Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
144 |
141.8 |
4677362 |
93.6% |
4378010 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,409,038 |
A→G |
E59E (GAA→GAG) |
yfbR → |
5'‑nucleotidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,409,038 | 0 | A | G | 100.0%
| 405.6
/ NA
| 112 | E59E (GAA→GAG) | yfbR | 5'‑nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (51/61); total (51/61) |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CCCGCCTGAAACTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAACGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATGGTT > NC_000913/2408893‑2409185
|
cccGCCTGAAACTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCg < 2:1327632/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAAACTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAGCGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGc > 4:43399/1‑151 (MQ=255)
cTGAAACTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCt < 1:719096/150‑1 (MQ=255)
aaaCTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTa > 1:1355110/1‑150 (MQ=255)
aaaCTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTAc < 2:260010/151‑1 (MQ=255)
cATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCg < 1:381237/151‑1 (MQ=255)
ttAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGAt > 1:1567881/1‑151 (MQ=255)
aaCCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGt < 1:881260/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTAc > 1:506866/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCa < 2:1675716/151‑1 (MQ=255)
gCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCa < 1:186587/151‑1 (MQ=255)
tGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTAcc > 4:409445/1‑148 (MQ=255)
ggCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACg < 2:351473/150‑1 (MQ=255)
ggCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACg < 3:182668/150‑1 (MQ=255)
ggCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGa < 2:1434409/151‑1 (MQ=255)
ccGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATg > 2:1203834/1‑151 (MQ=255)
cGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGc > 2:859498/1‑151 (MQ=255)
aTGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTc > 1:1691165/1‑149 (MQ=255)
gcgcAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGaa < 2:1483427/151‑1 (MQ=255)
cgcAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAg < 3:251295/151‑1 (MQ=255)
cgcAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAg < 2:1396279/151‑1 (MQ=255)
gcAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAg > 1:1455462/1‑150 (MQ=255)
gcAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGt < 2:642759/151‑1 (MQ=255)
cGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTc > 1:271998/1‑151 (MQ=255)
gTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTc > 2:108221/1‑150 (MQ=255)
gTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTc > 1:274668/1‑150 (MQ=255)
gCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCAc < 2:1246147/150‑1 (MQ=255)
ggacggaAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCgg < 1:474657/151‑1 (MQ=255)
gacggaAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGc > 1:888098/1‑151 (MQ=255)
ggaAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGAt > 3:36215/1‑151 (MQ=255)
gaAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGAtc > 4:7028/1‑151 (MQ=255)
aaaaTGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGAtct < 1:830519/151‑1 (MQ=255)
tgtgTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCt > 2:688045/1‑151 (MQ=255)
tgtgTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCt > 1:82046/1‑151 (MQ=255)
gtgtCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCTCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCt < 1:860547/150‑1 (MQ=255)
gtCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTAc > 1:541828/1‑150 (MQ=255)
ccGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATg < 4:555789/117‑1 (MQ=255)
ccGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATg > 3:555809/1‑117 (MQ=255)
ccGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTcc < 2:1530880/151‑1 (MQ=255)
aaCACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGt < 4:802/151‑1 (MQ=255)
aaCACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGt < 1:1573168/151‑1 (MQ=255)
cacaGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGa < 2:539875/151‑1 (MQ=255)
cacaGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGa < 1:197882/151‑1 (MQ=255)
cacaGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCAATGCGCTAGCAGCTATCAAAAATAGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGGACCACGATGCCTCAGAAGGGCTCAACGGCGATCTCCATACTCCg > 1:438448/1‑147 (MQ=255)
caGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGaa > 1:495570/1‑150 (MQ=255)
caGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGaa > 3:157769/1‑150 (MQ=255)
aGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGTAAt < 2:615214/151‑1 (MQ=255)
aGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAAt < 2:615258/151‑1 (MQ=255)
tttGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATa < 1:1045488/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACtt > 2:45890/1‑151 (MQ=255)
tGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGAATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATGTCCCTACTCCGGGGAAATACtt > 1:1723038/1‑151 (MQ=255)
cAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCa < 2:1120112/151‑1 (MQ=255)
gTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAAtt < 2:1562140/151‑1 (MQ=255)
tAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTc > 1:937268/1‑151 (MQ=255)
aGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTc < 1:858335/150‑1 (MQ=255)
aGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCg < 2:933734/151‑1 (MQ=255)
tGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAAt > 1:840816/1‑151 (MQ=255)
ggTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATc > 2:1428609/1‑151 (MQ=255)
cGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGc > 1:1468987/1‑150 (MQ=255)
gCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTc > 2:557836/1‑151 (MQ=255)
cATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAgg < 3:401085/151‑1 (MQ=255)
gcgcTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAg > 1:385286/1‑150 (MQ=255)
cgcTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTa < 2:319172/151‑1 (MQ=255)
ggCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACa < 1:1592547/149‑1 (MQ=255)
ggCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAg < 3:475690/151‑1 (MQ=255)
aGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCt > 3:324684/1‑151 (MQ=255)
gCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCTCCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCt < 1:1020305/150‑1 (MQ=255)
aTCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTAtt < 3:99409/150‑1 (MQ=255)
tCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCTCGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCt > 1:1245816/1‑146 (MQ=255)
tCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTg > 2:735568/1‑150 (MQ=255)
cAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGa < 2:930882/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCGAAAATTTGGCGGGAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGTTCACCGGCGATCTTCTTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAAACGCTCTGGAGTACAACGCTa > 1:1403638/1‑144 (MQ=255)
aaaTCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGaaaaa < 2:1422279/151‑1 (MQ=255)
cGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCg < 1:373740/151‑1 (MQ=255)
cGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCg < 2:817985/151‑1 (MQ=255)
cGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCg > 3:12574/1‑151 (MQ=255)
gAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGc > 1:968041/1‑151 (MQ=255)
gAAAATTTGGCGGCAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATAGCTCAGGTGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGc > 1:206052/1‑151 (MQ=255)
aaaTTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCt > 1:277235/1‑150 (MQ=255)
aaaTTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTc > 1:1594954/1‑151 (MQ=255)
aaaTTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTc < 2:1477455/151‑1 (MQ=255)
aTTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGCGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTc > 1:902086/1‑149 (MQ=255)
aTTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTc > 4:552911/1‑149 (MQ=255)
aTTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAg < 1:1686093/151‑1 (MQ=255)
tttGGCGGTAATGTCAACTCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGAAGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCa > 1:1333813/1‑149 (MQ=255)
ggCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCaaa < 2:222522/151‑1 (MQ=255)
gCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCaaaa < 2:943252/151‑1 (MQ=255)
gCGGTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCaaa > 1:167704/1‑150 (MQ=255)
ggTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAAc > 4:445801/1‑151 (MQ=255)
gTAATGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACt > 3:336630/1‑151 (MQ=255)
aaTGTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTg < 2:227504/150‑1 (MQ=255)
gTCAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTc < 3:65992/150‑1 (MQ=255)
cAACGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGat > 1:1417975/1‑151 (MQ=255)
aCGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGatat < 1:687945/151‑1 (MQ=255)
cGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATg < 2:1367158/151‑1 (MQ=255)
cGCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATg < 2:1395243/151‑1 (MQ=255)
gCCGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATgg > 4:399199/1‑151 (MQ=255)
ccGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATGGt < 2:506946/151‑1 (MQ=255)
ccGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATGGt < 1:224132/151‑1 (MQ=255)
cGAGCGTATCGCTTTACTGGCGATGTTCCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAAACGCTCAGGAGTACAAGGCTATGGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATGGtt < 2:438520/151‑1 (MQ=255)
|
CCCGCCTGAAACTCATTAACCGCTGGCCGCTCATGCGCAACGTGCGGACGGAAAATGTGTCCGAACACAGTTTGCAGGTAGCGATGGTCGCCCATGCGCTGGCAGCTATCAAAAATCGAAAATTTGGCGGTAATGTCAACGCCGAACGTATCGCTTTACTGGCGATGTACCACGATGCCTCAGAAGTGCTCACCGGCGATCTCCCTACTCCGGTGAAATACTTCAATTCGCAAATCGCTCAGGAGTACAAGGCTATTGAAAAAATCGCTCAGCAAAAACTGGTCGATATGGTT > NC_000913/2408893‑2409185
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
