Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F50 I3 R1
|
105 |
107.9 |
3491495 |
95.1% |
3320411 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,143,684 |
(G)6→7 |
coding (419/3318 nt) |
yegE → |
putative diguanylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,143,678 | 1 | . | G | 98.8%
| 318.3
/ NA
| 84 | L138W (TTG→TGG) | yegE | putative diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base G (44/39); minor base A (0/1); total (44/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTT‑GGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGC > NC_000913/2143529‑2143823
|
gCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTT‑g < 3:266044/151‑1 (MQ=255)
aCATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTT‑gggggg < 1:883316/151‑1 (MQ=255)
aCATGACCTGGACCACCATCAATATTTTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTTCTGGTTCGTAAATTGCTGCCGTGGTTTAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTT‑gggggg < 2:783036/151‑1 (MQ=255)
aTGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTT‑gggggggt < 1:876593/151‑3 (MQ=255)
ccTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTc < 1:234635/151‑1 (MQ=255)
cTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCt > 2:942791/1‑151 (MQ=255)
cTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCt > 1:1273877/1‑151 (MQ=255)
gacgacCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGt > 1:1117080/1‑151 (MQ=255)
acgacCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGtt < 4:112828/151‑1 (MQ=255)
acgacCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGtt < 2:357742/151‑1 (MQ=255)
cgacCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTg < 1:884802/151‑1 (MQ=255)
acCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTc < 2:882984/151‑1 (MQ=255)
cATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCct < 3:373586/151‑1 (MQ=255)
aTCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCctg > 2:617403/1‑151 (MQ=255)
cAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCctgct > 1:783829/1‑151 (MQ=255)
aaTATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCctgctg > 1:175127/1‑151 (MQ=255)
aaTATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCctgctg < 3:22995/151‑1 (MQ=255)
aaTATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCctgctg < 4:440284/151‑1 (MQ=255)
atatTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCctgctg > 4:252541/1‑150 (MQ=255)
atatTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGa < 2:640647/151‑1 (MQ=255)
tgAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCg < 3:409292/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCgg > 1:114067/1‑149 (MQ=255)
aGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGgaga < 2:617647/151‑1 (MQ=255)
gCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGAc > 4:137456/1‑151 (MQ=255)
gCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGAc < 1:992461/151‑1 (MQ=255)
gTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGAt > 4:372163/1‑151 (MQ=255)
ggTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATcc > 3:277978/1‑151 (MQ=255)
gTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCct < 4:225507/151‑1 (MQ=255)
cGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCctct > 1:437027/1‑151 (MQ=255)
cGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCctct > 3:76997/1‑151 (MQ=255)
cGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCctct > 2:127615/1‑151 (MQ=255)
ggggCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCtctc > 3:333732/1‑151 (MQ=255)
gggCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCa < 4:362514/151‑1 (MQ=255)
gctgctACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCAt < 1:730563/150‑1 (MQ=255)
ctgctACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCAttt > 1:1263913/1‑151 (MQ=255)
ctACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCAttttt > 2:825801/1‑150 (MQ=255)
aCGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTg < 3:28379/149‑1 (MQ=255)
aCGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGat > 2:707350/1‑151 (MQ=255)
gTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGatat > 4:270145/1‑151 (MQ=255)
tAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATg > 1:667779/1‑151 (MQ=255)
aTTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGt < 1:60797/151‑1 (MQ=255)
tgctgcCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTa < 4:370853/150‑1 (MQ=255)
gctgcCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTAc < 1:930354/150‑1 (MQ=255)
gcCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGt < 1:953843/150‑1 (MQ=255)
aggTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGa > 2:310887/2‑150 (MQ=255)
gTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATc < 2:493234/151‑1 (MQ=255)
ataACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATcc > 1:891999/1‑150 (MQ=255)
taACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCAt > 2:1244690/1‑151 (MQ=255)
aaCCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATc > 2:810046/1‑151 (MQ=255)
aCCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCg > 4:11321/1‑151 (MQ=255)
aCCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCg > 3:351821/1‑151 (MQ=255)
ccTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGgcg < 4:383905/151‑1 (MQ=255)
gCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGctct < 3:242339/151‑1 (MQ=255)
gCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGctc < 1:262382/150‑1 (MQ=255)
cAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGctct > 3:84471/1‑150 (MQ=255)
cAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTg > 1:945102/1‑151 (MQ=255)
cAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTg < 2:326656/151‑1 (MQ=255)
cAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTg > 2:22270/1‑151 (MQ=255)
aaaaTCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTgg < 1:395100/151‑1 (MQ=255)
aaaaTCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTgg > 4:69504/1‑151 (MQ=255)
tCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACt > 1:453315/1‑151 (MQ=255)
cTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTg > 2:932312/1‑151 (MQ=255)
tGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGcc > 3:338295/1‑151 (MQ=255)
tGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTg > 4:23910/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCt < 4:385523/149‑1 (MQ=255)
ggCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTg < 2:10402/150‑1 (MQ=255)
tGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGAt > 1:1227362/1‑151 (MQ=255)
gTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGt < 2:570217/151‑1 (MQ=255)
ggCACTCGGCGGCGTCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGtt < 3:89223/148‑1 (MQ=255)
ggCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTa < 4:351226/149‑1 (MQ=255)
ggCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTAtt < 2:147295/151‑1 (MQ=255)
ggCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTAt < 2:1128040/150‑1 (MQ=255)
gCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTa < 2:109340/148‑1 (MQ=255)
gCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTAttt > 2:224259/1‑151 (MQ=255)
tCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAAc > 1:58096/1‑151 (MQ=255)
gCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACcac > 2:698217/1‑151 (MQ=255)
gcgcCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACt < 2:491782/151‑1 (MQ=255)
gcCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTAt < 1:1077751/151‑1 (MQ=255)
cATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATct > 1:810731/1‑151 (MQ=255)
aTTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATctg < 1:830001/151‑1 (MQ=255)
tGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTTGTTGTCCTGCTGACGCACGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTAActg < 3:421056/149‑1 (MQ=255)
tGTTCCGCCTCTGTTAGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATctg < 2:649743/149‑1 (MQ=255)
gTTCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATctgct < 1:114411/150‑1 (MQ=255)
tCCGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTgcg > 2:830169/1‑151 (MQ=255)
cGCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGcc > 3:235043/1‑151 (MQ=255)
gCCTCTGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGcc > 4:161493/1‑150 (MQ=255)
tctGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCg > 4:235658/1‑151 (MQ=255)
ctGTTGGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGc > 2:532626/1‑151 (MQ=255)
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GCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTT‑GGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGC > NC_000913/2143529‑2143823
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
