Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F106 I0 R1
|
598 |
170.7 |
6333854 |
98.1% |
6213510 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,153,214 |
T→A |
5.8% |
intergenic (+34/‑86) |
fabF → / → pabC |
3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase II/4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,153,214 | 0 | T | A | 5.8%
| 827.4
/ 27.8
| 238 | intergenic (+34/‑86) | fabF/pabC | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase II/4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (123/101); new base A (8/6); total (131/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
ATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTT > NC_000913/1153068‑1153362
|
aTCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGc < 4:1233301/149‑1 (MQ=255)
aTCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGc > 3:1233301/1‑149 (MQ=255)
tCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCg > 1:1235005/1‑149 (MQ=255)
cTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCgg < 4:411077/149‑1 (MQ=255)
tGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCggg > 2:1318982/1‑149 (MQ=255)
gATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGcc > 1:136446/1‑149 (MQ=255)
gTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCtttttt < 3:1329892/149‑1 (MQ=255)
gTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGATCCGCTTGCGGGCCtttttt > 2:1446175/1‑149 (MQ=255)
cgtaCGAAGCGCGTTAGGTTAGCGGAATGGAATACTCTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTTGCCCTAATGGTTCTTTTATCTTTAGAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCTCCCTTATACAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCttt < 2:355254/146‑2 (MQ=255)
aGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTa < 2:424232/149‑1 (MQ=255)
gcgcGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTAt > 4:806930/1‑149 (MQ=255)
aGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGCCCGCAAGCGGACCtttt < 2:667901/123‑1 (MQ=255)
aatggaatACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAg > 3:695267/1‑149 (MQ=255)
tggaatACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGCCCGCAAGCGGACCttttat > 3:386881/1‑116 (MQ=255)
tggaatACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGCCCGCAAGCGGACCttttat < 4:386881/118‑3 (MQ=255)
atACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCTGACTTGTTCCGTAGTGAACa > 4:638815/1‑149 (MQ=255)
tACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAt > 3:481544/1‑149 (MQ=255)
tACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAt < 3:296564/149‑1 (MQ=255)
acTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAtgct > 3:1533450/1‑149 (MQ=255)
ctctGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAtgctg > 1:946946/1‑149 (MQ=255)
tctGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAGTGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAtgctgc > 4:1001693/1‑149 (MQ=255)
tgtgTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCca < 3:542442/149‑1 (MQ=255)
gtgtAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCcac > 4:267003/1‑149 (MQ=255)
tAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACt < 4:1552347/149‑1 (MQ=255)
aaCTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATTCTGCCACACTa > 4:1333741/1‑149 (MQ=255)
cTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAAc > 3:750037/1‑149 (MQ=255)
tCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACa > 1:891674/1‑149 (MQ=255)
cttcggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAAt > 2:1150027/1‑149 (MQ=255)
cttcggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAAt > 1:1439733/1‑149 (MQ=255)
ttcggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAAtt > 2:1164385/1‑149 (MQ=255)
ttcggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAAtt > 4:614572/1‑149 (MQ=255)
ttcggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAAtt > 4:919500/1‑149 (MQ=255)
ggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGGTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATtctc < 2:1363132/149‑1 (MQ=255)
ggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATtctc < 3:360984/149‑1 (MQ=255)
ggcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATtctc < 2:492448/149‑1 (MQ=255)
gcttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGCCCGCAAGCGGACCtttt < 1:787085/89‑1 (MQ=38)
ttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGa < 1:1134191/149‑1 (MQ=255)
ttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGa > 1:1552445/1‑149 (MQ=255)
ttcggTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGa < 2:25669/149‑1 (MQ=255)
gTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAg < 3:1315858/149‑1 (MQ=255)
gCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAg > 1:141663/1‑149 (MQ=255)
aaTGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAtgctg < 4:1098261/117‑1 (MQ=255)
tGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGCAGCCGGTAt < 2:131181/149‑1 (MQ=255)
gTTCTTTGATCTTAAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGt > 2:805513/1‑149 (MQ=255)
ttCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGtt > 2:959338/1‑149 (MQ=255)
ttCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGtt > 4:1408670/1‑149 (MQ=255)
tCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCATCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTc > 3:1165394/1‑149 (MQ=255)
tCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTc < 4:750037/149‑1 (MQ=255)
tCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTc < 1:1085739/149‑1 (MQ=255)
tttGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCtt > 1:1015263/1‑149 (MQ=255)
ttagATCTTTTTAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGt < 3:1438118/138‑1 (MQ=255)
ttGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCtta < 1:635052/149‑1 (MQ=255)
ttGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCtta < 3:1429143/149‑1 (MQ=255)
aTCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCg < 2:562504/135‑1 (MQ=255)
aTCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaatt > 1:533733/1‑149 (MQ=255)
aTCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaatt > 2:1122889/1‑149 (MQ=255)
tCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGt < 1:673250/136‑1 (MQ=255)
cTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaattaa < 2:63225/149‑1 (MQ=255)
cTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaattaa < 3:861362/149‑1 (MQ=255)
tttAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTAt > 1:76349/1‑136 (MQ=255)
tttAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAAc > 3:834406/1‑149 (MQ=255)
aaaGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCa > 3:745174/1‑149 (MQ=255)
aaGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATATAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCAt < 1:458541/149‑1 (MQ=255)
gATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATaa < 4:535196/149‑1 (MQ=255)
gATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATaa > 1:415866/1‑149 (MQ=255)
gATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATaa < 4:1533450/149‑1 (MQ=255)
aTCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAAc > 3:1564331/1‑140 (MQ=255)
aTCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAAc < 4:1564331/140‑1 (MQ=255)
cTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCa < 3:348554/149‑1 (MQ=255)
cTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCa < 1:493824/149‑1 (MQ=255)
tAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGaa > 2:395061/1‑83 (MQ=255)
tAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAg < 1:1103925/149‑1 (MQ=255)
aGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCTACTTGTTCCGTAGTTAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCTGGTATGTTCTTAATTAACGGACATAAGCAGGa > 3:1274333/1‑149 (MQ=255)
ttGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAAt > 4:920975/1‑149 (MQ=255)
tCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGt > 1:586356/1‑119 (MQ=255)
tCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGt < 2:586356/119‑1 (MQ=255)
tCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaa > 4:711209/1‑125 (MQ=255)
tCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaa < 3:711209/125‑1 (MQ=255)
ttttCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCt > 1:1313815/1‑119 (MQ=255)
cACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTATTTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTa > 3:621418/1‑149 (MQ=255)
aCCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTaa < 2:891674/149‑1 (MQ=255)
ccTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaa < 1:33135/114‑1 (MQ=255)
ccTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGc > 4:271513/1‑149 (MQ=255)
ccTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGc > 2:1415394/1‑149 (MQ=255)
ccTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGc > 2:943609/1‑149 (MQ=255)
cTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACAtgctgc < 3:270693/72‑1 (MQ=255)
ttATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGGCTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGa > 4:1207999/1‑149 (MQ=255)
ttATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGa > 1:1072322/1‑149 (MQ=255)
gaaaaaaGGCCCGCAAGCGGACCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGAt > 2:1585170/4‑149 (MQ=255)
ataAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATc < 2:1072322/149‑1 (MQ=255)
taAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCg < 3:1001693/149‑1 (MQ=255)
aaaaGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCgg > 1:914590/1‑149 (MQ=255)
aaGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCgg < 4:353133/147‑1 (MQ=255)
aaGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGc < 2:728499/149‑1 (MQ=255)
aaGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGc > 4:102868/1‑149 (MQ=255)
tCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGt < 4:586455/110‑1 (MQ=255)
tCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGt > 3:586455/1‑110 (MQ=255)
ttGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGtt < 1:970929/149‑1 (MQ=255)
tGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGttt < 2:326336/149‑1 (MQ=255)
tGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGttt < 1:393546/149‑1 (MQ=255)
|
ATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTT > NC_000913/1153068‑1153362
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
