Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A18 F70 I0 R1
|
504 |
105.3 |
3845710 |
98.0% |
3768795 |
140.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,335,684 |
G→A |
5.3% |
intergenic (+226/‑147) |
yciX → / → acnA |
uncharacterized protein/aconitate hydratase 1; aconitase A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,335,684 | 0 | G | A | 5.3%
| 433.8
/ 9.9
| 131 | intergenic (+226/‑147) | yciX/acnA | uncharacterized protein/aconitate hydratase 1; aconitase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (57/67); new base A (3/4); total (60/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-02 |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CAACACAAAATAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAG > NC_000913/1335538‑1335828
|
cAACACAAAATAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTgcgg > 1:451925/1‑148 (MQ=255)
cAACACAAAATAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTgcgg > 2:927143/1‑148 (MQ=255)
cacaAAATAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGGCGGACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGcggcgg < 2:360068/148‑1 (MQ=255)
acaAAATAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCgggg > 3:315534/1‑149 (MQ=255)
aaaaTAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGt < 2:650085/148‑1 (MQ=255)
aaaTAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGtt < 1:294586/148‑1 (MQ=255)
aataatAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGTCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaa < 3:670926/149‑4 (MQ=255)
aataatAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaa < 4:436900/149‑4 (MQ=255)
aataatAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaa < 3:789469/149‑4 (MQ=255)
taataaCCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCa < 3:570463/149‑1 (MQ=255)
ataaCCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtt > 4:859558/1‑149 (MQ=255)
taaCCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtt > 1:886552/1‑148 (MQ=255)
aCCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttg > 2:470331/1‑148 (MQ=255)
ccGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgc < 2:948741/148‑1 (MQ=255)
ttAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgcttt > 1:667922/1‑148 (MQ=255)
aaGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGcc < 4:317363/149‑1 (MQ=255)
gtgtAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCcaca < 1:900801/148‑1 (MQ=255)
tAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAgg < 1:807792/148‑1 (MQ=255)
cTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTtc > 2:963621/1‑148 (MQ=255)
gATCAACACAAATATGAATTATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGGCGATGCTCTTCTGGGCCTAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcct > 2:450043/1‑148 (MQ=255)
aTCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcctc < 2:886552/148‑1 (MQ=255)
aTCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcctc < 1:967924/148‑1 (MQ=255)
tCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCctct > 1:193014/1‑148 (MQ=255)
tCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCtt < 3:811114/149‑1 (MQ=255)
acacAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCtttt > 2:515334/1‑148 (MQ=255)
acacAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCtttt < 2:364147/148‑1 (MQ=255)
acacAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCtttt > 1:383368/1‑148 (MQ=255)
acacAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTa > 4:242609/1‑149 (MQ=255)
cacaAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTa > 2:483460/1‑148 (MQ=255)
acaAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTAt < 2:712961/148‑1 (MQ=255)
caAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATc > 2:369971/1‑148 (MQ=255)
atGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAAttt < 2:415768/148‑1 (MQ=255)
tGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTg < 2:678418/148‑1 (MQ=255)
gAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTgg > 1:598332/1‑148 (MQ=255)
aaaTATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTggg < 1:935279/148‑1 (MQ=255)
aaTATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGgt > 1:496759/1‑148 (MQ=255)
atatTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGgttg > 3:546101/1‑149 (MQ=255)
ttGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTa > 3:198920/1‑149 (MQ=255)
tGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTAt < 3:700699/149‑1 (MQ=255)
ccTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCaa < 2:266347/148‑1 (MQ=255)
cTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTa > 3:919719/1‑143 (MQ=255)
tGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAAt < 2:180770/148‑1 (MQ=255)
tGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATc < 4:488650/149‑1 (MQ=255)
gcgcGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTAcgc < 4:844407/149‑1 (MQ=255)
gcgcGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTAcg < 2:721474/148‑1 (MQ=255)
cgTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGa < 2:383368/148‑1 (MQ=255)
ctctGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTtg > 1:197997/1‑148 (MQ=255)
tGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGtt > 4:854291/1‑149 (MQ=255)
tCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTa < 1:927143/148‑1 (MQ=255)
gATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCt > 3:51383/1‑149 (MQ=255)
aTGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGttt < 1:922662/91‑1 (MQ=255)
ctctTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTa < 1:468040/148‑1 (MQ=255)
tcttctGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGAt < 4:293148/131‑1 (MQ=255)
tcttctGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGAt > 3:293148/1‑131 (MQ=255)
ttctGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCAGTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTCTCTTTAatat > 4:817675/1‑149 (MQ=255)
tctGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAatat > 1:321793/1‑148 (MQ=255)
gggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCa < 2:386625/148‑1 (MQ=255)
gggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCa < 2:540308/148‑1 (MQ=255)
gggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCAc < 4:912212/149‑1 (MQ=255)
ggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGGTGAGGTGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCAcc < 3:194214/149‑1 (MQ=255)
ggCCGAACTCCGCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCAc > 2:411081/1‑148 (MQ=255)
aaCTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGaa < 4:58967/149‑1 (MQ=255)
aaCTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGa < 1:301968/148‑1 (MQ=255)
ctcctcTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAag < 1:864566/148‑1 (MQ=255)
cctcTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAagag > 2:789499/1‑148 (MQ=255)
tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGtt < 4:213847/122‑1 (MQ=255)
tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGtt > 3:213847/1‑122 (MQ=255)
tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGGAt > 3:932711/1‑149 (MQ=255)
tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAAt > 3:429214/1‑149 (MQ=255)
tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAAt > 4:380232/1‑149 (MQ=255)
tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAAt > 4:233625/1‑149 (MQ=255)
ggATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCa > 4:35138/1‑148 (MQ=255)
ggATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCa < 3:35138/148‑1 (MQ=255)
ggATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCa < 1:498091/148‑1 (MQ=255)
ggATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCa < 2:72969/148‑1 (MQ=255)
gATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAg < 1:515334/148‑1 (MQ=255)
ttACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTc > 4:336954/1‑149 (MQ=255)
ttACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTc < 3:859558/149‑1 (MQ=255)
tACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGTGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTTTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTc > 2:261293/1‑148 (MQ=255)
cACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCaa > 2:635219/1‑148 (MQ=255)
cTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTAt > 2:542839/1‑81 (MQ=255)
cTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTAt < 1:542839/81‑1 (MQ=255)
tCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGt > 2:300560/1‑148 (MQ=255)
atgacaaCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGt > 1:121282/7‑148 (MQ=255)
cTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCa < 2:204840/148‑1 (MQ=255)
gACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTa < 1:411081/148‑1 (MQ=255)
aCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTaa > 2:912907/1‑148 (MQ=255)
aCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAag > 4:856801/1‑149 (MQ=255)
cccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAagga < 3:186565/149‑1 (MQ=255)
cccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAagga < 4:546101/149‑1 (MQ=255)
cccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAagga > 3:858935/1‑149 (MQ=255)
cccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAagg < 1:963621/148‑1 (MQ=255)
ccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAAcc < 3:152071/135‑1 (MQ=255)
ccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 4:53167/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 3:421419/1‑149 (MQ=255)
cGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggag > 1:447383/1‑148 (MQ=255)
gCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAaggagg > 1:571444/1‑148 (MQ=255)
gCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAggagga < 4:488268/149‑1 (MQ=255)
gCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAggagga < 3:854291/149‑1 (MQ=255)
tGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGgaggag < 1:483460/148‑1 (MQ=255)
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CAACACAAAATAATAACCGTTAAGGGTGTAGCCTATGATCAACACAAATATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATTCACCCTGAAGAGAATCAGGGCTTCGCAACCCTGTCATTAAGGAGGAG > NC_000913/1335538‑1335828
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
