Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,990,332 |
T→C |
F218L (TTT→CTT) |
tyrP → |
tyrosine transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,990,332 | 0 | T | C | 100.0%
| 390.9
/ NA
| 100 | F218L (TTT→CTT) | tyrP | tyrosine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (53/47); total (53/47) |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGTTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGG > NC_000913/1990184‑1990479
|
tCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGctt > 2:24414/1‑151 (MQ=255)
acaAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTtat < 4:52035/151‑1 (MQ=255)
caAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTtata < 3:820538/151‑1 (MQ=255)
aaaGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTtata > 2:305922/1‑150 (MQ=255)
aaaGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTtata > 3:1153488/1‑150 (MQ=255)
aGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATc < 2:681219/151‑1 (MQ=255)
tGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCgg > 2:1035843/1‑151 (MQ=255)
gAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCgg < 4:439066/150‑1 (MQ=255)
gAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCgg < 3:605762/150‑1 (MQ=255)
gAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGt < 3:664603/151‑1 (MQ=255)
ttttAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGc > 2:1241842/1‑151 (MQ=255)
tttAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCg > 4:405675/1‑151 (MQ=255)
ttAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCg > 1:3479/1‑150 (MQ=255)
ttAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCg > 2:597419/1‑150 (MQ=255)
aaCCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGAt > 1:445927/1‑150 (MQ=255)
aaCCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATc > 2:1356762/1‑151 (MQ=255)
aaCCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACCCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATc < 2:1128544/151‑1 (MQ=255)
gCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCtg > 3:1382723/1‑151 (MQ=255)
ccGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCtgg < 3:670937/151‑1 (MQ=255)
cGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCtggt > 3:1224833/1‑151 (MQ=255)
ttGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCtggtgg > 2:1000903/1‑151 (MQ=255)
ttGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCtggtgg > 2:184273/1‑151 (MQ=255)
gCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGc > 2:318682/1‑150 (MQ=255)
gCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCa < 2:112518/151‑1 (MQ=255)
aaCAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTTATTTTTACGTCGTTTGGTTTGCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCat < 4:367874/150‑1 (MQ=255)
aCAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCatat > 2:11984/1‑151 (MQ=255)
cAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCatata < 1:329149/151‑1 (MQ=255)
aGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCatatat > 1:162672/1‑151 (MQ=255)
ggggCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATAtt > 4:329783/1‑151 (MQ=255)
ggctCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATccccc > 1:150791/1‑131 (MQ=255)
ggctCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATccccc < 4:150790/131‑1 (MQ=255)
ggctCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTg < 3:635682/150‑1 (MQ=255)
ggctCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTg < 1:267650/150‑1 (MQ=255)
ctgtctgCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCa < 3:722293/149‑1 (MQ=255)
gtctgCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTg > 2:819497/1‑151 (MQ=255)
ctgCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAg < 3:427179/146‑1 (MQ=255)
ctgCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAg > 2:427149/1‑146 (MQ=255)
gCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGc < 3:1035891/149‑1 (MQ=255)
gCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCg < 3:303998/150‑1 (MQ=255)
aaTCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACg > 3:1170772/1‑151 (MQ=255)
cccGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCtt < 4:314471/151‑1 (MQ=255)
ccGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTg < 2:103034/151‑1 (MQ=255)
gTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGgca < 4:100592/151‑1 (MQ=255)
gTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGgca < 3:338842/151‑1 (MQ=255)
aTTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGgcagca < 2:648464/151‑1 (MQ=255)
aTTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGgcagc > 1:65533/1‑150 (MQ=255)
tttACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGCTGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGAAGCAt > 2:1058048/1‑149 (MQ=255)
tACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGa < 2:130007/150‑1 (MQ=255)
tACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGa < 2:641663/150‑1 (MQ=255)
cgtTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTcaac > 2:588524/1‑151 (MQ=255)
cgtTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTcaac > 3:18073/1‑151 (MQ=255)
cgtTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTcaa < 3:70940/150‑1 (MQ=255)
cgtTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTcaa < 3:1263423/150‑1 (MQ=255)
tttGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTcaaca > 2:113853/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAAcc > 3:164581/1‑151 (MQ=255)
cACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATg < 2:836205/150‑1 (MQ=255)
cGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATggg > 2:96607/1‑150 (MQ=255)
ggTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGAt > 3:1042650/1‑151 (MQ=255)
aGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTg < 4:203589/150‑1 (MQ=255)
cGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCt > 2:1085222/1‑150 (MQ=255)
cGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTg < 2:1265431/151‑1 (MQ=255)
cGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTg < 4:328745/151‑1 (MQ=255)
cGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTg > 2:263998/1‑151 (MQ=255)
cGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTg < 3:1241901/151‑1 (MQ=255)
gTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTgg < 3:11988/151‑1 (MQ=255)
gTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTgg < 1:40688/151‑1 (MQ=255)
gTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTgg > 2:345777/1‑151 (MQ=255)
gCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCt < 3:1370693/151‑1 (MQ=255)
gTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTg < 2:669274/151‑1 (MQ=255)
tataTGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTa > 3:370646/1‑150 (MQ=255)
atatGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTaa > 4:463319/1‑150 (MQ=255)
atatGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTaa > 2:1124305/1‑150 (MQ=255)
atatGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTaa > 3:1376198/1‑150 (MQ=255)
atatGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTa < 2:1018090/149‑1 (MQ=255)
atggatggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCTTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTa > 3:959424/1‑147 (MQ=255)
atggatggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACg > 3:233878/1‑151 (MQ=255)
atggatggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACg < 1:328849/151‑1 (MQ=255)
ggatggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACggg < 3:176874/151‑1 (MQ=255)
ggatggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACgg < 1:58785/150‑1 (MQ=255)
atggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCt > 2:496520/1‑151 (MQ=255)
ggCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGt < 3:305952/151‑1 (MQ=255)
gCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAGCGGGCTGtt < 3:318712/151‑1 (MQ=255)
gCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGtt > 4:429539/1‑151 (MQ=255)
aCATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTAc > 1:230255/1‑150 (MQ=255)
aCATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTAc > 3:997284/1‑150 (MQ=255)
cATTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTAc > 3:252385/1‑149 (MQ=255)
aTTCGTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAgg > 1:35321/1‑151 (MQ=255)
gTAAGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGtt < 2:43949/151‑1 (MQ=255)
aaGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGtt > 3:643856/1‑149 (MQ=255)
aaGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTAc < 4:223236/151‑1 (MQ=255)
aGCTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTAcg < 3:184300/151‑1 (MQ=255)
cTACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTAGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTAcgcg > 2:1320057/1‑151 (MQ=255)
tACGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTAcgcg > 4:178110/1‑150 (MQ=255)
aCGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGaa < 1:289958/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGa > 2:592528/1‑150 (MQ=255)
cTGGGTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAAtg > 2:126401/1‑151 (MQ=255)
ggTGCTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGAATTGATTTAATAAGTTTTATGGGATTGATGGTTAATGATGTTGGATTAAATGGGGTGTTACAGGAGtt > 1:427582/1‑138 (MQ=255)
gtgcTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAAtggtgg < 2:1382653/151‑1 (MQ=255)
gtgcTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAAtggtgg < 2:1042604/151‑1 (MQ=255)
gtgcTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAAtggtgg > 2:1327296/1‑151 (MQ=255)
|
TCACAAAGTGAATCTTTTAACCCTGCCGTTGCAACAGGGGCTGGCTCTGTCTGCAATCCCGGTGATTTTTACGTCGTTTGGTTTTCACGGTAGCGTGCCGAGTATTGTCAGCTATATGGATGGCAACATTCGTAAGCTACGCTGGGTGTTTATAATCGGTAGTGCGATCCCCCTGGTGGCATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGG > NC_000913/1990184‑1990479
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
