Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F17 I0 R1
|
155 |
84.1 |
1797446 |
90.9% |
1633878 |
230.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,838,905 |
C→G |
10.9% |
A220G (GCG→GGG) |
yicL → |
EamA family inner membrane putative transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,838,905 | 0 | C | G | 10.9%
| 264.8
/ 2.4
| 103 | A220G (GCG→GGG) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/52); new base G (11/2); total (49/54) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.76e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTCGCCGCGCCA > NC_000913/3838678‑3839138
|
gACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTTTGTTTGCTTTTTATGCCAGAACAGGACAAAAATTTTTGGTTTACGGGC‑GTTTTTTTCTTGGGGttttttttt > 1:710795/1‑237 (MQ=255)
ccGGTAATCCCGCTTCATTTTCGCTCTCGCTTGCCGCGTTGTTCGGGGGCCTTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTTTACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTtggtg < 1:629068/238‑1 (MQ=255)
acGGTAATCCGAACTCCTTACCGTCCTCCCCTGCCGCGCTTTTCTTGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTTCATTCTATACCCCCTTGCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGGATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAATCTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTtggtg < 2:696932/239‑1 (MQ=255)
gTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAACCAAGGAACACACTTTGCCGTTAACGGGC‑GTTTGATTT‑TGGCGCTTTTTTTTTtgacgttc > 2:9597/1‑233 (MQ=255)
ctccttcttttctgctctttcCTTCCGGTTTTTTCTGGGGCATTGCCCTGGCATTTGCTGCTGCATTCTATCCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGt < 1:395465/224‑1 (MQ=255)
cgccgtttgtttgcaTCTTTCCTGCCGCGTTGTCTTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCCCCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGt < 1:423921/225‑1 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTTTGTTGCCTTTTTTTGCCAGACAAGGAAAAAACTTTGTCGTTAACGGCG‑GTTTTTTTC‑TGGGGTTTTTTTTTTTTGGGGGGATTgggaag > 1:363138/1‑235 (MQ=255)
cGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGGTTTATTTT‑TGGGTTTTTTTTTTTTGGTGGT‑AATGGTAc > 1:199220/1‑238 (MQ=255)
tCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCC‑GTTTGATTT‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTTGTACGt > 2:601300/1‑238 (MQ=255)
ttATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCCGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCt < 2:673212/239‑1 (MQ=255)
ttATCGATCCCTCCTGCCGGGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCt < 2:268225/239‑1 (MQ=255)
ctccttcCTTCCGCGTTTTTTTGGGGCATTGCCTCGGCTTTTGCTGCTGCATTCTAACCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACAtt < 1:273161/234‑1 (MQ=255)
ctctcCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTTTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTTGCGTTAACGGCC‑GTTTTTTTT‑TGGCGTTTTTTTTTTTTTTGGTCAATTGTAAGCCCCAGAAATTTa > 1:134772/1‑239 (MQ=255)
ctctcCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GATTGGTTC‑TGGCGGTTTTTTATTTGGTGGTCATTTGTACGTCCCTGCCActtg > 2:50226/1‑238 (MQ=255)
ttcctgcgcgtgtgttCTGGGGAATTGCCCCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCGATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGt < 1:274397/227‑1 (MQ=255)
ccccttccgtttttttCTGGGGCCTTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCCCATACCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGt < 1:522194/225‑1 (MQ=255)
tcCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGTTTT‑TGGGGTTTTTTTTTTTTGTGGTCCTTGGTACGTCCCTGCAAttttg > 2:627721/1‑235 (MQ=255)
tcCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCCATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTc < 2:399504/239‑1 (MQ=255)
cTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTTACGTTAACGGCA‑GGTTGGTTC‑TGGGGGTTTTTTTTTTGGTGGTCATTGGTACGTTCCTGCACTTTAGTCTg > 2:205745/1‑239 (MQ=255)
ttgttCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGAA‑GTTTTATTT‑TTGCGTTTTTTTTTTTGGGGGGCATTTGTACGTCCCTGCCACTTTTTCTGTACCTTa‑a > 2:872958/1‑239 (MQ=255)
tttcctgggCCTTGCCTCGGCATTTGCTGCTTCATTCCTTACCCCCTATCCCTCAACGGTTAGTGCCCGCTATGGCCCGGTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAg < 1:553734/233‑1 (MQ=255)
gttCTTGGGCTTTGCCCCGGCATTTGCTGGCTCATTCTATTCCACCTATCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAg < 1:616576/239‑1 (MQ=255)
gggCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTTTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGACAAACTTTGTCGTTAACGGCC‑GTTTGGTTT‑TTGGGTTTTTTTATTTGTGGGGCTTTTGTACGTCCCTTGCATTTTTGCTGTACCTTa‑aaaagagga > 1:246059/1‑232 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGCTTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGGGGTCATTGGTACGTCCCTGCCATTTAGCCTGTACCTGT‑AAGGAGC‑AAa‑atta > 2:646404/1‑239 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTTTTTCCTTTTTTTGCCCGAAAAGGAAAAAACTTTTTCGTTAACGGAC‑GTTTTGTTT‑TTGCGTTTTTTTTTTTTGTTGTTCTTTTGACGTCCCTGTCCTTTTATCTGTTCCTTA‑AAagagaaaaaata > 1:875879/1‑231 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGACAAACTTTGTCGTTAACGGCC‑GTTTTTTTT‑TGGGGGTTTTTTTTTTTGTGGGCATTGTGTCGTCCCCGACATTTTGTTTTTACCTGa‑aggagggaaaatta > 1:672376/1‑226 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTT‑TGGCGTTTTTTTATTTGGGGGGTCTTGGTCAGTCCCTGGCATTTTTGCTGTACCTGA‑AAGGAGA‑GCa‑atta > 2:791203/1‑239 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTTGTGGGCCTTGGTACGTCCCTGCACTTTTGTCTGGTCACGA‑AAGGAGG‑AAa‑atta > 2:347475/1‑239 (MQ=255)
ttGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTG‑CCGCTATGGCACGTTACCATTCGTCGTCTGGGGGATGCTGATTGGCGGCAGGATTCTGTTGCCTGTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTTTCGGTAACGGCA‑CATTGATTC‑TGGGGTTTTTTTATTTTGGGGTTATTGGTACGGTCCTTACAATTATGCTTTACCTTA‑aagaagtcaacaaaa > 1:43439/1‑230 (MQ=255)
ccTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATTCCAGACAAGGCACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGGTTC‑TTGCGGTTTTTTTTTTGGTGGTCATTGGTACGTGCCCGACTTTTATTCTGTACCTGT‑AAGGAGCAACa‑ataaat > 1:702761/1‑239 (MQ=255)
ggCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTTTTTGGTGGTAATTGGAAGGCCCCTGACATTTATGTTGTACCTGA‑AAGGAGC‑AAA‑ATTAATTGGCg > 2:459546/1‑239 (MQ=255)
ttcATTTTATACCCCCTTTCCCTCAACGCTAATTGCCCTCTATGGCACGTTTCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCa < 1:9627/237‑1 (MQ=255)
ttcATTCTATCCCCCCTAGCCCTCAACGCTAATTGCCCGATATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATTCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCa < 2:439472/237‑1 (MQ=255)
gcATTCTAATCCACCTATCCCTCAACGGTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCa < 2:827027/238‑1 (MQ=255)
tCTATTCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTCCCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGGGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑Att < 2:602102/239‑1 (MQ=255)
tataCCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTGTTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTAAGTCCCTGACATTTTGTCTGTACCTTA‑AAGAGGC‑AAA‑AATAATAGGCGGTCCAAAAACCAAC‑Atttt > 1:374080/1‑239 (MQ=255)
tccccctttcccgccacctttaTTGCCCGGTTTGGCTCGTTACCATTTGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 1:187002/218‑1 (MQ=255)
tccccccacccccCAACGGTAATTGCCCGGTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGATGGGGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 1:601300/230‑1 (MQ=255)
ccccccTATCCCCCAATGTTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTTGAATATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAAAAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTTTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTTGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 1:202348/235‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 2:243694/239‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 2:672376/239‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 2:134772/239‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 2:257846/239‑1 (MQ=255)
accaccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAg < 2:840007/239‑1 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGt > 2:335605/1‑182 (MQ=255)
ccTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGt < 1:335605/182‑1 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGCTTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGTTTT‑TGGGGGTTTTTTTTTTGGGGGTCATTGGTACGTACCCGCACTTTTGTTTTTACCTGATAAGGGAC‑AAC‑TTTAATTTG‑GGTCCAAAAACCACCAATTTTGA‑CTGTGcg > 1:840007/1‑238 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTTCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTC‑TGGGGGTTTTTTTTTTGTGTGTGTCTTGTACGTCCCTGGCATTTTGTCTGTAACTGT‑AAAGGGC‑ACACATTAA‑TGGCGGTGTaaaaaacacaaattttggagtggca > 1:188321/1‑218 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTC‑TGGCGTTTTTTTTTTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAAATGGCGGTCCAAAAGCCACC‑ACTTTGTGCCGTGCa > 2:787716/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGTTTC‑TTGGGTTTTTTTATTTGGGGGGCAATTGTAAGGCCCTGACAATTATACTGTACCTTG‑AAGAGGA‑AAC‑AATAATTGTCGGGCCaaaaacacgacattttagctttgaa > 1:544961/1‑218 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTTGTGGTCATTGGTACGGCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGA‑CCA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTTAGCTGTGcc > 2:87123/1‑238 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGGGGTCATTGGTACGGTCCTGTCATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCAGC‑ATTTTTAGCTGTGCa > 2:387777/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGGTTTTTTTTTTTGTGGTCATTGGTACGTTCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTTAGCTGTGCa > 2:753691/1‑239 (MQ=255)
aTCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGGTTTTTTTATTGGTGGTCATTTGTACGTTCCTTACATTTTGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTTGCGGTCCCAAAACCAGC‑ATTTTTAGCTGTGCa > 2:435358/1‑239 (MQ=255)
tCCCTTAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAg < 2:710795/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGCTAATTGGCCGCTATGGCACGTTACTAGTTGCCGGCTGGATAATGCTGATTGGCGGTCTGATCATGTTGCCTTTTTATGCCAGACAATGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGTTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAg < 2:860181/239‑1 (MQ=255)
tCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAg < 2:374080/239‑1 (MQ=255)
tCCCGCAACGCTAATTGCCCTCTATGGCACGTTACCATTCGTGGGCTGGAGTATGGTGATTGGCTGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGTCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAg < 1:606809/239‑1 (MQ=255)
ctcccgaaCGCTAATTGCCCGCTATGGCCCGTTACCGGTCGTCGGCTGGAGTATTCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAg < 1:387777/233‑1 (MQ=255)
cccTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTT‑TGGCGGTTTTTTATTTTGTGGTCATTGGTACGTCCCTTGCATTTAATCTGTACCCTA‑AAAGGGG‑ACA‑ATTAATTTGCGGACCAAAAAACAAC‑ATTTTGAGcgtttgaga > 1:43945/1‑231 (MQ=255)
ccTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTTCCAGGCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGa‑a < 2:503687/239‑1 (MQ=255)
tCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCCGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTTTTTGGTGGGCATTGGTACGTCCCTGACATTTTGTCTGTACCTGT‑AATGAGC‑ACA‑ATTAATTTGCGGTCCAAAAGCACGC‑ATTTTTAGCTGGGGAGa‑aaa > 1:687497/1‑237 (MQ=255)
aaCGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGGCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑CCA‑CTTAATTGGCGGTGCACAAGCCAGC‑ATTTTGGGACGGTCAGA‑ACCAt > 2:692854/1‑239 (MQ=255)
aaCGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTATTTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGGACAAACTTTGTCGTTAACGGCC‑GGTTGCTTC‑TGGCCGGTTTTTATTTTGTTGGCATTGGTACTTCCCTGACATTTTGTCTGTACCTTA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCCGGCCAAAAGTCACC‑ATTTTTGTCTGTGCCGA‑ACCAt > 2:86314/1‑239 (MQ=255)
gCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGc‑ac < 2:575769/188‑1 (MQ=255)
tttttcccGTTTTGGCTCGTTTCCAGGCGTTGGCTGGAGTTTGCTGGTTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTa < 1:134613/234‑1 (MQ=255)
agtgggctggtgtggcgagttcgcAGTCGTCGGCTGGAGGATGCTGATTGGCGGTCTGATGCTGTGGCCGTTGTATTCCAGACAAGGAACAAACTTTGGCGTTAACGGCA‑GTTTGATGC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTa < 2:867364/216‑1 (MQ=255)
tagggCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑Att < 2:510306/201‑1 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTTGTGGTCCTTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACC‑ATTAATTGGCGGGCCCCACACCAAC‑ATTTTTAGCTTTGCGGC‑ACCATTAAGTAACCCGCTACCTCCTttgcct > 2:143825/1‑237 (MQ=255)
tACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTTTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCAGC‑AATTTTAGCTTTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGGGCTACTCTCttt > 2:91591/1‑235 (MQ=255)
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ttggtGATTGGCGGTCTGAATCTGGTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAGCGTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTca < 2:140940/234‑1 (MQ=255)
ttGCTTATTGGCCGTCTGATTCTGGTGGCTTTTTATGCCAGAACAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGGCTTTTTGTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTTGGGATCACGTTca < 1:186160/237‑1 (MQ=255)
aTGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTca < 2:199220/238‑1 (MQ=255)
tGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTTGTGGTCATTTGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTTGCGGTCCCAAAGCCAGA‑ATTTTTGGATGTGCAGA‑ACCATTAAATAGCGCGCTACTCCCTTTTGTGTTTCTgggggcaccgttca > 2:129436/1‑227 (MQ=255)
cTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACAtt < 2:363138/239‑1 (MQ=255)
aTTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAATCTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCt < 2:833012/110‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTC‑TGGCGGTTTTTTATTTTGTGGTCCTTGGTa > 1:206120/1‑102 (MQ=255)
ggggttttttttCTGGTGCCTTTTTAGTCCGGGCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGa < 1:63366/229‑1 (MQ=255)
ggCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGa < 2:875879/239‑1 (MQ=255)
gctgTCTTATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTGATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑c < 1:520675/236‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGTTTCTGTTTCCTTTTTTTGCCAAAAAGGGAAAAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑c < 1:347475/239‑1 (MQ=255)
cGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTTAGCTGTGCAGa‑a > 2:126048/1‑178 (MQ=255)
cGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGa‑a < 1:126048/178‑1 (MQ=255)
tCTGATTCTGTTGCCTTTTTATTCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTTATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTTGTCTGTACCTTA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTTGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTCTTGGGGGTCACGTTCACATTACCGGA‑ctggg > 2:63366/1‑238 (MQ=255)
tGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTca < 2:793220/216‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCCAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACAATTAAGTAGCGCGCTCCTCTCTTTGCTGTTTCTGTGGATACCGTTCACATTACCGCA‑CCAGCTggggaa > 1:395412/1‑233 (MQ=255)
ttGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGGGGGCATTGGGACCTCCCTGACATTTAGTCTGTATCTGG‑AAGGAGC‑CCA‑CTTAATTGGACGTCCCAAAGACAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGACACCATT‑AGTGGTCCGCTCACCTCTTTTCTCTTGCTTGGGGTCCCGTTCACATTACCCGA‑CCTGCTGGGGACgcc > 1:827234/1‑238 (MQ=255)
ttATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGGGCAGA‑ACCATTCAGTAACCCGCTACTCTCTTTTCCGTTGCTGGGGATCACCTTCACATTACCggccctggctcttaaaaaaaactgc > 1:793220/1‑215 (MQ=255)
gCCAAAAAAGGAAAAAACTTTGGCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTc < 2:246059/239‑1 (MQ=255)
gACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGTGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGAAACGCGCTAATCTCTTTGCTGTTCCTGGGGAACACGGTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGGAACGCTGCTGGTTCTGTCTTCg > 2:173783/1‑239 (MQ=255)
aCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTTGTGGGCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTTTACCTTA‑AAGGAGC‑CCA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAAT‑ATTTTTGACTGGTCAAA‑ACATTTAATTACTCCGCCAATACCTTTGCTGTTGCCGGGGATCACGTTTCCATTACCGGACCTGCCTGGGaagcctcgctgtttggtccttg > 1:249280/1‑219 (MQ=255)
cAAACTTTTGCGTTAACGGCA‑TTTTGATTT‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTTCCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGtgatttt < 1:617221/238‑1 (MQ=255)
tGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGATGTGCAGA‑ACAATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTTCTGGTGATCACGTTCACATTAACGGG‑CTGGCTGGGGAAACGCGTGGTTCTTTCCTCGGGGATTTTTATTTTaa > 1:581387/1‑239 (MQ=255)
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tC‑TGGGTTTTTTTTTTTTGGGTGTCATTGGTTCGTCCCTGACATTTAGTCTTTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTCGCCGCGCCa < 1:91591/239‑1 (MQ=255)
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tC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGGGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTTGCGGTCCCAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGTAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTCGCCGCGCCa < 2:350740/239‑1 (MQ=255)
|
GACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCA‑GTTTGATTC‑TGGCGTTTTTTTATTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTCTGTACCTGA‑AAGGAGC‑ACA‑ATTAATTGGCGGTCCAAAAGCCAGC‑ATTTTGAGCTGTGCAGA‑ACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGATCACGTTCACATTACCGGA‑CTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGATTCCCGTCGCCGCGCCA > NC_000913/3838678‑3839138
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
