Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A27 F34 I0 R2
|
578 |
165.1 |
5883352 |
98.2% |
5777451 |
141.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,952,587 |
T→A |
5.8% |
W108R (TGG→AGG) |
yecN → |
MAPEG family inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,952,587 | 0 | T | A | 5.8%
| 538.6
/ 14.3
| 152 | W108R (TGG→AGG) | yecN | MAPEG family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (67/76); new base A (4/5); total (71/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTA > NC_000913/1952441‑1952735
|
tgCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTgg < 1:601928/149‑1 (MQ=255)
cTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGgtg > 3:114503/1‑149 (MQ=255)
tGATGCTGATTATGGAAATGAATGATGTAGAAGCGTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTAACTGGTTGACTGATGCATTATTCCGGTTTGCCTCACCGTCTGTTCCGCTTGCGGCGTTACGGCAGGAGCGC‑CTGCTGgtgt < 4:1382593/149‑1 (MQ=255)
gATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGtgtg > 1:118029/1‑149 (MQ=255)
aTGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTgc < 1:1437680/149‑1 (MQ=255)
gCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc < 4:1226513/149‑5 (MQ=255)
cTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCt > 4:506800/1‑149 (MQ=255)
tttATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGtt < 1:885540/149‑1 (MQ=255)
tATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGGTG‑GCGCtcatgc < 4:120805/149‑6 (MQ=255)
tATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGGTG‑GCGCtcatgc < 4:233678/149‑6 (MQ=255)
gAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc < 3:1443175/139‑5 (MQ=255)
gAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc > 4:1443175/1‑135 (MQ=255)
aaaTGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATg < 2:213514/149‑1 (MQ=255)
aaaTGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTGTTGCTTGCTGGTCGTCTGAGGCATTATTACGGTTTTGATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGGTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGCGTGCGCTGTTGCTGATg > 4:473026/1‑149 (MQ=255)
aatgaatgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATgg < 2:887829/149‑1 (MQ=255)
agaatgGCGCAGAAACCCGGATGGTACATATTGGCGGCATCGTGTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTg > 4:32755/2‑149 (MQ=255)
ggCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGc < 1:342647/149‑1 (MQ=255)
gcAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGaa > 4:479099/1‑149 (MQ=255)
cAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAAt < 2:304019/149‑1 (MQ=255)
aGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATc > 2:239264/1‑149 (MQ=255)
gAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCt > 3:496971/1‑149 (MQ=255)
aaaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCtt < 1:66753/149‑1 (MQ=255)
aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 1:5902/149‑1 (MQ=255)
aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 2:1296146/149‑1 (MQ=255)
aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 3:25195/149‑1 (MQ=255)
aCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg > 3:1055447/1‑149 (MQ=255)
aCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg < 1:990165/149‑1 (MQ=255)
ccTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg < 3:1152921/149‑1 (MQ=255)
ggTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGc < 1:770895/149‑1 (MQ=255)
tGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGccc < 4:1205590/149‑1 (MQ=255)
gCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGa > 2:1415408/1‑119 (MQ=255)
gCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCt > 3:1084142/1‑149 (MQ=255)
cATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTg < 3:180819/149‑1 (MQ=255)
atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTgg < 4:68257/149‑1 (MQ=255)
atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTgg > 1:279183/1‑149 (MQ=255)
tatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTggg > 2:1014971/1‑149 (MQ=255)
atTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGa < 1:974722/149‑1 (MQ=255)
atTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGa < 1:231440/149‑1 (MQ=255)
tttGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAg > 1:895194/1‑149 (MQ=255)
tttGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAg > 4:53608/1‑149 (MQ=255)
tGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGtt > 2:124127/1‑149 (MQ=255)
gCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTg < 1:1014971/149‑1 (MQ=255)
gCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTCCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTg < 2:619559/149‑1 (MQ=255)
ggCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc > 2:531125/1‑96 (MQ=255)
ggCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt < 1:10324/149‑1 (MQ=255)
gCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGtt < 1:1444747/149‑1 (MQ=255)
gCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGtt > 1:374992/1‑149 (MQ=255)
tCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTgc > 2:614935/1‑94 (MQ=255)
cGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtct < 3:32755/149‑1 (MQ=255)
gTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtctc > 4:616641/1‑149 (MQ=255)
ttttGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTcc < 3:224184/149‑1 (MQ=255)
gcttgctGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGc < 3:566795/149‑1 (MQ=255)
ttgctGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGt > 2:406727/1‑149 (MQ=255)
tGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgc > 1:1258094/1‑149 (MQ=255)
tGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgc > 1:334325/1‑149 (MQ=255)
gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt < 2:468352/130‑1 (MQ=255)
gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt > 1:468352/1‑130 (MQ=255)
gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgcgc > 1:395756/1‑149 (MQ=255)
tcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGca < 2:334325/149‑1 (MQ=255)
tGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCTTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGc < 3:66526/149‑1 (MQ=255)
tGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCAGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGGCCTGGGAGCTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGc > 4:1191181/1‑149 (MQ=255)
cATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCa < 1:29337/149‑1 (MQ=255)
attattACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg < 3:337115/97‑1 (MQ=255)
ttattaCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAct > 1:1372842/1‑149 (MQ=255)
taCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttct > 3:125781/1‑149 (MQ=255)
taCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttct > 4:377089/1‑149 (MQ=255)
cGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttcttt < 1:1062043/149‑1 (MQ=255)
ggTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt > 2:494911/1‑110 (MQ=255)
ggTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt < 1:494911/110‑1 (MQ=255)
ggTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCtttt < 3:1263452/149‑1 (MQ=255)
gTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCttttt < 4:835751/149‑1 (MQ=255)
ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc > 3:475868/1‑149 (MQ=255)
ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc > 3:1385066/1‑149 (MQ=255)
ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc > 2:336511/1‑149 (MQ=255)
atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa < 2:395756/149‑1 (MQ=255)
atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa < 2:485185/149‑1 (MQ=255)
tcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGAt > 4:1338250/1‑149 (MQ=255)
caCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGAGGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGAtt > 4:1127728/1‑149 (MQ=255)
tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc < 1:239264/149‑1 (MQ=255)
tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc > 3:576979/1‑149 (MQ=255)
gTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGtt < 3:1338250/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTGTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGACTTTTACGTTa > 3:576621/1‑149 (MQ=255)
ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTa < 1:435889/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTa > 4:459823/1‑149 (MQ=255)
tCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTAt < 4:1084142/149‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg < 4:571916/149‑1 (MQ=255)
gACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGGGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg < 2:813979/141‑1 (MQ=255)
gTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGa < 2:279183/149‑1 (MQ=255)
ttCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGac > 1:65091/1‑149 (MQ=255)
ccGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGATTCTTTGGTATATTCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGTACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGacac > 4:1069364/1‑149 (MQ=255)
ggCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGc > 2:365662/1‑149 (MQ=255)
gCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCACTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTTTGTCTCACCGCGACACGCt > 2:1127546/1‑149 (MQ=255)
tGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTAtt > 4:1028214/1‑149 (MQ=255)
cagcgcacACCAGGTG‑GCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGTCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTAttt > 3:777538/8‑149 (MQ=255)
cgc‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCt < 2:271019/149‑1 (MQ=255)
c‑cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGc > 3:945018/1‑149 (MQ=255)
c‑cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGc > 1:768771/1‑149 (MQ=255)
cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGcc < 4:907166/149‑1 (MQ=255)
cTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc > 2:760024/1‑113 (MQ=255)
tGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTa > 4:1107632/1‑149 (MQ=255)
|
TGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTA > NC_000913/1952441‑1952735
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
