Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A22 F44 I0 R1
|
387 |
90.4 |
3244086 |
98.5% |
3195424 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,168,420 |
A→T |
6.9% |
intergenic (‑114/‑292) |
yegR ← / → yegS |
uncharacterized protein/phosphatidylglycerol kinase, metal‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,168,420 | 0 | A | T | 6.9%
| 299.3
/ 11.5
| 87 | intergenic (‑114/‑292) | yegR/yegS | uncharacterized protein/phosphatidylglycerol kinase, metal‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/44); new base T (3/3); total (40/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.16e-01 |
ATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTC > NC_000913/2168278‑2168567
|
attaatGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTa < 3:184368/149‑1 (MQ=255)
attaatGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTa < 3:201288/149‑1 (MQ=255)
ttaatGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAg < 2:630481/149‑1 (MQ=255)
atGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGaa < 1:758768/149‑1 (MQ=255)
tGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAt < 2:435181/149‑1 (MQ=255)
gATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACTTATGTAGGaaat < 1:109633/149‑3 (MQ=255)
atatAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACTTATGTAGGaaatg < 2:272920/149‑4 (MQ=255)
tataGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTAc < 4:484495/149‑1 (MQ=255)
agcagcTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGa < 4:47197/149‑1 (MQ=255)
agcTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACAt > 3:568648/1‑149 (MQ=255)
agcTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAAGAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACag < 2:690502/149‑2 (MQ=255)
tATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAg < 3:476869/133‑1 (MQ=255)
tATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAg > 4:476869/1‑133 (MQ=255)
ttttCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGaa > 3:5951/1‑131 (MQ=255)
ttttCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGaa < 4:5951/131‑1 (MQ=255)
tctcACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAgg > 3:763745/1‑149 (MQ=255)
ctcACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTAAGGACATTGAGGCCCTTCAggg > 2:652038/1‑149 (MQ=255)
cACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGACATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATATATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTa < 4:763745/149‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGa > 3:97479/1‑128 (MQ=255)
aCCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGa < 4:97479/128‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTaa > 4:202322/1‑149 (MQ=255)
cccATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTaa > 4:420717/1‑142 (MQ=255)
cccATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTaa < 3:420717/142‑1 (MQ=255)
cccATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATg > 2:498351/1‑149 (MQ=255)
ccATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATgg > 1:442075/1‑149 (MQ=255)
aTTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATgggg > 2:81353/1‑149 (MQ=255)
ttAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCAttgtgg > 3:767174/1‑144 (MQ=255)
tAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGc < 2:224560/149‑1 (MQ=255)
aCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACTTATGTAGGaa < 4:663429/104‑1 (MQ=255)
aCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACTTATGTAGGaa > 3:663429/1‑104 (MQ=255)
aCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTaa < 1:652038/149‑1 (MQ=255)
cGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAatatat < 1:600566/149‑1 (MQ=255)
tctctAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATatattatatt < 3:202322/149‑1 (MQ=255)
tAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTAc < 4:277826/93‑1 (MQ=255)
tAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTAc > 3:277826/1‑93 (MQ=255)
gtTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGc < 1:498351/149‑1 (MQ=255)
tttAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAAGAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATg > 4:653573/1‑119 (MQ=255)
cttAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATg < 3:653573/118‑1 (MQ=255)
ttAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCa > 4:80037/1‑149 (MQ=255)
aaaTATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACt < 4:217272/149‑1 (MQ=255)
tataATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGtt < 4:568648/149‑1 (MQ=255)
taataaTGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAgg < 3:306962/100‑1 (MQ=255)
taataaTGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAgg > 4:306962/1‑100 (MQ=255)
ataatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTAGGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGt > 3:543609/1‑149 (MQ=255)
taatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt < 1:403899/149‑1 (MQ=255)
taatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt < 1:81353/149‑1 (MQ=255)
aatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTg > 1:293481/1‑149 (MQ=255)
atGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGAGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGa < 3:380003/149‑1 (MQ=255)
tGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTa < 2:442075/149‑1 (MQ=255)
gATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAggg < 3:757821/89‑1 (MQ=255)
gATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAggg > 4:757821/1‑89 (MQ=255)
tattatAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGta < 4:543609/149‑1 (MQ=255)
attatAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATg < 4:57619/95‑1 (MQ=255)
attatAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATg > 3:57619/1‑95 (MQ=255)
tataATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTatat > 2:631825/1‑149 (MQ=255)
ttGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAatatat < 3:17440/103‑1 (MQ=255)
ttGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAatatat > 4:17440/1‑103 (MQ=255)
aTAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt > 2:82573/1‑125 (MQ=255)
aTAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt < 1:82573/125‑1 (MQ=255)
tAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCGATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCtttttt < 4:767174/149‑1 (MQ=255)
aGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTg < 1:631825/149‑1 (MQ=255)
gATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAgg > 4:9512/1‑69 (MQ=255)
gATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAgg < 3:9512/69‑1 (MQ=255)
taataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGaaa < 4:407822/145‑1 (MQ=255)
taataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGaaa > 3:407822/1‑145 (MQ=255)
aataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTa > 1:561040/1‑123 (MQ=255)
aataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTa < 2:561040/123‑1 (MQ=255)
aataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTAt > 4:90029/1‑149 (MQ=255)
ataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATc > 2:222747/1‑149 (MQ=255)
aaTGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAAt > 1:22382/1‑141 (MQ=255)
aaTGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAAt < 2:22382/141‑1 (MQ=255)
ttCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCa < 3:90029/149‑1 (MQ=255)
tACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGt > 1:141251/1‑149 (MQ=255)
caacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGtata > 2:371426/1‑114 (MQ=255)
caacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGtata < 1:371426/114‑1 (MQ=255)
aacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGc > 2:713175/1‑87 (MQ=255)
aacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGc < 1:713175/87‑1 (MQ=255)
gtaattCCTACTTATGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGt > 2:589170/5‑149 (MQ=255)
attCCTACTTATGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTAtt > 4:629570/2‑149 (MQ=255)
cTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAat > 3:305876/1‑95 (MQ=255)
cTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAat < 4:305876/95‑1 (MQ=255)
cTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGACTATTAg > 3:525493/1‑100 (MQ=255)
cTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAg < 4:525493/100‑1 (MQ=255)
cTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCt > 3:768478/1‑149 (MQ=255)
aCATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCt > 3:135499/1‑147 (MQ=255)
aCATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCt < 4:135499/147‑1 (MQ=255)
cATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTc > 2:11007/1‑149 (MQ=255)
aTAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGaaa > 3:140913/1‑116 (MQ=255)
aTAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGaaa < 4:140913/116‑1 (MQ=255)
|
ATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTC > NC_000913/2168278‑2168567
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
