Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I2 R1
|
150 |
68.2 |
2132745 |
98.7% |
2105019 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
571,192 |
T→A |
D100E (GAT→GAA) |
ybcL → |
inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 571,192 | 0 | T | A | 100.0%
| 308.2
/ NA
| 77 | D100E (GAT→GAA) | ybcL | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (44/33); total (44/33) |
ATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGA > NC_000913/571045‑571338
|
aTCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCa < 2:788080/151‑1 (MQ=255)
cGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAgg > 2:177026/1‑151 (MQ=255)
gCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAggg < 1:586186/151‑1 (MQ=255)
gCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAggg < 1:143178/151‑1 (MQ=255)
ccTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGgag < 1:60571/151‑1 (MQ=255)
aCCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATg > 2:503958/1‑151 (MQ=255)
aCCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATg > 2:421837/1‑151 (MQ=255)
ctggtGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACaa > 2:109958/1‑150 (MQ=255)
tggtGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACaaa > 2:369716/1‑150 (MQ=255)
ggtGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACaa < 1:111677/148‑1 (MQ=255)
gtTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTg < 1:485340/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCg < 2:367692/150‑1 (MQ=255)
gAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTg < 2:518044/151‑1 (MQ=255)
ccAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGt > 1:320310/1‑151 (MQ=255)
gCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAgg > 1:606689/1‑151 (MQ=255)
cTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGc > 2:787240/1‑151 (MQ=255)
gCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGa > 1:384230/1‑150 (MQ=255)
gTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATg < 1:555351/151‑1 (MQ=255)
tAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATg > 1:522738/1‑150 (MQ=255)
aaCTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGAt < 2:131834/151‑1 (MQ=255)
aaCTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGAt < 1:639398/151‑1 (MQ=255)
atatGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGc > 1:288788/1‑151 (MQ=255)
atGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCt < 1:325496/150‑1 (MQ=255)
tCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCt > 1:946244/1‑151 (MQ=255)
ccAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTg > 1:459949/1‑151 (MQ=255)
cAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTgg < 2:1007249/151‑1 (MQ=255)
aGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTggg < 2:309350/151‑1 (MQ=255)
aTGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGtt > 1:857595/1‑151 (MQ=255)
aTGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGATGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGtt < 2:917681/151‑1 (MQ=255)
tGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGttt > 2:823476/1‑151 (MQ=255)
tGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGttt > 1:147834/1‑151 (MQ=255)
aCCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTtggt > 2:289117/1‑151 (MQ=255)
aCCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTtggt > 2:997368/1‑151 (MQ=255)
aCCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTtggt < 1:948235/151‑1 (MQ=255)
tACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgc > 2:521445/1‑151 (MQ=255)
tACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgc > 2:423820/1‑151 (MQ=255)
aCAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgcg > 2:775613/1‑151 (MQ=255)
aCAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgcg < 1:434840/151‑1 (MQ=255)
aCAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgc < 2:247900/150‑1 (MQ=255)
aGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgcgc > 1:971024/1‑150 (MQ=255)
aGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCa < 2:801669/151‑1 (MQ=255)
ggCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCAt < 2:189112/151‑1 (MQ=255)
gCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATg < 1:532244/151‑1 (MQ=255)
aGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtc > 2:861183/1‑151 (MQ=255)
gTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcc > 1:225765/1‑151 (MQ=255)
ggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTaa < 2:322779/151‑1 (MQ=255)
aTTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGgaga < 2:306012/151‑1 (MQ=255)
ggACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATa < 2:457956/150‑1 (MQ=255)
aCTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAAc > 2:991316/1‑151 (MQ=255)
cTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAAcc > 2:248394/1‑151 (MQ=255)
tgttgtTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAAcc > 2:108300/1‑150 (MQ=255)
gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAAcc < 1:535480/149‑1 (MQ=255)
gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcac < 1:503972/151‑1 (MQ=255)
gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcac > 1:568700/1‑151 (MQ=255)
gttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcat < 2:1020268/150‑1 (MQ=255)
tAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatcat > 2:237121/1‑151 (MQ=255)
tAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatca < 1:468029/150‑1 (MQ=255)
tatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc > 2:114566/1‑151 (MQ=255)
tatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc > 2:316853/1‑151 (MQ=255)
ttCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAcc > 2:621678/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAcc > 2:143327/1‑149 (MQ=255)
ccAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGt > 2:426994/1‑151 (MQ=255)
cAACAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTa > 1:13038/1‑150 (MQ=255)
cAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGt > 1:316764/1‑151 (MQ=255)
cAGTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGt > 2:80536/1‑151 (MQ=255)
gTAACATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTAt > 1:852274/1‑151 (MQ=255)
aCATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATggg < 1:310046/151‑1 (MQ=255)
cATATTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGc < 1:890618/151‑1 (MQ=255)
atatTTGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGct > 2:553218/1‑151 (MQ=255)
tttGCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctct > 1:220487/1‑150 (MQ=255)
gCCCGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaaa > 1:389548/1‑150 (MQ=255)
cccGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaaaaa < 2:1000501/151‑1 (MQ=255)
ccGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAAc > 1:708725/1‑151 (MQ=255)
ccGTTGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAAc > 1:61937/1‑151 (MQ=255)
ttGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTg > 1:192371/1‑150 (MQ=255)
tGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGa < 1:1062977/150‑1 (MQ=255)
tGAAGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGa < 2:273385/150‑1 (MQ=255)
|
ATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGA > NC_000913/571045‑571338
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
