Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F106 I0 R1
|
598 |
170.7 |
6333854 |
98.1% |
6213510 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,009,731 |
A→G |
7.8% |
intergenic (+19/‑90) |
yedF → / → yedK |
putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,009,731 | 0 | A | G | 7.8%
| 435.5
/ 16.8
| 139 | intergenic (+19/‑90) | yedF/yedK | putative TusA family sulfurtransferase/DUF159 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/60); new base G (5/6); total (73/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.56e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
AATCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGC > NC_000913/2009583‑2009876
|
aaTCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCACTCCCGCTGTGa < 3:1356156/149‑1 (MQ=255)
cTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTTCCGCTGTGACCca < 3:870142/149‑1 (MQ=255)
ggAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCcaca > 3:361255/1‑149 (MQ=255)
gtggtgAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCgg < 1:1309265/149‑1 (MQ=255)
gtgAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGaa < 1:734438/149‑1 (MQ=255)
tgAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGaat < 1:41153/149‑2 (MQ=255)
gAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGaatg < 3:1115045/149‑3 (MQ=255)
aGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACAt < 4:1467207/149‑1 (MQ=255)
gCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGa > 1:1576556/1‑144 (MQ=255)
gCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATc > 1:482913/1‑149 (MQ=255)
tGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTAc < 2:482913/149‑1 (MQ=255)
tGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCCCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTAc < 2:1197707/149‑1 (MQ=255)
cGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCttt < 2:689266/149‑1 (MQ=255)
cGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCttt > 4:396949/1‑149 (MQ=255)
gCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGTGCACAGCGGGaa > 1:548295/1‑135 (MQ=255)
cAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGt < 1:812988/149‑1 (MQ=255)
gTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTAt < 4:163464/149‑1 (MQ=255)
tCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATc > 2:1554051/1‑149 (MQ=255)
cGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATca < 2:726891/149‑1 (MQ=255)
cGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGCTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGGCCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATca < 3:1341982/149‑1 (MQ=255)
gATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGAccc > 4:863899/1‑119 (MQ=255)
gATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCggg < 1:47491/127‑1 (MQ=255)
gATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATcac > 1:332766/1‑149 (MQ=255)
aataatATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTa < 2:792647/141‑1 (MQ=255)
aataatATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTa > 1:792647/1‑141 (MQ=255)
ataataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGa < 4:1330477/149‑1 (MQ=255)
taataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAt < 1:428238/149‑1 (MQ=255)
taataTTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGAt > 3:473306/1‑149 (MQ=255)
atatTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGa < 3:507742/108‑1 (MQ=255)
atatTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGa > 4:507742/1‑108 (MQ=255)
gATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGccccc > 3:743773/1‑149 (MQ=255)
tGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATc > 2:656919/1‑112 (MQ=255)
tGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATc < 1:656919/112‑1 (MQ=255)
gcgcGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACt > 2:409754/1‑149 (MQ=255)
cgcgTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTc < 1:924563/149‑1 (MQ=255)
gcgTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTcc > 2:1062871/1‑149 (MQ=255)
gTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCttt > 4:112582/1‑116 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCGTTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTAtt < 3:454094/149‑1 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTa > 1:884996/1‑109 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTa < 2:884996/109‑1 (MQ=255)
aaTCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGt > 2:1576898/1‑116 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATca > 3:665372/1‑116 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATca < 4:665372/116‑1 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCttt > 3:1541285/1‑149 (MQ=255)
aCGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCttt > 4:1208749/1‑149 (MQ=255)
cGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCtttt < 1:1554051/149‑1 (MQ=255)
gCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCa < 1:1204043/149‑1 (MQ=255)
cTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCtttt < 1:50399/146‑1 (MQ=255)
cTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCtttt > 2:50399/1‑146 (MQ=255)
ataCGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTa < 3:1349808/149‑1 (MQ=255)
ataCGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTa < 2:1266190/149‑1 (MQ=255)
taCGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACTCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTAt < 1:553112/149‑1 (MQ=255)
cGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGa < 1:1516711/149‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGaat > 2:1466072/1‑87 (MQ=38)
ggTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGaat < 1:1466072/88‑2 (MQ=38)
cTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCa < 3:1208749/149‑1 (MQ=255)
tGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCag > 3:662296/1‑149 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTa > 2:1340866/1‑138 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTa < 1:1340866/138‑1 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga < 1:272713/149‑1 (MQ=255)
gATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTCACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga > 1:914061/1‑149 (MQ=255)
atTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGcccc > 2:394348/1‑115 (MQ=255)
ttCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGtt > 1:661855/1‑149 (MQ=255)
cAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGa > 3:85921/1‑70 (MQ=255)
cAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGa < 4:85921/70‑1 (MQ=255)
cAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAt < 2:581813/149‑1 (MQ=255)
cAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAt > 2:1516705/1‑149 (MQ=255)
aGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTAtgt < 2:913775/149‑1 (MQ=255)
gggCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTgg > 3:125640/1‑149 (MQ=255)
gACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCt > 2:896916/1‑149 (MQ=255)
gACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGCTTCTATGTGTGGACGCt > 1:1015481/1‑149 (MQ=255)
aCCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCtt < 4:743773/149‑1 (MQ=255)
gtggtttAATTCAGAATGAATCCCTCATGGCCGCTGTGACCGACGGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACGTGGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTGTAGTATGATCTCAGGATGTTTCTCTGCGTGGACTCTTTGCCCag > 4:829579/5‑148 (MQ=255)
gTTATTTCATTCAGAAGTAGTCCCCCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAAGATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCAATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCaa > 4:1331543/1‑149 (MQ=255)
gTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCaa > 2:77594/1‑149 (MQ=255)
tttAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATccc > 2:968647/1‑149 (MQ=255)
aTTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCa < 2:1371199/99‑1 (MQ=255)
tCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAAcgc > 1:1337364/1‑149 (MQ=255)
aGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt > 3:304865/1‑149 (MQ=255)
aGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt > 2:556061/1‑149 (MQ=255)
aGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt > 1:1513073/1‑149 (MQ=255)
aGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGaa < 3:533659/149‑1 (MQ=255)
tAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGCATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGa > 3:461301/1‑149 (MQ=255)
aaTCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGAt > 2:283598/1‑149 (MQ=255)
tCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTa > 4:814916/1‑149 (MQ=255)
cgatgttCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGAATATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTAcc > 4:1190706/6‑149 (MQ=255)
ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCtt > 2:316267/1‑81 (MQ=255)
ccTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCtt < 1:316267/81‑1 (MQ=255)
cTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga < 3:410273/98‑1 (MQ=255)
cTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga > 4:410273/1‑98 (MQ=255)
cTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCt > 1:211327/1‑149 (MQ=255)
aTTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc > 4:1347890/1‑149 (MQ=255)
ttCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgcg > 3:329429/1‑149 (MQ=255)
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tCCCGCTGTGGGTCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACGTAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgcgc > 2:1534186/1‑149 (MQ=255)
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cGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCTACTCCTATTCTTATCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTtc < 3:96171/149‑1 (MQ=255)
cGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTtc < 1:897367/149‑1 (MQ=255)
gCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTtct < 3:396949/149‑1 (MQ=255)
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AATCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGGAACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCCGCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGC > NC_000913/2009583‑2009876
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
