141030/299‑1 (MQ=255)
gCGGTAGCTAAACGTGGTGGGGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATGTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc < 1:607332/299‑1 (MQ=255)
gtgtCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTc > 1:54298/1‑228 (MQ=255)
aaacgtcgtcccttccgatctccGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACAACTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGCTGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTgttgtt < 1:326962/280‑1 (MQ=255)
cGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGTACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACACCTTCGAAGCCTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAgcc > 1:1099100/1‑299 (MQ=255)
gTGGATGCTTCCCGTATCGTAATCAAAGTTAACGAAGCCGAGATGTACCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGAACAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGAc < 2:1012488/300‑1 (MQ=255)
ttCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAAGGGTTACAACTTCGGAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcacc > 1:658753/1‑301 (MQ=255)
tccctgaacGTTATCAAAGTTAACGTAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATTCACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcacc < 1:1556114/292‑1 (MQ=255)
tCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATAGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcac < 1:598390/299‑1 (MQ=255)
gTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCTGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATTCCGTGGAATGGTTCCCACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCAt > 2:845167/1‑301 (MQ=255)
cGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCca > 1:977599/1‑300 (MQ=255)
gTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTGCAACTTCGAAGACTCCATCCTCCTATCCGAGAGTGTTTTTCAGGAAGACCGTTTCACCCCCATcaccc > 2:847372/1‑297 (MQ=255)
tATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCCCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACCACTTCGAAGACCCCATCCCCGTACACGCCCGTGTTGTTCAGGCAGACCGTTTCACCCCCATCCCCAtt > 2:431737/1‑301 (MQ=255)
gttCAAAGTTAACGAAGACGAAGTGTATCCGGGTGAAGCAGGGATCGACATCTACAACCTGACCCAATACACCCGTTCTAACCCGAACACCTGTATCAACCCGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACAt < 2:1098801/298‑1 (MQ=255)
ccaaGTTAGCGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCCACCACCTTACCAAATACACCCGTTCTACCCAGAACACCTGTATCCACCAGATGCCGGGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAg < 2:666623/299‑1 (MQ=255)
cAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGCGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGCCGCTTGGTCAGCACATGCGCGTACCAGTCATGCCGTGGAATGGTTCCCAATACGAAGACTCCATCCTCTTATCCGAGCGTGTTGTTGAGGAAGACCGGTTCACCTCCATCCCCTTTc > 2:517297/1‑299 (MQ=255)
aagaGTTAACGAAGACGAGATGTAACCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAg < 1:458115/298‑1 (MQ=255)
aaaGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCCGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGCATGGTTCCAACTTCGCAGACTCCCTCCCCGTATCcgcgcg > 1:1347120/1‑260 (MQ=255)
aaaGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTAGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAgg > 1:30046/1‑301 (MQ=255)
taacagaggcGAGATGTCTCCGGGTGAACCAAGGAACGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGGTATAACCAGAACACCTGTATCAACACGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACt < 2:1466907/291‑1 (MQ=255)
agaCGAAGACGAGATGTATCCGGGTGTAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATGCACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAAACAGAGGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTg < 2:500924/299‑1 (MQ=255)
cccctacacaacgcccttccgatctaGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCTAATACCCCCGTTCTAACCAGACCACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGc < 2:1150684/276‑1 (MQ=255)
cccaaaggaggaatcacccGGGTGAAGAAGGTCACGACATCTCCAACCGGCCCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTTTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGGCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGc < 2:640802/284‑1 (MQ=255)
agaTGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTTTGTGTc > 1:644517/1‑301 (MQ=255)
tGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACAGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCAGCCTCGTATCCGCGCGTGTTGTTCAGGCAGACGGTTCCACCACCATCCACATTCAGGCAATGGCAGGTGTGTCCCg > 2:951231/1‑301 (MQ=255)
gTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCACCTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCCAAGCCTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACCTTAAGGAATTGGCGTGGGTTTccagg > 2:1471315/1‑298 (MQ=255)
gTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCg < 1:847604/300‑1 (MQ=255)
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ggTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGTCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTACCGTGACACCAAGCTGGGTc > 1:486102/1‑301 (MQ=255)
ggTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGt < 1:780201/243‑1 (MQ=255)
aTCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGtgtt < 2:1550079/225‑1 (MQ=255)
aTCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGtgtt > 1:1550495/1‑225 (MQ=255)
aTCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCg < 1:201985/300‑1 (MQ=255)
tCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAAATGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTAACCGAGCGTGTTGTTCCGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACCATCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGTAACCATGCTCGGTCCggg > 1:177211/1‑300 (MQ=255)
cGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGCATGGTTCCAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTGGGTCAGGACGACCGTTTCACCACCCTACACCTGCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCATGACACCAAGCTGGGTCCggc > 2:876350/1‑299 (MQ=255)
aCATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGACCTGGCGTGAGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGacg > 1:1319827/1‑298 (MQ=255)
aCATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAATCTGGGTcctagacc > 2:602338/1‑295 (MQ=255)
caccTACCACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAagag < 1:1323180/298‑1 (MQ=255)
tCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTAGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACCTTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCCAGCTGGGTCCGGAcgag > 1:743100/1‑299 (MQ=255)
cAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGGGGCATGGTTACAACTTCGAAGAATCCATACGCGTATCCGATCGTGTTGTTCCGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACCTTCAGGAACTGGCGTGTGGGTCCCGTTACACCAAGCCGGGCACGCAAGAGATCAcc > 1:79639/1‑301 (MQ=255)
cctccgcacccacCCATTCTAACCGGAACACCTGGAGTAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCGGTGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTTGAATGGTTACAACTTCGAATACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTg < 2:485483/290‑1 (MQ=255)
aaTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGGGTGTCTCTGGGTGGACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCa < 1:881229/267‑1 (MQ=255)
aTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCg < 1:62251/301‑1 (MQ=255)
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tgtggCTATGGGTAAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACGACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTc < 2:1324918/191‑1 (MQ=255)
ccccctccgacctttGAACGGGGCGACGGCCTGGCAAACGGTCCGGCCCCCGACCTCGGTCAACCGGCGCTTGGTCAAAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACa < 1:939723/288‑1 (MQ=255)
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aCCGACCTCGGTCAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGCGACATTCTGGTTGGTAAGGTAACGc > 1:1368416/1‑301 (MQ=255)
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GCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTGGGTGAAGCTGCGCTCTCCAAACTGGATGAATCCGGTATCGTTTACATTGGTGCGGAAGTGACCGGTGGCGACATTCTGGTTGGTAAGGTAACGCCGAAAGGT > NC_000913/4183327‑4183917
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
