Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F50 I3 R1
|
105 |
107.9 |
3491495 |
95.1% |
3320411 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,216,705 |
A→G |
intergenic (+70/‑43) |
ariR → / → ymgC |
RcsB connector protein for regulation of biofilm and acid‑resistance/Blue light, low temperature and stress induced protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,216,705 | 0 | A | G | 100.0%
| 303.0
/ NA
| 75 | intergenic (+70/‑43) | ariR/ymgC | RcsB connector protein for regulation of biofilm and acid‑resistance/Blue light, low temperature and stress induced protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (39/36); total (39/36) |
CAAGTGATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATACACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAGTCATATT > NC_000913/1216559‑1216849
|
caaGTGATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATgcac > 1:747578/1‑150 (MQ=255)
aaGTGATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATgcac > 4:416993/1‑149 (MQ=255)
aGTGATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGc < 3:341729/151‑1 (MQ=255)
aGTGATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGc < 1:763041/151‑1 (MQ=255)
gATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATa < 1:539021/151‑1 (MQ=255)
atatTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATaa < 1:573016/151‑1 (MQ=255)
ctcAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAAtttt > 4:146362/1‑150 (MQ=255)
cAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAAtttt < 1:304/148‑1 (MQ=255)
cAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTAtt < 2:594893/151‑1 (MQ=255)
tGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGtt > 1:734740/1‑150 (MQ=255)
tGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGtt > 1:520451/1‑150 (MQ=255)
aTGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAat > 3:280426/1‑151 (MQ=255)
tgtgATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAat > 2:1064632/1‑150 (MQ=255)
tgtgATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAat > 2:992260/1‑150 (MQ=255)
gtgATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAatat < 2:274709/151‑1 (MQ=255)
aTTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTc > 2:1109707/1‑151 (MQ=255)
aTTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTc < 3:146318/151‑1 (MQ=255)
tAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCt < 1:1268053/150‑1 (MQ=255)
aGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTa < 1:827978/150‑1 (MQ=255)
gAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACg < 1:219253/151‑1 (MQ=255)
aaaaaCACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAAGTTTATTGGGTTAATATTTCTACGa < 2:295672/151‑1 (MQ=255)
aaaaCACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAg < 1:313146/151‑1 (MQ=255)
cTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGa > 1:782316/1‑150 (MQ=255)
ggAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACAt < 1:1111001/151‑1 (MQ=255)
gAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATg < 4:334879/151‑1 (MQ=255)
gAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATg > 2:970657/1‑151 (MQ=255)
aaaTCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATg > 4:82712/1‑150 (MQ=255)
aaaTCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATg > 2:1239463/1‑150 (MQ=255)
aaaTCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATg > 3:440544/1‑150 (MQ=255)
cGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGaataa < 1:1236511/151‑1 (MQ=255)
cGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGaataa < 2:81520/151‑1 (MQ=255)
gCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAAt > 1:1163752/1‑151 (MQ=255)
acacAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCag < 2:921502/151‑1 (MQ=255)
cacaGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCaga < 1:728693/151‑1 (MQ=255)
acaGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCag > 1:835036/1‑149 (MQ=255)
gCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCagag > 2:1222007/1‑148 (MQ=255)
gCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAgagaga < 2:870694/151‑1 (MQ=255)
gatgatATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGat < 1:810666/149‑1 (MQ=255)
atgatATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGattt > 3:204785/1‑150 (MQ=255)
gatATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGatttatt > 2:1253106/1‑151 (MQ=255)
atatGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGatttattt > 1:237371/1‑151 (MQ=255)
atatGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGatttattt > 1:164729/1‑151 (MQ=255)
atGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTAttttt < 2:579376/151‑1 (MQ=255)
atGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTAtttt < 2:615505/150‑1 (MQ=255)
tAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCa > 1:705679/1‑150 (MQ=255)
tAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCa > 1:287846/1‑150 (MQ=255)
aaCTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAAt > 2:502726/1‑151 (MQ=255)
cTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCt > 2:657693/1‑151 (MQ=255)
aaTTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCttt > 1:1123510/1‑151 (MQ=255)
ttattaAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGt > 2:695872/1‑151 (MQ=255)
attaAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATCTATTTTTCAATGTGCTTTGtt < 2:422621/150‑1 (MQ=255)
taAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTa > 2:1014433/1‑150 (MQ=255)
aGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTaaaa < 2:377608/151‑1 (MQ=255)
gTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTaaaaa < 1:498435/151‑1 (MQ=255)
ataAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAAtc > 2:289594/1‑151 (MQ=255)
ataAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAAt < 4:204788/150‑1 (MQ=255)
ataAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAAt < 1:1200883/150‑1 (MQ=255)
aaGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAAtctc < 1:772564/151‑1 (MQ=255)
aaGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAAtctc > 1:506776/1‑151 (MQ=255)
aaGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAAtctc > 1:113012/1‑151 (MQ=255)
aGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCg > 1:1261363/1‑151 (MQ=255)
aGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCg > 3:161738/1‑151 (MQ=255)
gTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCga < 3:82712/151‑1 (MQ=255)
ttATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCg > 1:1023388/1‑148 (MQ=255)
taGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAgaggg > 4:122372/1‑151 (MQ=255)
gAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAgaggg > 1:1179734/1‑149 (MQ=255)
cattcatCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGtt < 4:440550/149‑1 (MQ=255)
attcatCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCAt > 2:413150/1‑151 (MQ=255)
ttcatCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATg > 1:671249/1‑151 (MQ=255)
tATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACg < 2:88677/147‑1 (MQ=255)
tATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCAt < 1:440531/150‑1 (MQ=255)
tctgtcGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGtt > 1:505214/1‑151 (MQ=255)
cGCTTTAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAg < 2:905255/151‑1 (MQ=255)
ttAGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAGTCat > 3:30725/1‑151 (MQ=255)
aGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAGTCatat > 2:1194755/1‑151 (MQ=255)
aGACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAGTCatat < 1:626976/151‑1 (MQ=255)
gACTATGCACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAGTCAtatt < 1:821990/151‑1 (MQ=255)
|
CAAGTGATATTCTCAAAGCTGATGTGATTAGAAAAACACTGGAAATCGTGTTGCGATACACAGCTGATGATATGTAACTTCTAATTATTAAGTATAAGTTTATAGAAAACTCATTCATCTTATTTTTGTCTGTCGCTTTAGACTATACACAGCATAATTTTATTGGGTTAATATTTCTACGAGGCTGACATGAATAATTCAATCCCAGAGAGATTTATTTTTCAATGTGCTTTGTTTAAAAATCTCGAGAGGGAGGTGTTCATGACGCATGGGTATGTTGATAGTCATATT > NC_000913/1216559‑1216849
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
