Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A21 F20 I0 R1
|
109 |
83.9 |
1834642 |
93.1% |
1708051 |
141.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP000730 |
1,002,200 |
T→G |
100% |
M173R (ATG→AGG) |
mecA2 → |
competence negative regulator MecA |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP000730 | 1,002,200 | 0 | T | G | 100.0%
| 221.5
/ NA
| 64 | M173R (ATG→AGG) | mecA2 | competence negative regulator MecA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (37/27); total (37/27) |
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
AGGTTCTAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATATGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATGCTA > CP000730/1002063‑1002337
|
aGGTTCTAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGt < 2:542957/141‑1 (MQ=255)
ggTTCTAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGtt < 2:424877/141‑1 (MQ=255)
ggTTCTAAACGTCAAAAGACTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGtt < 1:883723/141‑1 (MQ=255)
gTTCTAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATCGCAACCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTg < 1:480541/141‑1 (MQ=255)
gTTCTAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTg < 2:164194/141‑1 (MQ=255)
ttCGAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGa < 2:914495/141‑1 (MQ=255)
aaaCGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGt > 2:666690/1‑141 (MQ=255)
aaaCGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGt > 2:119416/1‑141 (MQ=255)
cGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACt > 2:139436/1‑141 (MQ=255)
cGTCAAAAGTCTTCAGAACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACt > 1:465786/1‑141 (MQ=255)
aaaaGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGTTACttatt > 1:415353/1‑141 (MQ=255)
aaaaGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACttatt < 2:266084/141‑1 (MQ=255)
aaaaGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACttatt < 2:148396/141‑1 (MQ=255)
aaaaGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACttatt > 1:820215/1‑141 (MQ=255)
aaaGTCTTCAGCACGTAAAAATCCAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACttatta < 1:549034/141‑1 (MQ=255)
aaGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTGCttattat > 2:231361/1‑141 (MQ=255)
cAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGCTATATAGGGTTGATGGTAGTTATTATTATGCTg > 2:712064/1‑141 (MQ=255)
aaTACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGAt < 1:565874/141‑1 (MQ=255)
gAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATg > 2:70185/1‑141 (MQ=255)
aaCATTCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCAGAGCAATCCAATAACTTCAGCGTTTCAAGATTTGTTATATTGGGATGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGt > 2:885202/1‑141 (MQ=255)
aaCAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTAATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGt > 1:563225/1‑141 (MQ=255)
aaCAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAAATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATACTTTATATTTTGATAGTCAttt > 2:300562/1‑139 (MQ=255)
aataatTGTGAAATGTAACGCTTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATAATAGCAATCCCATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGCAGTGCTGGTACAGATTATTATGCTGTATATTTTTATAGTCGTGTTGa > 2:412896/1‑141 (MQ=255)
aTCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGAt > 2:75230/1‑141 (MQ=255)
tCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATc < 2:455926/141‑1 (MQ=255)
cATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCa > 1:729516/1‑141 (MQ=255)
cATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCa > 2:743369/1‑141 (MQ=255)
cATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCa > 1:464292/1‑141 (MQ=255)
ttGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCaag < 2:885154/141‑1 (MQ=255)
gtgAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCaagaa < 1:481631/141‑1 (MQ=255)
taaaTTTAATGATTTTGAAGAGGTGATTAATTATGCATATGCTATGAGTCAGATAACTCCATAGTTTGTAGATTTTTTATATAGGGTTGAGGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTCGTTAGTCATGTTGATCAAGAGGt < 2:249221/140‑1 (MQ=255)
gAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGt < 2:627125/141‑1 (MQ=255)
aaTTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCa > 2:703654/1‑141 (MQ=255)
aaTTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCa > 2:277027/1‑141 (MQ=255)
aTTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGGTAGTCATGTTGTTCAAGAAGTCAt > 1:528017/1‑141 (MQ=255)
ttAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTa < 1:139436/141‑1 (MQ=255)
tAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTaa < 1:723390/141‑1 (MQ=255)
aCGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTTATAGTCATGTTGATCAAGAAATCAtgcatg > 1:704408/1‑136 (MQ=255)
gaagaTGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTAc > 2:914069/1‑141 (MQ=255)
ttattaATTATGCATATCATAGCAGTCCAACAACTACCGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGGATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAAt < 1:148052/141‑1 (MQ=255)
ttaTGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTAAAGTCAATTGCTTGa > 2:181176/1‑141 (MQ=255)
cATATCATAGCAATCCAATAACTACAGATTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTg < 2:624519/141‑1 (MQ=255)
cATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTCTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTg < 2:462251/141‑1 (MQ=255)
tCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCttt > 1:577206/1‑140 (MQ=255)
tCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTa > 1:473339/1‑141 (MQ=255)
aTAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATc > 2:264670/1‑141 (MQ=255)
aTAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATc > 2:456077/1‑141 (MQ=255)
gCAACCCCATTACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATATTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCaa < 1:195189/141‑1 (MQ=255)
cAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAac < 1:70185/141‑1 (MQ=255)
tCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCACGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAacaga > 2:498112/1‑141 (MQ=255)
aaTAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATAAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTAGCAAacacacag > 2:23282/1‑141 (MQ=255)
aTAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTAATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAAcagacaga > 1:455976/1‑141 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa > 1:84858/1‑141 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa < 1:75230/141‑1 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa > 2:83696/1‑141 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa > 1:363952/1‑141 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa > 1:622915/1‑141 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa > 1:648560/1‑141 (MQ=255)
tAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGacagaa > 1:634929/1‑141 (MQ=255)
agagTTTGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTAGGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGt < 1:168317/141‑1 (MQ=255)
tGAAGATTTGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGtttattt < 1:743369/141‑1 (MQ=255)
tGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACt < 1:277027/141‑1 (MQ=255)
tGTTATATAGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACt < 1:703654/141‑1 (MQ=255)
tatataGGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATg > 1:52137/1‑141 (MQ=255)
atatagGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCGATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATGc < 1:119416/141‑1 (MQ=255)
atatagGGTTGATGGTACTTATTATTAAGCTGTATACATAGAACCACATGTTGAGCAAGAAGTC‑TTTAGGATGTGAGACAGTCCCTTATTTAATTGTTCTTTTCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATGc < 1:666690/141‑1 (MQ=255)
atagGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATGCTa > 1:223875/1‑141 (MQ=255)
atagGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATGCTa < 1:555956/141‑1 (MQ=255)
|
AGGTTCTAAACGTCAAAAGTCTTCAGCACGTAAAAATACAAGAACAATCATTGTGAAATTTAACGATTTAGAAGATGTTATTAATTATGCATATCATAGCAATCCAATAACTACAGAGTTTGAAGATTTGTTATATATGGTTGATGGTACTTATTATTATGCTGTATATTTTGATAGTCATGTTGATCAAGAAGTCATTAATGAT‑AGTTACAGTCAATTGCTTGAATTTGCTTATCCAACAGACAGAACAGAAGTTTATTTAAATGACTATGCTA > CP000730/1002063‑1002337
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A