Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F195 I1 R1
|
10 |
105.5 |
2244450 |
87.3% |
1959404 |
258.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
1,293,032 |
IS1 (–) +9 bp |
intergenic (‑110/‑487) |
hns ← / → tdk |
global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
1293032 = | 0 (0.000) | 114 (1.070) |
78/514 |
0.1 |
100% |
intergenic (‑110/‑495) |
hns/tdk |
global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 |
= 1979270 |
NA (NA) | noncoding (1/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 1293040 | 0 (0.000) | 83 (0.780) |
51/514 |
0.8 |
100% |
intergenic (‑118/‑487) |
hns/tdk |
global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 |
1978503 = |
NA (NA) | noncoding (768/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CCTCTGTTGACCTCCAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293302‑1293032
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTGGATGCCGGGCAACAGCCCGCATTAT < NC_000913/1979270‑1978998
ccccgtTTGACCTCCAGGATATATGGCAATACTAATTCCATGCTCTTATTTCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTG < 3:564721/269‑1
TCTGTTGACCTCCAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT > 1:404175/1‑272
TGTTGACCTCCAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGC > 1:190042/1‑275
ACCTCCAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCA > 3:291151/1‑275
tccagggctTAGTGTAATACTACGTCCATGGTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACT < 4:335412/266‑1
CAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTA < 3:60515/275‑1
atatgcaAATACTAATTCCATGCGCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGGCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 3:284989/268‑1
AGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:160819/275‑1
AGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:2393/1‑275
AGTACAATACTAAGACCATGCTCTAATTGTGACGGTTCTACGTTTCATCATTCGCGTAATAGGGAATTCTCGAAAAAACAACTAGTACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCGCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 4:359250/275‑1
TGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAACAGATATTTTTTGGCGGCACAAGGTTATGCTGCCCACTTTCTGATTTAGT > 1:600779/1‑275
ATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 3:237914/1‑275
TACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATCCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAAGTCGACAGCCTACGATAACCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGCATTAACCTCACGTGCTGCGAACTCATCGGTGTACATAGGGCTATATGCCGAGTCTTTTCTGTCTAATTTTGTGAAAAGATATTTATTGGCGGCAGAAGGTAATGATCCATACTTATCGATTTAGTGTATa > 4:406656/1‑274
AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAGGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 3:599643/1‑264
AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACT > 3:553960/1‑257
CATGCTCTTATTGCGACTTTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:553960/257‑1
CATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAGGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:599643/264‑1
ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCAAACTTACTGATTTAGTTTATGATGGTGTTTT > 2:474358/1‑275
TGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTG < 1:62073/235‑1
GCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGCTGGTGTTTTT > 3:540515/1‑274
TCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AG < 3:420210/275‑1
CTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATCGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCACCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAATAGCTATTTATTGGCGGCACCAGGTGCTGCTTCTAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑CGG > 2:230087/1‑275
CTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGTTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGTTTTATG‑AGG > 4:417829/1‑275
TATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:298856/1‑268
GCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AG < 4:298856/268‑1
ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGCAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGT > 1:408309/1‑275
ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAACTCATCGGTGTCAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGTAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTCCTGATTCAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑CGGTGCTactgt > 2:205209/1‑270
ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGT > 2:73627/1‑275
ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCACCGGTGTAAATAGGGCTATATGCTGCGTTTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACGTACTGATTTATTGTATGATGGAGTTTTTG‑AGGTGCTCTAGT > 2:452942/1‑275
TCTACCTTTCATCATATGCTTAATAGGGAAATCTCGTAAACACAACTAATACAGATGACTGAAATGTCGTCAGCATACCATAAACTCCCCAAAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTT < 4:303040/275‑1
CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGGGGCTTCTGTTTC > 1:471184/1‑273
TTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCGCCCCATAAAATGTTACATGAATCAGGAAGTTTTAACCGCACGTGCTGCGAAAGCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTTGCTAAGTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 3:144392/275‑1
tcaTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTGAAACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACAATAATCTCACCATAAAATGTGACATGAATCAAGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAAATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGTCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGT < 1:549421/272‑1
GCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAAAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGT < 2:492469/275‑1
ATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTC < 3:2393/275‑1
GGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGT < 3:69156/275‑1
tAATTCTCCTAAACACAGCTCATACGGAATGCTGAAAGGTTTGCCGCATACGATCATCTCCCCATTAAATGTAACATGAATCAGGAAGTTTTAACCCACCGTGCTTCGAAATCATCGGTGTAAGTCGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAATGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTT < 4:452942/274‑1
GAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTT < 1:291151/275‑1
GAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTT > 1:478446/1‑275
GAATTCTCGGAAACAAAACTAATACAGAAGGCTGAAAGGTCGTGAGCCTACGATAATCTCCCCCTAAAAGGTGACATGAATCAGGAAGTTTGAACCGCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTGCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTT < 3:275732/275‑1
aTCTCGTAAACACAACTAAGACATAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGCTAAGCTCCCCAGAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTCATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTG‑AGTTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAG < 2:277708/274‑1
TCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑CGGTGCTCCAGTGTCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGC > 2:159420/1‑275
ACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG < 3:70758/273‑1
aAACGAATACAGAAGCATGAAATGTAGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGGTATATGCCGCGTCTTTTCTGTCTAATTGTATGAAACGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑GGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 4:219388/274‑1
AACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTATTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGTCGGGGT > 1:349007/1‑275
AACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTACCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTTATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGTGGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCATC‑TGTCCATCATTTTCAGCTACTGAGGGGGc > 3:43870/1‑274
CTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGATATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGTACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTGG‑AGGTGCTCCAGTGGCTGCTGTTTCTATCTGC‑TGTCCCTCCGGTTACGCTCCTGAAGGCGTGG > 4:320283/1‑275
CTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTACTTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTAACTGATTTAGTGCATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGT‑TGTCCCTCCTGTTCTGCTACTGCCGGGGTGG > 2:112003/1‑275
CTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCTGCACAAGGTAATGCTGCTAACTTACTGATTTATTGTACGATGG‑GTGTGTGTAGGTGCTCCAATGTCTTCTGTTTCTATAAGT‑TGTCCCTCCTGTTAATCTACTGACGGGGTGG > 3:443135/1‑275
CAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT < 3:78913/274‑1
GAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGTCTATAGGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAACGATCTTTATTGTCGGCACCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGGTTGATGGTGTTTTTG‑AGGTGTTCCAGTGGCTTCTGTTCTTCACAGC‑TGTCCCTGCTTTTCAGCTGCTGACGAGGTGGTGCGTtt > 4:156289/1‑272
GAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCCGC‑TGTACCTACTGTTCATCTACTGCCGGGGTGGTGCGTAg > 4:465798/1‑273
TGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAA > 1:523377/1‑275
GGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGACGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAATGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTTTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACTGCAAAACCA > 2:454628/1‑274
CGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGCCATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTGATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTG‑AGGTGGTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCTTGTTCAGCCACTGACGGGGTGGTTCGAAAGGGCAAAAGCACCcc > 3:41987/1‑273
GTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGACGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTCTGCAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTAATGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑CGGTTCGCCAGTGGCTTCTGTTTCTCT‑AGCATGTCCCTCCTGTTGCCTTATGGCAGGGGTTGTGCGTAAGGGCAgacacaccccc > 4:392337/1‑264
CCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACA < 1:64442/275‑1
CTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 1:237914/275‑1
TACCATAATCTCCCCATAAAATGTGAAATGAATCAGAAAGTTTTAACCGCCCGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTATATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 3:469576/275‑1
TAATCGCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG < 1:315895/274‑1
TCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGGGATGCGGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGT‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGATGGGTTGGTGCGTAACGGCACAACCACTGCCGGACCTCAGCGATA > 1:133005/1‑274
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ATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCT > 3:556189/1‑275
TGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCAAACATCAGCGCTATCTCTGCCCTCCCTcc > 3:157294/1‑273
GACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCATCCTGTTCAGCTACTGCCGGGGTGGTGCGTAAGGGCAAAGGCACCGCCGGACATCAGCGCGAGCCCTGCCCTCACCGCC > 4:58269/1‑275
GAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGC < 3:523377/275‑1
TTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTTTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCCCTGCTCTCACTGCCGTCAAACATGGCAAC > 2:309368/1‑274
AACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 3:478446/275‑1
AACCACACGTGCTGCGAAATCATCGTTGTAAATAAGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAACGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTTCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTCTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 3:404175/275‑1
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ACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACT > 1:384422/1‑275
tggaatacagtGGTGTAAATAGGGGTATATGCCGCGTCTTTTCTGGGTAATTTTATGAAAAGTTATTTATTGGCGCAACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACGCCG < 3:133005/264‑1
GCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCG < 1:487739/275‑1
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CGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG‑AGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC‑TGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACC < 3:190042/275‑1
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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A