Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A30 F33 I0 R2
|
539 |
121.1 |
4372944 |
98.1% |
4289858 |
141.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,808,682 |
C→G |
5.6% |
intergenic (+26/+15) |
yniA → / ← yniB |
fructosamine kinase family protein/putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,808,682 | 0 | C | G | 5.6%
| 499.4
/ 16.9
| 144 | intergenic (+26/+15) | yniA/yniB | fructosamine kinase family protein/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (69/66); new base G (6/2); total (75/69) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.42e-01 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GCCGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCAC > NC_000913/1808534‑1808827
|
gCCGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTcc < 4:885282/149‑1 (MQ=255)
ccGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCg > 4:587403/1‑149 (MQ=255)
ccGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCg > 2:1036500/1‑149 (MQ=255)
gATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTg > 1:924192/1‑149 (MQ=255)
tttCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCg > 3:98753/1‑149 (MQ=255)
ttGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCtt > 1:310676/1‑149 (MQ=255)
ttGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCACGGAGCGGccat < 1:233723/149‑3 (MQ=255)
gAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCtttt < 4:17727/149‑1 (MQ=255)
aCGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGa < 4:380188/149‑1 (MQ=255)
aCGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCACGGAGCGGCCattatc < 1:605990/149‑4 (MQ=255)
cGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGAt < 1:437161/149‑1 (MQ=255)
gTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGAtt < 3:163112/149‑1 (MQ=255)
tCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATta > 2:1030240/1‑149 (MQ=255)
aaCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTcc < 4:411071/130‑1 (MQ=255)
aaCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTcc > 3:411071/1‑130 (MQ=255)
aaCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaa < 1:49669/149‑1 (MQ=255)
aaCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaa < 4:801173/149‑1 (MQ=255)
aaCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaa < 4:962615/149‑1 (MQ=255)
aaCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTCGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaa > 1:548221/1‑149 (MQ=255)
aCCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaat > 1:930483/1‑149 (MQ=255)
ccGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaata > 3:205915/1‑149 (MQ=255)
cGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaataa < 2:886102/149‑1 (MQ=255)
gTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAAc < 3:1046449/149‑1 (MQ=255)
aCCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCaa < 2:561975/149‑1 (MQ=255)
aCCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCaa < 3:379616/149‑1 (MQ=255)
ccAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAg > 1:135849/1‑149 (MQ=255)
cAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGc > 1:239710/1‑149 (MQ=255)
aCTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCag > 1:823595/1‑149 (MQ=255)
ctACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAgaga > 2:641745/1‑149 (MQ=255)
cacGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGaaaa < 3:321287/149‑1 (MQ=255)
acGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaa > 1:318102/1‑129 (MQ=255)
acGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATtaaa < 2:318102/129‑1 (MQ=255)
gCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGaa < 1:732790/149‑1 (MQ=255)
aaaTCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATa > 1:747657/1‑149 (MQ=255)
aaTCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGTATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATaa < 4:221712/149‑1 (MQ=255)
tGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTgc < 3:587403/149‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCaa < 2:239710/149‑1 (MQ=255)
tATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATAc < 1:1101492/149‑1 (MQ=255)
aTTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACa < 1:672646/149‑1 (MQ=255)
tttGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACaa < 3:482608/149‑1 (MQ=255)
aGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCa > 2:678100/1‑149 (MQ=255)
aTTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGa > 4:888371/1‑149 (MQ=255)
aTTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGa < 4:969799/149‑1 (MQ=255)
tttGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGat > 4:1056844/1‑149 (MQ=255)
tttGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGat > 1:665967/1‑149 (MQ=255)
tttGGTTATTGCTCAACAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGat > 4:798669/1‑149 (MQ=255)
gTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATAc > 2:548274/1‑149 (MQ=255)
gTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATAc > 4:14287/1‑149 (MQ=255)
ttATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGAt < 1:400172/82‑1 (MQ=255)
ttATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGAt > 2:400172/1‑82 (MQ=255)
ttATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACa > 4:276444/1‑149 (MQ=255)
tATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAg < 3:473325/149‑1 (MQ=255)
aTTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACa < 1:1005784/147‑1 (MQ=255)
tGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTga < 2:829219/149‑1 (MQ=255)
tCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGaa > 3:627957/1‑149 (MQ=255)
tCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGaa > 2:166394/1‑149 (MQ=255)
gTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTg < 4:627957/149‑1 (MQ=255)
gTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGGTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTg > 2:428640/1‑149 (MQ=255)
cATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCa < 3:526354/149‑1 (MQ=255)
cATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCa < 3:1020686/149‑1 (MQ=255)
aTTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAg < 1:1036500/149‑1 (MQ=255)
aTTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAg < 3:1070989/149‑1 (MQ=255)
aTTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAg > 4:545728/1‑149 (MQ=255)
ggATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGaa > 4:213333/1‑149 (MQ=255)
gATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGaaa > 1:397514/1‑149 (MQ=255)
gATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGaaa > 3:123691/1‑149 (MQ=255)
gATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGaaa > 1:61090/1‑149 (MQ=255)
tAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATaa > 1:476202/1‑93 (MQ=255)
tAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATaa < 2:476202/93‑1 (MQ=255)
aGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTga < 4:757343/130‑1 (MQ=255)
aGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTga > 3:757343/1‑130 (MQ=255)
ttattaGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTa < 2:61090/149‑1 (MQ=255)
ttattaGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTa > 3:987556/1‑149 (MQ=255)
attaGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATg < 3:187545/149‑1 (MQ=255)
ttaGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAac < 2:160232/80‑1 (MQ=255)
taGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGt < 1:12512/149‑1 (MQ=255)
gcagcaTGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGc > 2:1014496/1‑149 (MQ=255)
gcaTGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCAGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGa > 3:915360/1‑149 (MQ=255)
gctatGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCGGAGAAAAGAACACATACCCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGaacaa < 4:928431/147‑1 (MQ=255)
atGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAAcaacaa < 4:1019973/149‑1 (MQ=255)
gggTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATa > 3:888378/1‑149 (MQ=255)
gTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAg > 3:596673/1‑104 (MQ=255)
ttGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACgg > 2:206045/1‑149 (MQ=255)
gAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGa < 1:816141/149‑1 (MQ=255)
tcaaaaggCCGCACGGAGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTc > 2:749823/7‑149 (MQ=255)
gATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTc > 3:284729/1‑149 (MQ=255)
gATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTc > 3:156921/1‑149 (MQ=255)
gATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAAACCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCGGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGt < 2:693192/127‑1 (MQ=255)
aTAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCa > 4:297947/1‑149 (MQ=255)
aaaaggCCGCACGGAGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCaa > 3:127585/5‑149 (MQ=255)
aaaaggCCGCACGGAGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCaa > 2:565696/5‑149 (MQ=255)
aaaggCCGCACGGAGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAAt > 3:509387/4‑149 (MQ=255)
aaTGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAAt > 3:628339/1‑149 (MQ=255)
aaTGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGAAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAAt > 3:704855/1‑149 (MQ=255)
ggCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTg < 2:930483/149‑1 (MQ=255)
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gCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTgag < 4:1079500/92‑1 (MQ=255)
gCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCa < 2:554971/149‑1 (MQ=255)
cTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCAc > 4:938942/1‑149 (MQ=255)
|
GCCGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCAC > NC_000913/1808534‑1808827
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
