Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A35 F9 I0 R1
|
1164 |
192.0 |
7567036 |
97.0% |
7340024 |
130.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,285,190 |
T→A |
5.8% |
L18I (TTA→ATA) |
narJ → |
molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,285,190 | 0 | T | A | 5.8%
| 364.5
/ 10.9
| 103 | L18I (TTA→ATA) | narJ | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/50); new base A (3/3); total (50/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.23e-01 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TTGGTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCG > NC_000913/1285042‑1285337
|
ttGGTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCt < 4:1538566/149‑1 (MQ=255)
tGGTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCtt < 3:6053/149‑1 (MQ=255)
ggTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTa < 2:346075/149‑1 (MQ=255)
gTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt > 1:13858/1‑149 (MQ=255)
tGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATg < 1:574082/149‑1 (MQ=255)
tGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATg < 2:382296/149‑1 (MQ=255)
tGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgca < 1:169375/149‑1 (MQ=255)
tGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATgg < 2:1823634/143‑1 (MQ=255)
tGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATgg > 1:1823634/1‑143 (MQ=255)
gCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATc < 4:1595212/149‑1 (MQ=255)
cACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaa < 3:963006/149‑1 (MQ=255)
gTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAag > 2:714236/1‑149 (MQ=255)
ttCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga < 2:982689/149‑1 (MQ=255)
ttCAGATACCAAATTCAATCTCTTCAACAGCCGTCATATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATAAACAaga > 2:1110478/1‑149 (MQ=255)
aGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGAt < 3:1763237/149‑1 (MQ=255)
aaTCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATgg > 2:1008441/1‑119 (MQ=255)
aaTCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATgg < 1:1008441/119‑1 (MQ=255)
aTCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaacaa > 4:1577266/1‑130 (MQ=255)
aTCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaacaa < 3:1577266/130‑1 (MQ=255)
tCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGc > 3:1357041/1‑149 (MQ=255)
tCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGc > 1:1045554/1‑149 (MQ=255)
tCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGc > 1:1388911/1‑149 (MQ=255)
cTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGa < 2:696943/144‑1 (MQ=255)
gTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCAt < 3:1329133/120‑1 (MQ=255)
tCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt > 3:502487/1‑110 (MQ=255)
tCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt < 4:502487/110‑1 (MQ=255)
cAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTc < 1:714236/149‑1 (MQ=255)
aaCAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCg > 4:711900/1‑149 (MQ=255)
gtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGc < 2:1388911/149‑1 (MQ=255)
gATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCaaaa > 4:1172746/1‑149 (MQ=255)
gCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAagag < 1:1110478/149‑1 (MQ=255)
cATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGa < 3:711900/149‑1 (MQ=255)
aTCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGAt > 2:162381/1‑149 (MQ=255)
aTCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATATGCCAAAAGAGGAt > 2:42999/1‑149 (MQ=255)
aCCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATgcg > 3:534446/1‑149 (MQ=255)
cAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga < 3:1475290/92‑1 (MQ=255)
cAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga > 4:1475290/1‑92 (MQ=255)
cAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCt > 4:1701439/1‑149 (MQ=255)
aGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTg < 4:534446/149‑1 (MQ=255)
gCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATATGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg < 1:42999/149‑1 (MQ=255)
aaaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGt < 2:559329/111‑1 (MQ=255)
aaaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGt > 1:559329/1‑111 (MQ=255)
aaaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGc < 2:13858/149‑1 (MQ=255)
aaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAaga > 3:128722/1‑129 (MQ=255)
aaaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAaga < 4:128722/129‑1 (MQ=255)
gAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTc > 3:700057/1‑149 (MQ=255)
gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCt < 4:700057/149‑1 (MQ=255)
ccGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaacaa > 1:981263/1‑77 (MQ=255)
ccGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaacaa < 2:981263/77‑1 (MQ=255)
ccGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTcc < 4:880092/147‑1 (MQ=255)
ccGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTcc > 3:880092/1‑147 (MQ=255)
aTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGc > 3:1484234/1‑106 (MQ=255)
aTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGc < 4:1484234/106‑1 (MQ=255)
aTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGcc > 4:1248940/1‑120 (MQ=255)
aTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGcc < 3:1248940/120‑1 (MQ=255)
aTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGAttt > 3:123616/1‑149 (MQ=255)
tGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAaga > 1:113992/1‑112 (MQ=255)
tGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAaga < 2:113992/112‑1 (MQ=255)
tCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAacg > 2:483115/1‑149 (MQ=255)
cGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAacga < 1:162381/149‑1 (MQ=255)
gAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTAGGCATTTTCCTGCGCGATTTAacgac > 3:1869517/1‑149 (MQ=255)
aaCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAacgacg > 3:1029087/1‑149 (MQ=255)
aaCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAacgacg > 1:964164/1‑149 (MQ=255)
cGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATgg < 2:964164/149‑1 (MQ=255)
gTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGa < 3:1172746/149‑1 (MQ=255)
gTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGa > 3:846483/1‑149 (MQ=255)
tGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGAt < 3:1701439/149‑1 (MQ=255)
gATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATc < 4:846483/149‑1 (MQ=255)
tGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGGTGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGc < 4:123616/149‑1 (MQ=255)
tATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTc < 4:1029087/149‑1 (MQ=255)
tctcCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGccc < 1:483115/149‑1 (MQ=255)
tcCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAg > 4:639498/1‑149 (MQ=255)
ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGc < 1:1473172/135‑1 (MQ=255)
ttGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGc > 2:1473172/1‑135 (MQ=255)
tatCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa < 4:544470/115‑1 (MQ=255)
tatCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa > 3:544470/1‑115 (MQ=255)
atCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg > 3:1334223/1‑93 (MQ=255)
atCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg < 4:1334223/93‑1 (MQ=255)
tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACa < 2:1045554/149‑1 (MQ=255)
tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACa < 4:1357041/149‑1 (MQ=255)
cGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg > 2:656976/1‑90 (MQ=255)
cGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg < 1:656976/90‑1 (MQ=255)
ggATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCg > 1:526321/1‑149 (MQ=255)
aTGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGaa < 2:526321/149‑1 (MQ=255)
tgctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAAc < 3:639498/149‑1 (MQ=255)
tgctgcCATAATGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTc > 4:171522/1‑94 (MQ=255)
tgctgcCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGaa > 4:981591/1‑148 (MQ=255)
tgctgcCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGaa < 3:981591/148‑1 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg < 4:1688897/83‑1 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTgg > 3:1688897/1‑83 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa < 1:484980/104‑1 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa > 2:484980/1‑104 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAAcgacga > 4:258359/1‑110 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAAcgacga < 3:258359/110‑1 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGAt > 3:996697/1‑115 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGt > 1:171406/1‑149 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGt > 2:947383/1‑149 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGt > 1:1371676/1‑149 (MQ=255)
tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGt > 2:801759/1‑149 (MQ=255)
cTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCg > 1:1581482/1‑149 (MQ=255)
|
TTGGTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGCTGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCG > NC_000913/1285042‑1285337
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
