Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A30 F33 I0 R2
|
539 |
121.1 |
4372944 |
98.1% |
4289858 |
141.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,039,479 |
G→A |
5.2% |
V62I (GTC→ATC) ‡ |
cbdB → |
cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,039,479 | 0 | G | A | 5.2%
| 386.3
/ 7.5
| 116 | V62I (GTC→ATC) ‡ | cbdB | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/57); new base A (3/3); total (56/60) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGAAAAATCGC > NC_000913/1039334‑1039627
|
gctgATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCt < 1:891904/149‑1 (MQ=255)
gATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGt > 2:250012/1‑149 (MQ=255)
gATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGt < 2:342503/149‑1 (MQ=255)
gATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGt < 2:960333/149‑1 (MQ=255)
tGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGa < 1:465809/149‑1 (MQ=255)
ggCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGACCTGGTTgcc < 3:830328/149‑3 (MQ=255)
tCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCt > 4:850261/1‑149 (MQ=255)
tCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGACCTGGTTgcctt < 1:998470/144‑5 (MQ=255)
tCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGACCTGGTTgcctt > 2:998470/1‑140 (MQ=255)
ccTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCtg < 4:137241/149‑1 (MQ=255)
ccTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCtg > 1:7858/1‑149 (MQ=255)
cgggtggtATTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGAGTAATGATGATGAACGACGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGAGACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCtgg < 2:698123/147‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCtgg > 1:352529/1‑149 (MQ=255)
tggtCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTggg < 3:342390/149‑1 (MQ=255)
ggtCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTgggg < 4:843772/149‑1 (MQ=255)
gtCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGc > 1:1050353/1‑149 (MQ=255)
tttATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCatt > 4:596368/1‑149 (MQ=255)
tGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTAttt < 3:596368/149‑1 (MQ=255)
tGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTAttt < 1:519145/149‑1 (MQ=255)
gATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTAttt < 1:643537/148‑1 (MQ=255)
aTCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgc > 4:738603/1‑149 (MQ=255)
aTCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgc < 2:274906/149‑1 (MQ=255)
cGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCt < 1:79630/149‑1 (MQ=255)
gACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTg > 3:286606/1‑149 (MQ=255)
gACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTg > 2:368054/1‑149 (MQ=255)
gACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTg < 2:1052964/149‑1 (MQ=255)
aCGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTgg > 3:170183/1‑149 (MQ=255)
aTTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc < 2:910864/139‑1 (MQ=255)
aTTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTgcc > 1:910864/1‑139 (MQ=255)
aTTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCa > 3:900969/1‑149 (MQ=255)
gACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAgt > 4:88597/1‑149 (MQ=255)
cATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAgtgt < 4:900969/149‑1 (MQ=255)
ggggATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATg > 3:207223/1‑149 (MQ=255)
ggggATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATg > 1:1054639/1‑149 (MQ=255)
gggATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCaga > 3:821833/1‑141 (MQ=255)
gggATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGc < 2:117705/149‑1 (MQ=255)
gATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAg > 3:536898/1‑149 (MQ=255)
aTCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAgc < 2:516799/149‑1 (MQ=255)
tCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCTAGAGTGTATGCAgcg > 4:73904/1‑149 (MQ=255)
gCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTc < 1:113959/89‑1 (MQ=255)
gCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTc > 2:113959/1‑89 (MQ=255)
tGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGtt < 4:536898/149‑1 (MQ=255)
gTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGttt < 3:850261/149‑1 (MQ=255)
ctgctgCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTc < 4:177586/149‑1 (MQ=255)
tgctgcCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTcc < 2:94487/149‑1 (MQ=255)
tgcCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAgcggc < 2:87263/139‑1 (MQ=255)
tgcCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAgcggc > 1:87263/1‑139 (MQ=255)
cGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCttt > 4:514420/1‑149 (MQ=255)
cTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTa < 2:1053312/149‑1 (MQ=255)
cTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTa < 2:1054639/149‑1 (MQ=255)
tggtggCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCaga > 4:415431/1‑119 (MQ=255)
tggtggCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCaga < 3:415431/119‑1 (MQ=255)
gtggCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTAtgt < 2:940037/149‑1 (MQ=255)
ggCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTgg < 1:864410/149‑1 (MQ=255)
cgTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCgat < 3:88597/149‑1 (MQ=255)
tAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCgatga > 4:457027/1‑149 (MQ=255)
atgatgatgAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATc > 1:803277/1‑149 (MQ=255)
tgatgatgaACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATcc > 2:585949/1‑149 (MQ=255)
gatgatgaACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCt < 3:755503/149‑1 (MQ=255)
atgatgaACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTg < 4:10947/149‑1 (MQ=255)
gaACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGgtgct < 1:1017361/149‑1 (MQ=255)
gaACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGgtgct < 3:524869/149‑1 (MQ=255)
aaCGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGgtgctg > 4:162409/1‑149 (MQ=255)
gCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGgtgctgtgc > 3:1000453/1‑149 (MQ=255)
ggATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCa > 2:163111/1‑149 (MQ=255)
tGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttc < 2:493993/149‑1 (MQ=255)
tGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttc > 2:412290/1‑149 (MQ=255)
tGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttc > 2:836984/1‑149 (MQ=255)
gATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttct > 2:448293/1‑149 (MQ=255)
gATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttct > 3:884903/1‑149 (MQ=255)
aTAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttctt > 4:74374/1‑149 (MQ=255)
aTAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttctt > 3:730763/1‑149 (MQ=255)
aTAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttctt > 1:533572/1‑149 (MQ=255)
aTAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTACGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttctt > 1:683546/1‑149 (MQ=255)
tAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGttcttc < 1:407890/149‑1 (MQ=255)
aaaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTcc < 4:730763/149‑1 (MQ=255)
aaCAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTccg > 3:617698/1‑149 (MQ=255)
cAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTccgcc > 3:500381/1‑149 (MQ=255)
ggTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGc < 1:58209/149‑1 (MQ=255)
gTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGcc > 1:510566/1‑149 (MQ=255)
acacTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTg > 1:418714/1‑149 (MQ=255)
cacTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGa < 2:142141/149‑1 (MQ=255)
cacTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGa > 4:397790/1‑149 (MQ=255)
acTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGAt < 1:932950/149‑1 (MQ=255)
gggAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTAt < 1:163111/149‑1 (MQ=255)
ggAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATc > 3:817496/1‑149 (MQ=255)
ggAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATc < 4:286606/149‑1 (MQ=255)
aaGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATcgc < 1:792012/149‑1 (MQ=255)
gatcAACCAGACCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATcgcg > 3:474054/4‑149 (MQ=255)
gCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGa > 3:761816/1‑149 (MQ=255)
gCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGa > 3:797498/1‑149 (MQ=255)
cAACCAGACCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGaa < 1:142715/149‑1 (MQ=255)
aaCCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCtttt > 2:91603/1‑82 (MQ=255)
aaCCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCtttt < 1:91603/82‑1 (MQ=255)
aaCCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGaaa > 4:887066/1‑149 (MQ=255)
aaCCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGACTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTCATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGaaa > 4:1046253/1‑149 (MQ=255)
cAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGAAAAAt < 3:887066/149‑1 (MQ=255)
aGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGAAAAATc < 1:368054/149‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGAAAAATCGc > 4:796864/1‑149 (MQ=255)
gTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGAAAAATCGc > 2:408425/1‑149 (MQ=255)
|
GCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGCACACTGGGAAGGCAACCAGGTCTGGTTGATCCTCGCTGGTGGGGCATTATTTGCCGCCTGGCCCAGAGTGTATGCAGCGGCGTTTTCCGGCTTTTATGTGGCGATGATCCTGGTGCTGTGCTCACTGTTCTTCCGCCCGCTGGCCTTTGATTATCGCGGAAAAATCGC > NC_000913/1039334‑1039627
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
